Fragment basert drug design identifiserer lavmolekylære molekyler, som gjør viktige interaksjoner med sine mål bindingssetet. Denne høye atom effektivitet treff benyttes for videre optimalisering til mer verdifulle og mer komplekse blyforbindelser. Preferansen for fragmentbasert konstruksjon sammenlignet med andre metoder, slik som high throughput screening, hviler i stor grad med den forbedrede screening av et mer imponerende konformasjonell plass med et mindre start antall forbindelser. Dermed Fragment basert drug design øker hemmere mangfold plassen effektivt. Det første trinnet i Fragment basert drug design er å få en god fragment library.OTAVA har sin egen spesialdesignede Fragment Bibliotek for å gi kjemiske fragmenter som kan bli utgangspunkt for narkotika discovery.This fragment bibliotek byggingen ble utført ved hjelp av strenge strukturelle, substructural og spesial medisinske kjemi filtre. Dette Otava 抯 Fragment Bibliotek, bestående av ca 6514 forbindelser har blitt utviklet basert på allment akseptert regel-of-Three. Forbindelser ble filtrert på molekylvekt (MW -5) (høy vandig oppløselighet er viktig av praktiske grunner i løpet av screening særlig i HCS). Strukturell filtrering ble brukt for utelukkelse fra Fragment bibliotek forbindelser som inneholder funksjonalitet som kan føre til uønskede effekter som for eksempel kreft, giftighet, adme problemer og falske positiver. Også fra fragment bibliotek ble fjernet forbindelser med reaktive funksjonelle grupper som bærer risikoen for kovalent binding til målproteinet, og forbindelser som ikke inneholder minst én alifatisk eller aromatisk ring, eller inneholdende en hvilken som helst atom forskjellig fra O, N, C, H, Br, i, Cl, F, S, eller P.The Otava fragment bibliotek jevnlig oppdatert for nye fragmenter. Siste versjon av biblioteket beskrivelse er tilgjengelig på nettstedet vårt på fragment bibliotek siden. Fragment bibliotek og andre sammensatte biblioteker fra Otava er tilgjengelig på forespørsel som MDL struktur-datafiler (SDfiles) eller ISIS Database (db) filer. Alle forbindelser fra Otava Fragment Bibliotek er på lager, i mengder minimum 20 mg. Fragment bibliotek forbindelser kan velges individuelt basert på kundens 抯 kriterier. Otava Fragment Biblioteket har blitt utviklet for å møte behovene til våre kunder som er ute etter forhåndsvalgte fragment produkter i legemiddelforskning.
