Abstract
Bakgrunn
CHL1
genet (også kjent som
CALL
) på 3p26.3 koder for et one-pass trans-membrancelle adhesjonsmolekyl (CAM). Tidligere CAM av denne typen, inkludert L1, ble vist å være involvert i kreft vekst og metastasering.
Metodikk /hovedfunnene
Vi brukte Clontech Kreft Profilering Arrays (19 forskjellige typer kreft, 395 prøver) for å analysere uttrykk for
CHL1
genet. Resultatene ble ytterligere validert ved RT-qPCR for brystkreft, nyre og lungekreft. Kreft Profilering Arrays avslørte differensial uttrykk av genet: nedregulering /stanse i et flertall av primære svulster og oppregulering assosiert med invasiv /metastatisk vekst. Hyppig nedreguleringen (mer enn 40% av tilfellene) ble påvist i 11 typer kreft (bryst, nyre, rektum, tykktarm, skjoldbruskkjertelen, mage, hud, tynntarmen, urinblæren, vulva og pankreaskreft) og hyppig oppregulering ( 40% av tilfellene) – i 5 typer (lunge, eggstokk, livmor, lever og luftrør) kreft. Ved hjelp av real-time kvantitativ PCR (RT-qPCR) fant vi at
CHL1
uttrykk ble redusert i 61% av brystkreft, 60% av lunge, 87% av klarcellet og 89% papillær nyrekreftprøver (
P
0,03 for alle tilfeller). Det var en overhyppighet av
CHL1
mRNA reduksjon i lunge plateepitelkarsinom i forhold til adenokarsinom (81% vs. 38%,
P
= 0,02) uten tilknytning til tumorprogresjon.
Konklusjon /Betydning
Våre resultater antydet at
CHL1
er involvert i utviklingen av ulike kreft hos mennesker. Innledningsvis i løpet av primærtumorvekst
CHL1
kunne fungere som en antatt tumor suppressor og blir brakt til taushet for å legge til rette for
in situ
tumorvekst for 11 krefttyper. Vi foreslo også at re-uttrykk av genet på kanten av tumormasse kan fremme lokal invasiv vekst og muliggjøre ytterligere metastatisk spredning i eggstokk, tykktarm og brystkreft. Våre data støttes også rollen
CHL1
som en potensielt ny spesifikk biomarkør i tidlig patogenesen av to store histologiske typer nyrekreft
Citation. Senchenko VN, Krasnov GS, Dmitriev AA, Kudryavtseva AV, Anedchenko EA, Braga EA, et al. (2011) ulike uttrykk av CHL1 Gene under utvikling av store menneske Kreft. PLoS ONE 6 (3): e15612. doi: 10,1371 /journal.pone.0015612
Redaktør: Chad Creighton, Baylor College of Medicine, USA
mottatt: 11. august 2010. Godkjent: 17 november 2010; Publisert: 07.03.2011
Copyright: © 2011 Senchenko et al. Dette er en åpen-tilgang artikkelen distribueres under betingelsene i Creative Commons Attribution License, som tillater ubegrenset bruk, distribusjon og reproduksjon i ethvert medium, forutsatt den opprinnelige forfatteren og kilden krediteres
Finansiering:. Dette arbeidet ble støttet med tilskudd 08-04-01577 og 10-04-01213 fra den russiske Foundation for Basic forskning; State Kontrakter 02.740.11.5227 og 16.740.11.0173 med det russiske departementet for utdanning og vitenskap; tilskudd fra det svenske Kreftforeningen, Vetenskapsrådet, det svenske instituttet og Karolinska Institutet og National Cancer Institute, Senter for Cancer Research, utført Research Program av NCI. Finansiører hadde ingen rolle i studiedesign, datainnsamling og analyse, beslutning om å publisere, eller utarbeidelse av manuskriptet
Konkurrerende interesser:.. Forfatterne har erklært at ingen konkurrerende interesser eksisterer
Innledning
kreft-assosiert gener faller inn i to hovedkategorier: kreftfremkallende gener som driver malign transformasjon og vedlikeholde tumorvekst og kreft progresjon gener som arrangerer lokale invasjonen og videre spredning av metastatiske celler og vekst av fjernmetastaser [1 ], [2], [3].
CHL1
gen – nær homolog av L1, også kjent som
CALL
– celle adhesjon L1-lignende (GenBank aksesjonsnr NM_006614.2) koder for et one-pass trans-membran celle adhesjon molekyl (CAM) i stand til både homotypisk og heterotypic binding. Proteinet kodet for av dette genet er et medlem av familien av L1 genet neural celleadhesjonsmolekyler. Det er en neural erkjennelse molekyl som kan være involvert i signaloverføringsreaksjonsveier.
CHL1
blir uttrykt i normale vev i tillegg til hjernen og uttrykkes i en rekke humane kreftcellelinjer og primære tumorvev [4], [5]. Det ble også vist at genet er involvert i de generelle kognitive aktiviteter (g /IQ) [6], [7] og enkelte nevrologiske sykdommer (dvs. schizofreni [8]). Sletting av en kopi av dette genet kan være ansvarlig for psykiske defekter hos pasienter med 3p- syndrom. Nylig flere CAM inkludert L1 ble vist å være involvert i kreftvekst og metastase [9], [10].
CHL1
ligger på 3p26, en region som er vist til båtplass en kandidat for prostatakreft mottakelighet i finske prostatakreft familier, selv om ingen mutasjoner ble oppdaget i kodingen delen av genet [11]. Dermed disse rapportene tyder på at
CHL1
spiller en rolle i utviklingen av kreft [12], ikke bare i nevrale aktiviteter. Tidligere i samarbeid med Dr. Helen S. Smith, vi utført en sletting kartlegging av den korte arm av kromosom 3 på et panel av brystkreft og avgrenset tre regioner som skjuler brystkreft kandidat tumorsuppressorgener (TSG), nemlig 3p24- 26, 3p21-22, og 3p12-13 [13], [14], [15], [16]. Da vi klonet
CHL1 (CALL)
genet i 1997/1998 og analysert dens uttrykk i mus utvikling og utført omfattende bioinformatikk analyse [5].
Her tilbyr vi en omfattende studie av
CHL1
mRNA uttrykk ved hjelp av to metoder. Kvalitativ analyse ble utført ved hjelp Clontech Cancer Profilering Arrays, og videre sanntid kvantitativ PCR (RT-qPCR) ble ansatt for validering av microarray data for tre store krefttyper: ikke-småcellet lungekreft (NSCLC), brystkreft (BC) og nyrecellekarsinomer (RCC). Våre resultater antydet en dobbel rolle i
CHL1
i tumorigenesis: det kan bidra til innledende tumorvekst og deretter til progresjon og til slutt tumor spredning /metastase. Dataene videre støttet rollen som
CHL1
som en potensielt ny spesifikk biomarkør i tidlig patogenesen av to store histologiske typer nyrekreft.
Arbeidet er dedikert til minne om Dr. Helen S. Smith.
Resultater
i silico
analyse av CHL1 uttrykk i normale og tumorvev
De aller offentlig uttrykk databaser tillater å oppdage og kvantifisere ekspresjonen av de fleste om ikke alle kjente RefSeq gener (~20,000) hos normale og tumorvev. Vi brukte flere offentlige web-baserte servere for å analysere mus og menneske
CHL1
uttrykk [17], [18], [19], [20]. Dataene viser at
CHL1
er uttrykt i mange normale voksne og føtale vev i tillegg til hjernen og perifere nervesystemet [17], [19]. Variable uttrykk ble sett i mange svulster; Det var spesielt høy i en melanomcellelinje G361. Ifølge Oncomine [18] foreløpige data basert på microarray analyse,
CHL1
uttrykk varierer også i flere store krefttyper – renal [21], [22], cervical [23], tykktarm [24], [ ,,,0],25], eggstokk [26], lunge [27], [28], mage [29] og bryst [30], [31] kreft. Den Oncomine viste også co-uttrykk for
CHL1
med en annen kjent kreft metastaseassosierte genet, lysyl oxidase (
LOX
) [32] i metastatisk melanom.
Undersøkelse av CHL1 uttrykk med kreft Profilering Arrays
Vi brukte Cancer Profilering Arrays i og II (Clontech) for å teste
CHL1
uttrykk i et stort utvalg av humane primære tumorer inkludert bryst, lunge, nyre, eggstokk , tykktarm, mage og andre (fig. 1). Kun 395 prøver av 486, inkludert 90 metastatiske svulster og 12 metastaser var informativ. Vi viste først at endringen av
CHL1
ekspresjon i alle undersøkte tumorer sammenlignet med matchede ikke-kreft (normale) vev var statistisk signifikant (
P
0,05, Fisher eksakte test eller χ
2-kriterier)
brukte forkortelser. ADC – adenokarsinom, ASC – adenosquamous karsinom, BAC – bronchiolo-alveolar adenokarsinom, C – karsinom, CAC – cystadenocarcinoma, CC-ADC – klarcellet adenokarsinom, EDST – endodermal sinus tumor, ENB – epitel nefroblastom, ESS – endometrial stromal sarkom, FAC – follicular adenokarsinom, FS – fibrosarkom, I-DC – infiltrere ductal carcinoma, I-IDC – infiltrere intraductal carcinoma, I-LC – infiltrere lobular karsinom, LC – lobular karsinom, LDC – mixed lobular-ductal carcinoma, LM – leiomyoma, M – malignt melanom, MAC – mucinous adenokarsinom, MBC – mucinous border karsinom, MC – medullær karsinom, MMMT – ondartet blandet Mullerian svulst, NI-IDC – noninfiltrating intraductal carcinoma , PAC – papillær adenokarsinom, PC – papillær karsinom, PSC – papillær serøs karsinom, PSCA – papillær serøs cystadenoma, PSCAC – papillær serøs cystadenocarcinoma, RCC – nyrecellekarsinom, S – seminom, SC – serøs karsinom, SCAC – serøs cystadenocarcinoma, SCC – plateepitelkarsinom, TAC – rørformet adenokarsinom, TC – rørformet karsinom, TCC – overgangsordning celle carcinoma, UBT – livmor godartet svulst. Stjerner (*) viser prøver med metastaser. ** G361 – en melanom-cellelinje. Eske prøvene indikerer en tilpasset normal (venstre) – primærtumor (nederst til høyre) par med en tilhørende metastatisk prøve (øvre høyre hjørne av en boks). T – tumorprøver; N – matchet normale kontrollprøver
Nedregule
Som vist i Cancer Profiling Arrays data i figurene 1 og 2, vises en høy prosentandel av pasienter som en nedregulering av..
CHL1
ekspresjon i bryst, nyre, rektum, tykktarm, skjoldbruskkjertelen, mage, hud, tynntarmen, urinblæren, vulva og kreft i bukspyttkjertelen. Resultatene av den mikroarray data-analyse ble presentert for 11 typer kreft i tabell 1. I alt en statistisk signifikant reduksjon av
CHL1
ekspresjon ble funnet i brystkreft – 71% (45 av 63 tilfeller), tykktarm – 48% (23 av 48), rektum – 50% (14 av 28), skjoldbruskkjertelen – 69% (11 av 16), nyre – 75% (21 av 28) og tynntarmen – 67% (6 av 9) cancere . Viktigere var en statistisk signifikant økning av nedregulering frekvens er vist på prøver med metastaser sammenlignet med prøver uten metastaser i tykktarmen (83% vs. 36%,
P
= 0,01) og endetarmen (75% vs. 31 %,
P
= 0,05) kreft. Den samme tendensen ble funnet i eggstokk kreft (60% vs. 19%,
P
= 0,17).
Andel av svulster med
CHL1
oppregulering er vist med rød, nedregulering – grønn, mRNA nivå oppbevaring – gul. Data viste med Clontech Microarray analyse. Stjerne (*) viser statistisk signifikante forskjeller mellom frekvenser av
CHL1
uttrykk endrer seg med opp- og nedregulering.
Up-regulering.
CHL1
oppregulering (frekvens fra 20% til 100%) ble funnet i lunge, eggstokk, livmor, lever, hud, prostata, mage, livmorhals og trachea kreft. Men økningen av
CHL1
mRNA nivået var statistisk signifikant bare i lungekreft -64% (16 av 25
P
0,01). De fleste av disse tilfellene (14 av 22, P 0,01) ble funnet i forskjellige histotypes av NSCLC (ADC, BAC, SCC) på Stage I. Også vi observerte flere tilfeller av
CHL1
oppregulering i metastatiske svulster (mage, lunge, luftrør, eggstokk og livmor, tabell 1). Dermed tilfellene med
CHL1
oppregulering kan tjene som eksempler på
CHL1
engasjement både i første og muligens i ytterligere progresjon og invasive tumorvekst.
Deregulering.
i livmor og eggstokk kreft hyppigheten av opp- og nedregulering var tett (41% og 30%, 46% og 27%, respektivt). I eggstokk kreft nedregule var en utbredt hendelse (52%) i prøver uten metastaser, tvert imot oppreguleringen var utbredt (60%) i gruppen av metastatiske svulster. I magekreft en statistisk signifikant endring av
CHL1
uttrykk (både opp- og nedregulering) ble vist i gruppen med metastaser i forhold til gruppen uten metastaser (88% vs. 45%,
P
= 0,02).
metastaser.
Vi observerte nytt uttrykk for
CHL1
i 4 av 12 metastaser (første koordinere) sammen med lav
CHL1
mRNA nivå i primærtumor (andre koordinere): i eggstokk (24K /24L), kolon (14O /14P, 14V /14W) og bryst (4I /4J, fig 1, Array jeg.). I tillegg har vi også funnet stanse av genekspresjonen i både metastasering og primære tumorer, for eksempel brystkreft (4G /4H, 4K /4L).
Den CHL1 ekspresjon i bryst, lunge og nyrecancer vev studert ved hjelp av RT-qPCR
CHL1
mRNA innholdet ble redusert i de fleste undersøkte tumorprøver sammenlignet med normale prøver, men i enkelte tumorprøver
CHL1
uttrykk var opp -regulated (fig. 3. A, B og C).
A. Den relative
CHL1
mRNA nivå (R) i brystkreft (BC). N
0 – uten metastaser, N
1-2 – metastaser i regionale lymfeknuter. Prøver # 1, 2 (Stage I), # 3-22 (trinn II), # 23 (Stage IV); Prøvene # 3-9 (grad 1), # 10-21 (grad 2). B. Den relative
CHL1
mRNA nivå (R) i lungekreft (NSCLC). SCC – lunge plateepitelkarsinom, ADC – lunge adenokarsinomer, N – normale prøver fra kreft gratis friske donorer; N
0 – uten metastaser, N
1-2 – metastaser i regionale lymfeknuter; I, II og III – Stages. C. Den relative
CHL1
mRNA nivå (R) i nyrekreft (RCC). CC-RCC – klare cellenyre karsinom, pRCC – papillær nyre karsinom; N
0 – uten metastaser, N
1-2 – metastaser i regionale lymfeknuter; I, II og III -. Stages
Brystkreft (BC)
Vi fant at
CHL1
mRNA nivået ble redusert i 61% (14 av. 23,
P
0,03), økte i 22% (5 av 23) og ikke er endret i 17% (4 av 23) av prøvene. Maksimal reduksjon av
CHL1
mRNA nivået var 20 ganger, maksimal økning var 34 ganger. Det var ingen tydelig sammenheng mellom endring av
CHL1
uttrykk og tumorprogresjon (Fig. 3 A).
Ikke-småcellet lungekreft (NSCLC).
CHL1
mRNA nivået ble redusert i 60% (18 av 30, P 0,02) og var vanlig i 33% (10 av 30), dvs. mindre enn to-fold endringer. Nedgangen eller økning av mRNA nivået ble påvist verken i lunge ikke-kreft (normal) matchet vev eller i vev fra kreft gratis friske donorer. Men for to histologiske subtyper av NSCLC (ADC og SCC) frekvensen til de mRNA endringene var forskjellig. Nedreguleringen ble observert i 38% (5 av 14) av ADC prøver. Økningen av
CHL1
mRNA (7 ganger) ble påvist kun i en ADC prøve. Tvert imot, i SCC prøvene
CHL1
uttrykk ble betydelig redusert i 81%, (13 av 16
P
0,02).
LD plakater (nivået av mRNA reduksjon) varierte 2-100 ganger i ADC og 2-44 ganger i SCC. Det var en mer betydelig økning av
FD plakater (hyppighet av mRNA reduseres) verdier i SCC, sammenlignet med ADC (81% vs. 38%,
P
= 0,02) uten merkbar forbindelse med svulst progresjon (fig. 3, B og tabell 2).
Slett nyrecellekarsinom (CC-RCC), papillær nyrecellekreft (pRCC) og nyrekreft cellelinjer.
En betydelig reduksjon (3-302 ganger) av
CHL1
mRNA ble påvist i 87% (26 av 30
P
0,01) av CC-RCC prøver og 89% (8 av 9,
P
0,02). av pRCC eksemplarer med
LD
av plakater (geometrisk gjennomsnitt av LD) lik 18 og 19 ganger henholdsvis (figur 3, C). Derfor kan vi konkludere med at frekvensen og gjennomsnittlig nivå av
CHL1
uttrykk nedgang var lik for to store histologiske typer nyrekreft, CC-RCC og pRCC.
LD
av
verdi var betydelig i alle RCC svulster på alle utviklingsstadier uavhengig av metastase nærvær (tabell 3). I CC-RCC med eller uten metastaser,
FD Hotell og
LD
av
verdier var like.
De estimater av
CHL1
mRNA-nivåer i syv nyrecancercellelinjer viste sterk nedregulering av dette gen: 80-fold (Caki2, KRC /Y), omtrent 1000 ganger (TK164) og total lyddemping (TK10, KH39, OPPOVER Hn4, Caki1, fig. 4).
mRNA nivået av målet genet ble normalisert til referanse gener
RPN1 Hotell og
GUSB
.
Sammenligning av mikromatriser og RT-qPCR data for brystkreft, nyre og lungekreft
De microarray data for 61 f.Kr., 23 RCC og 25 NSCLC prøvene ble sammenlignet med RT-qPCR data for 23 f.Kr., 30 CC-RCC og 30 NSCLC prøver. I vårt utvalg studien en signifikant
CHL1
nedregulering ble vist for de fleste av RCC prøver; oppregulering ble observert i kun 3 tilfeller. Våre resultater viste også at nedregulering av
CHL1
i de fleste av BC prøvene uavhengig av nærvær av metastaser og opp-regulering i 7 tumorer kun. Nesten de samme resultater ble oppnådd ved å bruke RT-qPCR. Det var likheter mellom matrise og kvantitative data for nyre- og brystkreft (tabell 4)
Kreft Profilering Arrays I og II har en svært heterogen gruppe av lungekreft med ulike histologiske undergrupper:. BAC, ADC, SCC, karsinoid med Stage i og II, bare to metastatiske svulster og begrenset antall eksemplarer av hver subtype. Totalt var det 15 SCC og 5 ADC som vi kan sammenligne med RT-qPCR data. Vi fant en oppregulering i 11 SCC (6 av 11 ble identifisert som Stage I) og fire ADC (3 ADC var Stage jeg i tillegg); ned-regulering i to SCC (13%) og en ADC (25%, fig. 1). Nylig viste vi en oppregulering av flere TSG på 3p i lunge ADC på Stage I. Disse svulstene var preget med høy differensiering klasse [33]. På den annen side, i henhold til RT-qPCR data Hyppigheten av redusert ekspresjon var 38% (5 av 14 tilfeller) i ADC og 81% (13 av 16 tilfeller, P 0,02) i SCC (se tabell 2). En oppregulering ble påvist kun i 7% (1 av 14 tilfeller) ADC og aldri i SCC.
Diskusjoner
CHL1
, som ligger på 3p26.1, tilhører til den familie av celleadhesjonsmolekyler (CAM) – celleoverflateproteiner som formidler celle-celle og celle-matriks-interaksjoner. Endringer i CAM uttrykket (inkludert
CHL1
) og funksjoner har vært implisert i utviklingen av forskjellige tumortyper, for eksempel melanom [34], eggstokk [9], [35], prostata [11] og tykktarmskreft [36]. Ifølge [9], evaluering av LOH mønstre i serøs ovarialcancer (EOC) foreslo at
CHL1
er en tumor suppressor kandidat (TSG). De publiserte av oss og andre forfattere (se Innledning) studier antydet at
CHL1
genet kan være en av de antatte tumorsuppressorgener lokalisert på menneskelig kromosom 3 [12]. Men overekspresjon av
CHL1
ble observert i serøs EOC prøvene [9]. Videre ble L1 CAM overekspresjon i malignt melanom er vist å være assosiert med metastase [34].
I henhold til Oncomine foreløpige microarray ekspresjonsdata [17] sammen med den rådende
CHL1
ned-regulering i flere tumorer (RCC, lunge SCC, tykktarm ADC), ble overekspresjon av CHL1 funnet i melanom. Differensial uttrykket ble observert i lungen ADC [26], cervical [22] og bryst [29], [30] kreft.
Basert på disse dataene, vi hypotese at CHL1 og andre anerkjennelse reseptorer av denne typen makt har to roller i kreft: tidlig pre-invasiv vekst kan de tjene som TSG og er brakt til taushet; senere på invasjon og metastase iscenesetter disse genene kan bli re-uttrykkes på kanten av svulsten til å drive lokal invasjon og aktivere metastatisk spredning.
Denne hypotesen ble analysert i denne studien ved hjelp av en kombinasjon av foreløpige uttrykk screening i 19 forskjellige typer epiteltumorer med kommersielle mikromatriser (til sammen 395 informative prøver, Tabell 1) og evaluering av
CHL1
mRNA uttrykk i primære svulster ved hjelp av RT-qPCR. Denne metoden er mye brukt for å underbygge sykdomsassosierte uttrykk signaturer avledet fra mikromatriser. Videre er denne teknologien godt egnet for å oversette mikromatriser data til nøyaktige og kvantitative, klinisk nyttige analyser [37].
Vi viste her at uttrykket av
CHL1
ble deregulert i store epiteliale maligniteter ( 76%,
P
0,01, inkludert 54% ned-regulering tilfeller i henhold til microarray data). Statistisk signifikant
FD
verdier ble vist for bryst, tykktarm, rektum, skjoldbruskkjertelen, nyrene og tynntarm kreft (Tabell 1). For tre sosiale betydelige /viktige krefttyper – bryst, nyre og lunge microarray data ble validert ved RT-qPCR. Det var en god overensstemmelse mellom dataene på to måter for å nyre og brystkreft. Ifølge Oncomine microarray data til betydelig reduksjon av
CHL1
uttrykk nivå i CC-RCC prøvene ble vist i tillegg.
Clontech Mikromatrise (overekspresjon i 64% lungekreft prøver) og RT-qPCR ( nedregulering i 38% av ADC og i 81% av SCC prøver) ikke var i enighet fordi ulike kreft subtyper var til stede i studerte microarray samplings. Den uenighet mellom rekker og RT-qPCR data for NSCLC kan også resultere fra ikke-homogene prøver med forskjellig innhold av normale celler, så vel som begrenset antall prøver og kan være statistisk ikke-signifikant. . Selv om disse dataene ikke er statistisk gyldig de kunne reflektere viktige trender og foreninger
Men det var en ganske god overensstemmelse mellom våre kvantitative resultater for lungekreft og Oncomine data [17] for to store lungekreft histotypes – ADC og SCC.
Det er viktig å merke seg at Oncomine utnytter mikromatriser basert på helt annen plattform enn Clontech Cancer Profiling Arrays. Tradisjonelle mikromatriser (Affymetrix, Agilent) inneholder en rekke ulike gener immobilisert på glassplater. Bare én cDNA prøven kan hybridisert med raset. Tvert imot, Clontech Cancer Profiling Arrays inneholde en rekke immobiliserte cDNA-prøver fra forskjellige tumor og normalt vev. Oncomine inkluderer tradisjonelle mikromatriser data gjør mulig genom-wide analyse av et begrenset antall prøver og kreft Profilering Arrays muliggjøre analyse av ett gen i mange svulster i ett eksperiment.
Ifølge Clontech Microarray data, mRNA nivå økning ble observert for flere tumortyper – livmor, eggstokk, tarm, mage, skjoldbruskkjertel, lunge, nyre, og trachea – hovedsakelig for ikke-metastatiske tumorer. Men det var også hyppige tilfeller av
CHL1
mRNA nivå økning i metastatiske svulster, for eksempel i mage og lungekreft.
Videre i fire metastaser (4i, 14O, 14V, 24K ) av 12 er tilgjengelig for analyse tilfeller (dvs. når en primærtumor og metastaser for samme pasient var tilgjengelig) vi har oppdaget en økt
CHL1
uttrykk i metastaser i forhold til primærtumor (eggstokk, tykktarm og bryst). Lignende resultater ble nylig rapportert for metastaseassosierte genet lysyl oxidase (
LOX
), hvis uttrykket var forbundet både med svulst undertrykkelse og tumorprogresjon avhengig transformasjon status [32]. Overekspresjon av en annen celle adhesjonsmolekyl L1 genet ble assosiert med metastaser i malignt melanom [34].
Kreft er en dødelig sykdom der invasiv lokal tumorvekst og metastatisk spredning til fjerne vitale organer som resulterer i en hvileperiode og /eller aktiv vekst og uunngåelige død av pasientene. I motsetning til tidligere modeller nye bevis antydet at metastatiske celler kan bli opprettet allerede i løpet av første veksten av en primær lokal svulst. Disse cellene deretter lykkes i celle migrasjon /invasjon, embolisering, overlevelse i sirkulasjon, arrest i en fjern kapillær seng, og bloduttredelse inn og multiplikasjon innenfor den fjerne organ parenchyma. Svikt i en hvilken som helst av disse trinnene kunne blokkere hele metastatisk prosessen og kan lede til «hvilende kreftceller og hvilende mikrometastaser». Kirurgisk fjerning av den primære tumoren kan da føre til aktiv vekst [38]. Ettersom tumorspredning er ansvarlig for de fleste dødsfall av kreftpasienter, utvikling av terapeutiske midler som hemmer tumormetastase er av største viktighet [39], [40], [41], [42], [43], [44] [45], [46], [47].
en av oss spådd tidligere [5] at cytoplasma slutten av CHL1 protein kan samhandle med cytoskjelettet og kan indusere /regulere filopodia formasjon kjører svulst celle migrasjon og invasjon [41], [45], [46].
CHL1
atferd i kreft er derfor påfallende lik
L1 product: [10], [40] og
LOX
som både arbeid gjennom aktin nettverket.
Denne studien antydet at
CHL1
kan bidra til kreft invasiv vekst og metastasering. Det kan fungere enten som en tumor suppressor (tidlig vekst) eller onkogen (invasiv og metastatisk vekst, Fig. 1, tabell 1).
CHL1
derfor kunne tilhøre den nye raskt voksende kategorien av kreftgener som kan fungere enten som TSGs eller onkogener [32], [41], [43], [46], [47], [48] . Under første vekst
CHL1
er ikke uttrykt (silenced) i tumorceller til rette for
in situ
tumorvekst. Re-uttrykk for
CHL1
på kanten av tumormasse og rundt tumor fartøy kan fremme migrasjon og lokalt invasiv vekst og dessuten tillate initiering av metastatisk prosess. Dermed våre resultater sammen med de funn som
CHL1
var en mutert kandidat kreft-assosiert genet i tykktarmskreft [1] antydet at denne type anerkjennelse reseptorer kan faktisk ha to roller i kreftutvikling. Mutasjonene oppdaget i den ekstra-cellulære delen av
CHL1
hadde råd til en terapeutisk antistoff selektivt behandle pasienter [1]. Dette bekrefter
CHL1
som en roman mål for personlig immun intervensjon i kreft uttrykker mutert
CHL1
. Nye terapeutiske små hemmere rettet mot
CHL1
kan være effektive for å begrense ny svulstdannelse fra sovende mikrometastaser.
Våre resultater indikerer at
CHL1
genet kan være viktig for utviklingen store menneskelige kreftformer, og også lov til å foreslå en hypotese om en sannsynlig dobbeltrolle av
CHL1
, men bare for tre typer kreft (eggstokk, tykktarm og bryst) støttende data ble hittil oppnådd. En hyppig reduksjon av et uttrykk nivået var utbredt for 11 av 19 krefttyper og statistisk signifikant for bryst, tykktarm, endetarm, skjoldbruskkjertel, nyre og tynntarm kreft.
Våre data støtter også rollen som
CHL1
som en potensielt ny biomarkør i tidlig patogenesen av to store histologiske typer nyrekreft både CC-RCC og pRCC. Resultater avledet med 7 RCC cellelinjer foreslo dem som en potensiell modellsystem for studier av metylering rolle i
CHL1
lyddemping.
Materialer og metoder
Kreft profilering arrays analyse
Cancer Profiling Arrays i og II (154 og 241 prøver henholdsvis totale 19 forskjellige typer kreft nemlig, bryst, nyre, rektum, tykktarm, mage, hud, skjoldbruskkjertel, tynntarmen, urinblæren, vulva, bukspyttkjertel, prostata, cervix, testikler, lunge, ovarie, uterus, lever, luftrør) innkjøpt fra BD Biosciences Clontech (Palo Alto, CA), ble brukt til å analysere ekspresjonen av
CHL1
-genet i normale og tumorvev. Full sample informasjon for Array I og II er presentert i Clontech Catalog: Nei 7841-1 og henholdsvis nr 631777 (se «Arrays Informasjon S1»)
Vi analyserte bare informative prøver med klar forholdet mellom normal-. svulst ble intensitet. Informasjonen for prøver av Kreft Profilering Array Jeg er presentert under.
1. Bryst. De fleste av de tumorene infiltrerende duktal (DC), intraductal (IC) og lobular (LC) karsinomer. Stage I: 2Q, 2R, 2S, 2T, 2U, 4S, 4D, 4F. Stage II: 2W, 4E, 4L, 4N. Trinn III: 4A, 4B, 4H, 4J, 4M. Koordinater av 18 metastatisk (m) tumorer er 2B, 2C, 2D, 2E, 2 H, 2I, 2J, 2M, 2N, 2P, 4H, 4J, 4L, 4O, 4P, 4R, 4S, 4U. Koordinater til metastaser er 4G, 4I, 4K.
2. Livmor. De fleste av de svulstene er adenokarsinomer (ADC). Stage I: 8C, 8F, 8H, 8I, 8J, 8K, 8L, 8M, 8N, 8O, 8P, 8Q, 8R, 8S, 8U, 8X, 8Y, 8BB, 8CC, 8DD, 8EE, 8FF, 10A, 10B , 10C. Stage II: 8T. Koordinater til metastatiske svulster 8W og 8AA, Stage III. Koordinater til metastaser er 8V, 8Z.
3. Colon. Alle svulster er ADC. Stage I: 14L. Stage II: 14M, 14P, 14Q, 14AA. Stage III: 14S, 14U, 14V, 14Y, 14BB. Andre prøver har ingen informasjon om Stage. Koordinater til 9 metastatiske svulster er 14E, 14N, 14P, 14U, 14W, 14Y, 14CC, 16A, 16C. Koordinater til metastaser er 14O, 14T, 14V, 14X.
4. Mage. De fleste av de svulstene er ADC. Det er ingen informasjon om Stage. Koordinater til 11 metastatiske svulster er 20A, 20B, 20E, 20F, 20H, 20i, 20K, 20S, 20T, 20V, 20X.
5. Eggstokk. Stage I: 24B, 24D, 24E. Stage II: 24F. Stage III: 24A, 24G, 24H, 24J, 24L. De fleste svulster er ADC. Koordinater til metastatiske svulster er 24J, 24L, 24M, 24N. Koordinater til metastaser er 24I, 24K.
6. Livmorhalsen. 24X (adenosquamous karsinom).
7. Lunge. Stage I: 28E (plateepitelkarsinom, SCC), 28F (karsinoid), 28H (SCC), 28I (ADC), 28J (ADC), 28K (SCC), 28L (bronchiolo-alveolar adenokarsinom, BAC), 28M (SCC ), 28N (ADC). Ukjent Stage: 28A (SCC), 28B (BAC), 28C (SCC), 28D (SCC), 28G (SCC), 28O (m, ADC), 28p (m, BAC), 28Q (SCC), 28R (karsinoid ), 28S (ASC), 28T (SCC), 28U (SCC).
8. Nyre. Stage III: 32D (karsinoid). Ukjent Stage: 32A (klarcellet nyrecellekarsinom, CC-RCC), 32B (RCC), 32C (RCC), 32E (RCC), 32F (overgangsordning celle carcinoma), 32G (RCC), 32H (m, RCC), 32i (oncocytoma), 32j (RCC), 32K (RCC), 32L (m, RCC), 32M (RCC), 32N (m, RCC), 32O (RCC), 32P (RCC), 32Q (RCC), 32R (RCC), 32S (RCC), 32T (RCC).
9. Rektum. Alle svulster er ADC. Stage I: 36G. Stage II: 36J, 36F. Stage III: 36C, 36H, 36i, 36L. Koordinater til 6 metastatiske svulster er 36B, 36E, 36L, 36M, 36Q, 36R. Koordinere av metastaser er 36K.
10. Tynntarmen. 36Y (m, ADC), 36Z (ADC).
11. Skjoldbruskkjertelen. Alle svulster er papillær ADC, Stage II: 40D. Stage III. 40C, 40E
12. Prostata. Alle svulster er ADC. Stage jeg.: 40M
13. Bukspyttkjertelen. Ukjent Stage. 40U (ADC)
Informasjonen for prøver av Kreft Profilering Array II er vist nedenfor
1.. Bryst. Stage I: 6E (DC), 6G (mucinous ADC), 6M (DC). Trinn II: 6I (DC), 6K (m, DC), 6L (DC), 6N (DC). Stage III. 6F (m, DC), 6 H (m, DC), 6J (m, LC)
2. Livmor. Stage I: 6T (ADC), 6Z (SCC), 6BB (ADC). Stage II: 6X (SCC), 6AA (ADC). Ukjent Stage. 6V (SCC)
3. Eggstokk. Stage I: 10E (papillær serøs cystadenoma), 10K (mucinous cystadenocarcinoma). Stage II: 10I (ADC), 10J (leiomyoma). Stage III: 10G (ADC), 10H (CC-ADC), 10M (serøs overflate papillær karsinom), 10N (papillær serøs cystadenoma). Stage IV: 10L (ADC). Ukjent Stage. 10F (leiomyoma)
4. Livmorhalsen. Stage I: 10Z (ADC), 10AA (SCC), 10BB (SCC). Stage II: 10V (SCC). Stage III. 10S (m, SCC)
5. Colon. Stage I: 14E (tubulovillous adenom, andre svulster er ADC), 14F. Stage II: 14L. Stage III: 14H (m), 14I (m), 14J, 14K (m), 14M, 14N (m). Mage. .
