PLoS ONE: IL1 reseptorantagonist Gene IL1-RN Variabel Antall Tandem Gjentar Polymorphism og kreftrisiko: en litteraturgjennomgang og Meta-Analysis

Abstract

IL1 reseptor antagonist (IL1RA) og IL1beta (IL1β), medlemmer av det pro-inflammatoriske cytokin interleukin-1 (IL1) familien, spiller en mulig rolle mot infeksjon og i patogenesen av kreft. Den variabelt antall tandem repetisjoner (VNTR) polymorfisme i andre intron av IL1 reseptor antagonist genet (

IL1-RN

) og en polymorfisme i ekson 5 av

IL1B product: (

IL1B

+ 3954C T, rs1143634) har blitt foreslått i predisposisjon for kreftrisiko. Men studier har vist sprikende resultater. For å validere noen tilknytning, ble en meta-analyse utført med 14,854 saker og 19,337 kontroller fra 71 publiserte kasus-kontrollstudier for

IL1-RN

VNTR og 33 kvalifiserte studier inneholdt 7,847 tilfeller og 8917 kontroller for

IL1B

3954. Odds ratio (ORS) med 95% konfidensintervall (CIS) ble beregnet ut fra sammenligninger for å vurdere styrken av foreningen. Det var signifikant sammenheng mellom

IL1-RN

VNTR polymorfisme og risiko for kreft for noen generell sammenligning. Videre krefttype lagdeling analyse viste at det var signifikant økt risiko for magekreft, blærekreft og andre kreft grupper. Infeksjon status analyse indikerte at

H. pylori

eller HBV /HCV-infeksjon og

IL1-RN

VNTR genotyper var uavhengige faktorer for å utvikle magesår eller hepatocellulær kreft. I tillegg ble det observert en border signifikant sammenheng mellom

IL1B

3954 polymorfisme og økt kreftrisiko. Selv om noen beskjedne skjevhet ikke kan elimineres, foreslo denne meta-analysen at

IL1-RN

VNTR polymorfisme kan bidra til genetisk mottakelighet for magekreft. Flere studier er nødvendig for å ytterligere evaluere rollen som

IL1B

3954 polymorfisme i etiologien av kreft

Citation. Zhang Y, Liu C, Peng H, Zhang J, Feng Q ( 2012) IL1 Receptor Antagonist Gene

IL1-RN

variabelt antall Tandem Gjentar Polymorphism og kreftrisiko: en litteraturgjennomgang og Meta-Analysis. PLoS ONE 7 (9): e46017. doi: 10,1371 /journal.pone.0046017

Redaktør: Masaru Katoh, National Cancer Center, Japan

mottatt: 03.04.2012; Godkjent: 27 august 2012; Publisert: 25.09.2012

Copyright: © Zhang et al. Dette er en åpen-tilgang artikkelen distribueres under betingelsene i Creative Commons Attribution License, som tillater ubegrenset bruk, distribusjon og reproduksjon i ethvert medium, forutsatt den opprinnelige forfatteren og kilden krediteres

Finansiering:. Denne studien ble finansiert av tilskudd fra samfunnsutviklingen teknologi Prosjekter av Kunshan City, Kina (KS1145, KS1248, KS1259). Finansiører hadde ingen rolle i studiedesign, datainnsamling og analyse, beslutning om å publisere, eller utarbeidelse av manuskriptet

Konkurrerende interesser:.. Forfatterne har erklært at ingen konkurrerende interesser eksisterer

Innledning

Interleukiner (ILs) er pro-inflammatoriske cytokiner produsert av monocytter, makrofager og epitelceller. Interleukin-1 (IL1) familie består av cytokiner IL1alpha (IL1α), IL1beta (IL1β) og en spesifikk reseptor antagonist (IL1RA) [1]. Genene som koder denne familien er avbildet på kromosom 2q14 [2] og omfatter tre beslektede gener,

IL1A

,

IL1B Hotell og

IL1-RN

, som koder IL1α, IL1β og IL1RA hhv.

IL1B

kan spille en viktig rolle i den kreftfremkallende prosessen. Flere

IL1B

genet enkeltnukleotidpolymorfi har blitt beskrevet å være assosiert med kreft hittil [3]. Tidligere har vi rapportert polymorfisme i formidler av

IL1B product: (

IL-1B

-31T C, rs1143627) var en lav-pene beskyttende faktor for utvikling av kreft [4] . I tillegg er en polymorfisme i ekson 5 av

IL1B product: (

IL1B

+ 3954C T, rs1143634) har vist seg å påvirke

IL1B

genuttrykk [5] og til være forbundet med forekomst av kreft [6], [7]. IL1RA binder kompetitivt til IL1 reseptorer med IL1α og IL1β. Naturlig forekommende anti-inflammatorisk IL1RA er en 16 til 18 kD protein som konkurrerer med binding av IL1 til sin reseptor. I det andre intron av det

IL1-RN

genet, eksisterer det et variabelt antall tandemrepetisjoner (VNTR) med en 86 basepar nukleotidsekvens som dens gjenta element. Denne regionen inneholder tre potensielle proteinbindingsseter: et interferon α lyddemper A, et interferon β lyddemper B og en akutt fase respons element, og dermed kan være av funksjonell betydning [8]. Det er blitt rapportert at disse tre bindingssteder påvirke kontrollen av celleproliferasjon aktivitet, noe som resulterer i potensiell regulering av IL1RA produksjon [5], [8]. El-Omar et al. [9] først rapportert positiv sammenheng mellom magekreft risiko og disse VNTR polymorfismer i

IL1-RN

. En annen studie viste at

IL1-RN

VNTR genotyper ble sterkt korrelert med cellular funksjon. IL-1RN alleler ble kodet som tidligere beskrevet: allel 1, fire gjentagelser; allel to, to gjentar; allel tre, fem gjentar; allel fire, tre repetisjoner og allelet fem, seks repetisjoner.

IL-1RN

alleler ble videre delt inn i to kategorier: lang genotype (L: inkludert alleler 1, 3, 4 og 5) og kort genotype (2: allele bare 2). Genotypene ble klassifisert som LL, 2L, og 22 [10].

Et stort antall av genetisk mottakelighet studier har blitt gjennomført for å undersøke assosiasjoner mellom

IL1B

3954 og

IL1-RN

polymorfisme og kreft i ulike vev opprinnelse, men inkonsistente resultater er oppnådd. Disse inkonsistente funnene kan være forårsaket av en rekke faktorer, for eksempel heterogenitet av kreft subtype, begrenset utvalgsstørrelse, og gen-miljø interaksjoner. For å vurdere videre og bekrefte tilknytningen av

IL1B

3954 og

IL1-RN

VNTR polymorfisme med kreftrisiko, en omfattende gjennomgang og analyse av publiserte data fra ulike studiegrupper er stort behov for. I denne studien har vi omfattende anmeldt litteratur og utført en meta-analyse basert på alle kvalifisert case-control publiserte data for å vurdere sammenhengen mellom

IL1B

3954 og

IL1-RN

VNTR polymorfisme og kreft mottakelighet.

Materialer og metoder

Identifikasjon av utvalgte studier

Vi søkte PubMed og Embase databaser for alle relevante rapporter (oppdatert til 23 mai 2012) ved ved hjelp av stikkord «interleukin-1-reseptor antagonist», «IL1», «polymorfisme «, eller» kreft «. Søket ble begrenset til engelskspråklige aviser og menneskelige fagstudiene. I tillegg ble det studier identifisert ved et manuelt søk i referanselistene av anmeldelser og hentet studier. Når mer enn en av samme eller overlappende populasjoner ved hjelp av forskjellige undersøkere eller overlappende data av de samme forfattere ble funnet, ble bare den siste eller fullstendig undersøkelse brukes for dette meta-analyse. Studier, uavhengig av størrelsen på utvalget, ble inkludert hvis de oppfylte følgende kriterier: (i) studien var av

IL1B

3954 og

IL1-RN

VNTR polymorfisme og kreftrisiko, ( ii) det var en case-control designet studie og (iii) den inneholdt tilgjengelige genotypefrekvensene (figur S1).

data~~POS=TRUNC Extraction

To personer (Ying Zhang og Changming Liu) hentet alle data uavhengig samsvar med utvalgskriteriene. For hver studie, ble følgende egenskaper hentet: den første forfatterens etternavn, årstall, opprinnelsesland, etnisitet, matchende antall genotypet saker og kontroller, kilden til kontrollgrupper (population- eller sykehusbaserte kontroller), genotyping metoder og krefttype. Ulike etniske utforkjøringer ble kategorisert som kaukasiske, asiatisk eller blandet, som omfattet mer enn en etnisk herkomst. En studie inkluderte informasjon for genotyper av LL /2L og 22, uten data for LL og 2L genotyper, så vi var bare i stand til å beregne OR for sammenligningen mellom alleler 2 og L [11]. I tillegg ble smittestatus i saker og kontroller i de registrerte studier også hentet for

IL1-RN

VNTR subgruppeanalyse.

Statistical Analysis

IL1B

3954 og

IL1-RN

VNTR polymorfismer ble testet for foreninger med kreft mottakelighet basert på ulike genetiske modeller. Den meta-analyse undersøkt den samlede tilknytning til

IL1B

3954 og

IL1-RN

VNTR polymorfisme med risikoen for kreft målt ved odds ratio (ORS) med 95% konfidensintervall (CIS ). Til kontrast villtype homozygot (

IL1B

+ 3954-CC eller

IL1-RN

-L /L), må vi først beregnet risikoen for

IL1B

+ 3954 -CT, -TT og

IL1-RN

-2 /L, -2/2 genotyper på kreft, vurderes da risikoen for kreft under en dominerende modellen (

IL1B

3954: T /T + C /T versus CC;

IL1-RN

: 2/2 + 2 /l versus l /l). I tillegg ble det recessive modell foreninger også estimert (

IL1B

3954: T /T versus C /C + C /T;

IL1-RN

: 2/2 versus L /L + 2 /l). Stratifiserte analyser ble også utført av etnisitet (Asiatisk, og Mix), krefttyper (hvis bare en krefttype som finnes færre enn tre enkeltstudier ble kombinert i den «andre kreftgruppen), dessuten ble subgruppeanalyse båret av infeksjonsstatus for

IL1-RN

VNTR polymorfisme

den statistiske betydningen av den samlede OR ble bestemt med Z-test, en p-verdi. 0,05 ble betraktet som signifikant. Den heterogenitet mellom studiene ble evaluert av chi-square basert Q statistisk test [12], ble heterogenitet betraktet som signifikant for P 0,05. Et fast-effekt modellen ved hjelp av Mantel-Haenszel metode og en tilfeldig effekt-modellen ved hjelp av DerSimonian og Laird metode ble brukt til basseng resultatene [13]. Den tilfeldig effekt modellen ble brukt når det var heterogenitet i resultatene fra studiene; ellers ble den faste virkning modell som brukes. Følsomhetsanalyser ble utført for å vurdere stabiliteten av resultatene, nemlig en enkelt studie i meta-analyse ble slettet hver gang for å reflektere påvirkning av de enkelte datasettet til den samlede OR. For å teste for publikasjonsskjevhet, Trakt tomter og Egger lineære regresjon test ble brukt [14].

Alle statistiske tester for meta-analyse ble utført med Stata versjon 10.0 (Stata Corporation College Station, TX), og SAS (versjon 9.1, SAS Institute, Cary, NC).

Resultater

Kjennetegn ved Studies

for

IL1-RN

VNTR polymorfisme, totalt av 71 utvalgte studier møtte de forhåndsinnstilte inklusjonskriterier, der 14,854 tilfeller og 19,337 kontroller ble inkludert for den samlede analysen (tabell S1). Alle studiene var kasus-kontrollstudier, inkludert 37 studier på magekreft, seks på leverkreft, fire på livmorhalskreft, 4 på brystkreft, fire på lungekreft, og 16 på de kategoriseres i andre kreftformer. Det var 40 studier av asiatiske etterkommere, 29 av kaukasiske etterkommere og to med blandet etnisitet [15], [16]. Kreft ble diagnostisert histologisk eller patologisk i de fleste studier. For å analysere den VNTR i den andre intron i

IL1-RN

, polymerase kjedereaksjon (PCR) ble utført i de fleste studiene, ble direkte sekvensering brukt av to studier [17], [18], og den denaturerende høy væskekromatografi (DHPLC) ble påført i en studie [19]. I tillegg er de fleste av kontrollene var sex-og alderstilpasset for saksgruppene, hvorav 49 var befolkningen basert og 22 ble sykehusbaserte. I tillegg 20 studier undersøkt samspillet mellom polymorfisme og

helicobacter pylori product: (

H. Pylori

), hepatitt B-virus (HBV) eller hepatitt C virus (HCV) infeksjon status.

for

IL1B

3954 polymorfisme, 33 kvalifiserte studier inneholdt 7,847 saker og 8,917 kontroller ble registrert for den sammenslåtte risikoanalyse (tabell S2). Blant de 33 studiene, 14 studier diskutert risikoen for magekreft, 3 studiene diskutert risikoen for kreft i munnhulen, 3 studier fokusert risikoen for lungekreft, og 13 studier kategorisert på annen kreft. Det var 14 studier av asiatiske etterkommere, 18 studier av kaukasiske etterkommere, og en studie med blandet etnisitet.

Kvantitativ Synthesis

For

IL1-RN

VNTR polymorfisme, en betydelig forskjellen på

IL1-RN

-2 allelfrekvenser på tvers av ulike etnisiteter ble observert. Hyppigheten av to allel var 11,14% (95% KI: 8,25 til 14,04) blant asiatiske kontroller, som var betydelig lavere enn i kaukasiske kontroller (26,05%; 95% CI: 23,41 til 28,69,

P

0,001), som vist i figur 1. Totalt, ble en signifikant allelisk forening observert i hele studien settet (2 versus L: OR = 1,23, 95% CI: 1,10-1,38, tabell 1). Når gruppert etter krefttyper, ble signifikant sammenheng likevel funnet i magekreft (2 versus L: OR = 1,20, 95% KI: 1,05 til 1,38,

P

heterogenitet 0,001), annet kreft gruppe ( 2 kontra L: OR = 1,54, 95% KI: 01.12 til 02.13,

P

heterogenitet = 0,000). I genotypisk analyse ble signifikante assosiasjoner funnet i magekreft (2L versus LL: OR = 1,22, 95% KI: 1,05 til 1,41,

P

heterogenitet 0,001; 2L + 22 versus LL: OR = 1,25, 95% KI: 1,09 til 1,43,

P

heterogenitet 0,001), annet kreft gruppe (2L versus LL: OR = 1,31, 95% KI: 1,00 til 1,72,

P

heterogenitet = 0,000; 2L + 22 versus LL: OR = 1,54, 95% KI: 01.12 til 02.11,

P

heterogenitet = 0,000). I motsetning til den økte risikoen for

IL1-RN

polymorfisme for kreft, ble en redusert risiko også observert i brystkreft (2L versus LL: OR = 0,74, 95% KI: 0,58 til 0,93,

P

heterogenitet = 0,844; 2L + 22 versus LL: OR = 0,78, 95% KI: 0,62 til 0,97,

P

heterogenitet = 0,632). Betydelig økt risiko ble også observert i etnisiteter subgruppe analyse. For asiatisk ethnicity, var det en signifikant sammenheng i sammenligningen av 2L versus LL (OR = 1,20, 95% KI: 1,01 til 1,42,

P

heterogenitet 0,001), 22 + 2L versus LL ( OR = 1,25, 95% KI: 1,03 til 1,52,

P

heterogenitet 0,001) og allel to kontra L (OR = 1,21, 95% KI: 1,00 til 1,47, Z = 1,96,

P

= 0,05,

P

heterogenitet 0,001). En signifikant assosiasjon ble også observert i sammenligningen av 22 + 2L versus LL (OR = 1,21, 95% KI: 1,07 til 1,36,

P

heterogenitet 0,001) og to kontra L (OR = 1,22 , 95% KI: 1,07 til 1,40,

P

heterogenitet 0,001) i kaukasisk etnisitet. I tillegg avslørte to studier med blandet etnisitet data økt risiko ved bruk av sammenligninger av 2L kontra LL og 22 + 2L versus LL (2L versus LL: OR = 1,65, 95% CI: 1.17-2.33,

P

heterogenitet = 0,096; 22 + 2L versus LL: OR = 1,57, 95% KI: 01.13 til 02.19,

P

heterogenitet = 0,110). Undergruppeanalyse bestemt av kilden for kontroll viste en signifikant sammenheng mellom

IL1-RN

VNTR polymorfisme og kreftrisiko, med unntak av sykehus baserte styringer for sammenlikning av 22 versus LL (2L versus LL: OR = 1,17, 95% KI: 1,04 til 1,32,

P

heterogenitet = 0,000; 22 + 2L versus LL: OR = 1,21, 95% KI: 1,07 til 1,36,

P

heterogenitet = 0,000; LL + 2L versus 22: OR = 1,36, 95% KI: 1,01 til 1,84,

P

heterogenitet = 0.000) og populasjonsbaserte kontroller for sammenligning LL + 2L versus 22 (22 versus LL: OR = 1,45, 95% KI: 1,06 til 1,41,

P

heterogenitet = 0,000; 2L versus LL: OR = 1,19, 95% KI: 1,04 til 1,37,

P

heterogenitet = 0,097; 22 + 2L versus LL: OR = 1,30, 95% KI: 1,12 til 1,51,

P

heterogenitet = 0,000) sammenfattet i tabell 1.

Star eller dot betegner uteliggere. Frekvensen av to allel (Y-aksen) i asiatiske kontrollene var lavere enn i kaukasiske kontroller (P = 0.000).

For

IL1B

3954 polymorfisme, border vesentlige risiko foreninger ble observert i samlet analyse for sammenligning av TT versus CC (OR = 1,17, 95% KI: 1,00 til 1,37, Z = 1,94,

P

= 0,053,

P

heterogenitet = 0,155), TT + CT versus CC (OR = 1,15, 95% KI: 1,00 til 1,34, Z = 1,97,

P

= 0,049,

P

heterogenitet = 0.000) og TT versus CT + CC (OR = 1,16, 95% KI: 1,00 til 1,35, Z = 1,99,

P

= 0,049,

P

heterogenitet = 0,488) i tillegg subgruppeanalyse viste det lignende foreninger i de befolkningsbaserte studier (TT versus CC: OR = 1,22, 95% KI: 1,00 til 1,49, Z = 1,95,

P

= 0,051,

P

heterogenitet = 0,885; TT + CT versus CC: OR: 1,21; 95% KI: 1,00 til 1,47, Z = 1,91,

P

= 0,056,

P

heterogenitet = 0,000). Krefttype subgruppeanalyse viste signifikant sammenheng for kreft i munnhulen (CT versus CC: OR = 0,65, 95% KI: 0,45 til 0,94; T /T + C /T versus CC: OR = 0,69, 95% KI: 0,49 til 0,98,

P

= 0,049), i motsetning, ble signifikant sammenheng observert i andre kreftgruppen (TT versus CC: OR = 1,51, 95% CI: 01.11 til 02.04; TT versus CT + CC: OR = 1,3, 95 % KI: 1,06 til 1,75) sammenfattet i tabell 2.

IL1-RN VNTR Polymorfisme og h.pylori, HBV /HCV infeksjon Status

genotype fordelingen av

IL1-RN

VNTR genotype blant sakene og infeksjonskontrollpersoner var tilgjengelig i tjue studier som undersøkte magekreft infisert av

H. pylori Hotell og leverkreft smittet av hepatitt B eller hepatitt C virus. Bærere av to allelet hadde høyere kreftrisiko enn de med

IL1-RN-

L allelet blant magekreft studier, og de subgruppeanalyse resultatene viste at L allele er en risiko for magekreft uavhengig av

H.pylori

infeksjon. Det var imidlertid ingen sammenheng mellom

IL1-RN

VNTR polymorfisme og kreftrisiko i hepatocellulær kreft studier som vist i Tabell 3.

Test av heterogenitet

For

IL1-RN

VNTR og

IL1B

3954 polymorfisme, var det betydelig heterogenitet på tvers av studiene. For dette ble kilden til heterogenitet undersøkt for heterozygote sammenligning (CT versus CC) av krefttype, etniske og kilde av kontroller. Kreft type (χ2 = 8.9, df = 3,

P

= 0,031), etnisitet (χ2 = 13,87, df = 2, p = 0,01) og kilde til kontroller (χ2 = 10,25, df = 2,

P =

0,006) bidro til heterogenitet. I tilsvarende, for

IL1-RN

VNTR polymorfisme, Cancer type (χ2 = 52,17, df = 6,

P

= 0,000), men ikke etnisitet (χ2 = 5,63, df = 2,

P

= 0,060) eller kilde av kontroller (χ2 = 0,42, df = 1,

P

= 0,518) bidro vesentlig til at heterogenitet.

Følsomhetsanalyse analyse~~POS=HEADCOMP viste at ti [ ,,,0],20], [21], [22], [23], [24], [25], [26], [27], [28], [29] og fire [30], [31], [32 ], [33] uavhengige studier var den viktigste årsaken til heterogenitet for

IL1-RN

VNTR og

IL1B

3954, henholdsvis. Den heterogenitet ble redusert ved disse studiene ble fjernet (

IL1-RN

VNTR 2L versus LL:

P

heterogenitet = 0,065,

I

2 = 22,6%;

IL1B

3954 CT versus LL:.

P

heterogenitet = 0,097,

jeg

2 = 26,4%)

publikasjonsskjevhet

Begg trakten tomten og Egger test ble utført for å vurdere publikasjonsskjevhet av tiden tilgjengelig litteratur. Formen på trakt tomter viste ingen bevis for åpenbar asymmetri i alle sammenligning modeller. Deretter ble Egger test anvendes for å tilveiebringe statistisk bevis for trakt plott symmetri. Resultatene fortsatt ikke viser noen tegn på publikasjonsskjevhet (

IL1-RN

VNTR:

t

= 1,84,

P

= 0,071 for 2L versus LL, figur 2;

IL1B

3954.

t

= 0,82,

P

= 0,420 for CT versus CC, figur 3)

hver sirkel betegner en uavhengig studie for den angitte foreningen. Logg [OR], naturlig logaritme av OR. Horisontal linje står for gjennomsnittlig effektstørrelse.

CT versus CC. Hver sirkel betegner en uavhengig studie for den angitte foreningen. Logg [OR], naturlig logaritme av OR. Horisontal linje står for gjennomsnittlig effektstørrelse.

Diskusjoner

I denne meta-analysen, VNTR polymorfisme i intron 2 av

IL1-RN

var assosiert med økt risiko for å utvikle kreft av interesse. Resultater fra stratifisert analysene av krefttype indikerte at 2L genotype var assosiert med økt risiko for magekreft, og med økt kreft i asiatiske populasjoner. Infeksjon status analyse indikerte at to allel var en risiko allel for magekreft uavhengig av

H. pylori

status, men ikke leverkreft med HBV eller HCV-infeksjon. For

IL1B

3954 polymorfisme border betydelig risiko Foreningen ble observert for kreftrisiko.

I denne studien, denne meta-analysen indikerte en signifikant sammenheng av

IL1-RN

VNTR polymorfisme med magekreft, men ikke med brystkreft, hepatocellulær kreft, livmorhalskreft eller lungekreft. Våre resultater antydet at

IL1-RN

VNTR polymorfisme kan spille ulike roller i patogenesen av ulike krefttyper. Våre funn støttes av bevis for at immunresponsen er avgjørende for magekreft utvikling. Det har blitt vist 86 bp VNTR polymorfisme av

IL1-RN

har potensielle roller i reguleringen av immunresponsen.

IL1-RN

-2 allel hadde et høyt sirkulerende IL1RA nivå og en enda mer opphøyd IL1β nivå [34]. Binding av IL1RA til IL1 reseptor inhiberte IL1-mediert signalisering, som resulterer i en forsterket og forlenget inflammatoriske respons [35]. Videre El-Omar et al. fant at mage kreftrisiko genotyper

IL1-RN

-2/2 ble assosiert med redusert syreutskillelse kapasitet [5]. Xue et al. rapportert

IL1-RN

-2 allel var forbundet med en økt risiko for å utvikle magekreft, og enda mer betydelig med noncardia magekreft eller med intestinal-type magekreft [36], angitt

IL1-RN

VNTR polymorfisme forbundet med ulike kreftrisiko i henhold til undergrupper av magekreft og histologiske typer. Videre Wang et al. [37] har også avdekket at

IL1-RN

-2 allel var forbundet med en økt risiko for magekreft blant kaukasiere. Interessant, i kreft subtype analyse, observerte vi at vognen av allel 2 ble funnet å virke som en beskyttende faktor for risiko for brystcancer (tabell 1). Våre funn var ikke i samsvar med noen tidligere rapporter, som angitt i fl ammatory svar er kanskje ikke den viktigste faktoren for patologi av brystkreft [38], [39], [40]. Imidlertid har andre studier antydet betennelsesreaksjon var nært knyttet til brystkreft. Det har vist seg at IL1β kan kombinere med østrogen reseptor-alfa, noe som resulterer i forbedring av transkripsjonelle aktivering i brystkreftceller [41]. Videre har det vært ansett at høye nivåer av IL1β i perifert blod er kjent for å øke nivået av leptin [42], som korrelerer med totalt kroppsfett og stimulerer veksten av brystepitel [43], [44], [45] .

Det er allment kjent at

H. pylori

spiller viktige roller i patologi av magekreft [46]. Tilsvarende HCV og HBV er involvert i patologi av leverkreft [47]. Det er viktig å utføre GXE analyse for å evaluere

IL1-RN

VNTR polymorfi effekter for magekreft og leverkreft. Våre resultater viste at det var ingen interaksjoner mellom

IL1-RN

VNTR polymorfisme og

h.pylori

infeksjon i magekreft, noe som tyder på at risikoen for å utvikle magekreft gitt av

h.pylori Hotell og

IL1-RN

VNTR genotyper kan være uavhengige. Dette kan skyldes ulike patogeneserelaterte mekanismer underliggende

h.pylori

-negativ magekreft i motsetning til

h.pylori

-positivt magekreft [48]. De tilsvarende resultater ble også rapportert av Wang et al. [37].

IL1β er godt kjent for å være en pro-in fl ammatory faktor og formidle flere immunresponser hos HCV-infeksjon [49]. Flere uavhengige studier gitt bevis for assosiasjoner mellom kronisk hepatocellulær kreft og kronisk HCV eller HBV-infeksjon [50]. Men våre resultater fra HBV /HCV-infeksjon matchet studier som har vist negativ interaksjon mellom

IL1-RN

VNTR polymorfisme og HBV /HCV-infeksjon i predisposisjon for hepatocellulære kreft. Flere studier er nødvendig for å ytterligere vurdere rollen til denne polymorfisme i virusinfiserte hepatocellulære kreft.

IL1B

3954 polymorfisme er en koding synonymt variant ligger i ekson 5 av

IL1B

. Overgangen fra cytosin til tymin forandrer ikke aminosyresekvensen som koder men kan føre til en inaktivering av den opprinnelige spleisedonorsete. De alternative spleise resulterer i en for tidlig stoppkodon eller exon hoppe og frembringer et avkortet protein som er sannsynlig å være hurtig nedbrytes eller funksjonelt inaktivt [51].

IL1B

3954 polymorfisme har blitt rapportert å påvirke produksjonen av IL-1β protein [5], [51]. Meta-analyseresultater avslørt

IL1B

3954 hadde en border signifikant sammenheng med økt kreftrisiko. De samlede resultatene ble påvirket av individuelle studier, derfor flere studier bør kumuleres å vurdere rollen til den

IL1B

3954 polymorfisme i etiologien av kreft.

Selv om metaanalyser er robuste har vår studie fortsatt noen begrensninger. For det første har de fleste av de utvalgte studiene fokusert på magekreft. Den relativt lite utvalg av studier i andre stratifisert grupper kan føre til redusert statistisk styrke. For det andre, selv om alle kvalifiserte studier ble oppsummert, den totale utvalgsstørrelsen kanskje ikke har vært nok til å gjøre en overbevisende konklusjon. Når ble utført stratifisert analyse av tumor type, etnisitet eller smittestatus, antall hver undergruppe var mindre. Tredje, vår meta-analysen inkluderte ingen vurdering av mulige gen-gen-interaksjoner og begrenset gen-miljø interaksjoner på grunn av mangel på relevante publiserte data. Fordi kreft er en kompleks sykdom, kan genetiske faktorer spiller en begrenset effekt på patogenesen av kreft. I resultatene av vår nåværende meta-analyse,

IL1-RN

VNTR hadde bare moderat genetisk mottakelighet effekter (ORS mindre enn 2). Flere studier på store gen-gen og gen-miljø interaksjoner er nødvendig for å ytterligere evaluere og belyse menneskelig genetisk predisposisjon for ulike kreftformer.

I konklusjonen, tyder dette meta-analyse at

IL1- RN

VNTR polymorfisme kan bidra til en genetisk disposisjon for magekreft, som er nært beslektet til den immunologiske respons.

IL1B

3954 har en border signifikant sammenheng med økt kreftrisiko. Flere studier er nødvendig for å ytterligere evaluere rollen som

IL1B

3954 polymorfisme i etiologien av kreft.

Hjelpemiddel Informasjon

Figur S1.

Process studie utvalg av case-kontrollstudier

doi:. 10,1371 /journal.pone.0046017.s001 plakater (TIF)

Tabell S1.

Oppsummering av publiserte studier inkludert for

IL1-RN

VNTR i dag meta-analyse studie

doi:. 10,1371 /journal.pone.0046017.s002 plakater (DOC)

Table S2.

Oppsummering av publiserte studier inkludert for

IL1B + 3954

i dag meta-analyse studie

doi:. 10,1371 /journal.pone.0046017.s003 plakater (DOC)

Legg att eit svar