PLoS ONE: PSCA rs2294008 Polymorphism med økt risiko for kreft

Abstract

Bakgrunn

Publiserte data om sammenhengen mellom

PSCA

rs2294008 polymorfisme og kreftrisiko har innblandet noe svar. For å bestemme forholdet og til nettopp vurdere effekten størrelse estimat av foreningen, utførte vi en meta-analyse.

Metoder

Vi søkte publisert litteratur i Embase og PubMed databaser med søkeordene »

PSCA

«,» prostata stamcelle antigen «,» varianter «,» polymorfi «,» polymorfismer «, og» kreft «. En totalt 21 kvalifiserte artikler ble hentet frem, med 27, 197 krefttilfeller og 48, 237 kontroller.

Resultater

På hele, vi fant sammenhengen mellom

PSCA

rs2294008 polymorfisme og kreftrisiko var statistisk signifikant: TT vs CC: OR = 1,18, 95% CI, 1.10 til 1.27; TT + CT vs CC: OR = 1,08, 95% CI, 01.05 til 01.10; TT vs CT + CC: OR = 1,14, 95% CI, 01.07 til 01.21; T vs C: OR = 1,10, 95% CI, 01.06 til 01.14; CT vs CC: OR = 1,10, 95% CI, 01.06 til 01.13. Stratifisert analysene i krefttype og etnisitet viste lignende resultater.

Konklusjoner

Basert på statistiske bevis, kan vi trekke en konklusjon om at rs2294008 polymorfisme av PSCA genet er sannsynlig å spille en rolle i kreft carcinogenesen, spesielt i magekreft og blærekreft

Citation. Geng P, Li J, Wang N, Ou J, Xie G, Liu C, et al. (2015) PSCA rs2294008 Polymorphism med økt risiko for kreft. PLoS ONE 10 (8): e0136269. doi: 10,1371 /journal.pone.0136269

Redaktør: Masaru Katoh, National Cancer Center, JAPAN

mottatt: 5 mars 2014; Godkjent: 03.08.2015; Publisert: 26 august 2015

Copyright: © 2015 Geng et al. Dette er en åpen tilgang artikkelen distribueres under betingelsene i Creative Commons Attribution License, som tillater ubegrenset bruk, distribusjon og reproduksjon i ethvert medium, forutsatt den opprinnelige forfatteren og kilden krediteres

Finansiering: Dette arbeidet ble støttet av tilskuddet nummer 81272364 fra National Natural Science Foundation of China (til HJL). Finansiører hadde ingen rolle i studiedesign, datainnsamling og analyse, beslutning om å publisere, eller utarbeidelse av manuskriptet

Konkurrerende interesser:.. Forfatterne har erklært at ingen konkurrerende interesser eksisterer

Innledning

Genome-wide assosiasjonsstudier (GWAS) om årsaker til kreft har etablert mer enn 150 regioner forbundet med ulike spesifikke kreftformer. Funnene vellykket utvide dagens forståelse av karsinogenisitetsstudier mekanismer [1]. Gitt den funksjonelle betydning av genetisk polymorfisme i kreft initiering og progresjon, er det av stor betydning for ytterligere å utforske den underliggende patofysiologi av kreft på gennivå. Genetiske varianter, slik som endringer i rekkefølge og avvikende organisasjoner av det cellulære genomet som strekker seg fra enkelt-nukleotid-substitusjoner til brutto kromosom, føre til kreft dannelsen av biologisk regulering av en håndfull av molekylære aktiviteter.

Prostata stamcelle-antigen (

PSCA

), lokalisert på kromosom 8q24.2, er et 123-aminosyre-cellemembran-glykoprotein som hører til LY-6 /Thy-1 familie av celleoverflateantigener.

PSCA

ble rapportert som en celleoverflaten markør over-express i prostatakreftcellelinjer i forhold til normalt vev [2]. Høy uttrykk for

PSCA

er signifikant assosiert med ugunstige prognostiske funksjoner, inkludert Gleason score, sædvæske invasjon og kapsel engasjement [3], samt kreft alvorlighetsgrad og metastase [4]. I tillegg

PSCA

er oppregulert i flere solide tumorer (bukspyttkjertel, blære, nyrecellekarsinom og eggstokkreft mucinous) [2,5], og nedregulert i spiserøret kreft, magekreft og galleblæren carcinoma [ ,,,0],6-8]. Men det er ingen bevis for rollen som

PSCA

uttrykk i kreft kreft bortsett fra et forslag som uttrykk for

PSCA

varierer avhengig av mobilnettet sammenheng [5].

To siste GWAS basert på individer med forskjellig etnisk opprinnelse viste rs2294008 polymorfisme i

PSCA

er en betydelig risikofaktor for økt magekreft mottakelighet kaukasiske befolkningen [9], mens sykdommer magekreft risiko i asiatiske befolkningen [10 ]. rs2294008 polymorfisme i det første ekson av

PSCA

genet kan ha bemerkelsesverdig innflytelse på variasjonene i transkripsjonen aktivitet av et oppstrøms fragment av

PSCA product: [8]. Til dags dato, selv samler data har dokumentert sammenheng mellom

PSCA

rs2294008 polymorfisme og kreftrisiko, overbevisning om rollen til polymorfisme som en genetisk markør for kreftrisiko er fortsatt mangelfulle [9-14]. De fleste studiene fokusert på en enkelt type av cancer med en forholdsvis liten prøvestørrelse. Som et resultat av effektene av

PSCA

rs2294008 polymorfisme på kreftrisikoen kan være undervurdert og mindre pålitelig. I dette arbeidet derfor med sikte på å bestemme forholdet mellom

PSCA

rs2294008 polymorfisme og kreftrisiko og til nettopp vurdere effekten størrelse estimat av foreningen, vi utførte en meta-analyse ved hjelp av alle tilgjengelige publiserte data.

Materialer og metoder

Søkestrategi strategi~~POS=HEADCOMP

studier som undersøkte sammenhengen mellom

PSCA

rs2294008 polymorfisme og kreftrisiko ble grundig søkt i Embase og PubMed ved hjelp av følgende fag vilkår: «

PSCA

«, «prostata stamcelle antigen», «varianter», «polymorfi», «polymorfismer», og «kreft» av to uavhengige etterforskere. Ingen begrensninger på offentliggjøring språk eller et minimum antall personer ble definert for dette søket. Andre publiserte data ble identifisert ved gjennomgang av bibliografiske referanser som er oppført i hver hentet artikkelen.

inklusjons- og eksklusjonskriterier

For å minimere heterogenitet og tilrettelegge for en hensiktsmessig tolkning av funnene, har vi valgt studiene kvalifisert for denne meta-analyse basert på følgende kriterier: (a) vurderes sammenhengen mellom

PSCA

rs2294008 polymorfisme og kreftrisiko ved hjelp av en case-control design; (B) forut tilgjengelige frekvensen for hver genotype (CC, CT, TT) i begge tilfeller og kontroller for å beregne odds ratio (ORS) og tilsvarende 95% konfidensintervall (CIS). I en sak som en og samme sak serien ble senere brukt i en ny artikkel, vurderte vi det største. Studiene ble ekskludert hvis de var. Anmeldelser, lederartikler, kommentarer eller dyrestudier

Data utvinning

Det er disse ble gjennomført av to uavhengige etterforskere ansvarlig for litteratursøk. Informasjonen som samles inn skjema hver publikasjon var som følger: første forfatternavn, utgivelsesår, studielandet, etnisk opprinnelse av de inkluderte fag (kaukasiske eller asiatiske), metoder utført for genotyping, kilde av kontroller (sykehus eller populasjonsbasert) type kreft, totalt antall tilfeller og kontroller, og hyppigheten av

PSCA

rs2294008 genotyper mellom saker og kontrollpersoner. En konsensus på den utpakkede elementer ble nådd ved diskusjon mellom de to etterforskerne.

Statistisk analyse

For å kunne vurdere sammenhengen mellom

PSCA

rs2294008 polymorfisme og kreftrisiko, ORS og tilsvarende 95% CI’er ble oppsummert for hver undersøkelse i TT vs CC, TT + CT vs CC, TT vs CT + CC, T vs C og CT vs CC-modeller. Subgruppe analyse ble utført i henhold til etnisitet og kreft type (magekreft, blærekreft og andre når vedkommende med mindre enn tre studier).

Heterogenitet er graden av variasjoner mellom resultatene mellom ulike studier som inngår i en samme meta analyse. Chi-kvadrat basert Q-test ble vedtatt å oppdage heterogenitet på tvers av studier i denne meta-analysen.

P

0,10 ble ansett som statistisk signifikant. I dette tilfellet ble de sammenslåtte ORS beregnet av den tilfeldige effekter modellen (Der Simonian og Laird) [15]; ellers ble den faste effekter modellen (Mantel-Haenszel metode) benyttes [16].

Følsomhetsanalyse ble utført for å identifisere studien som påvirket homogenitet av de inkluderte studiene når betydelig heterogenitet ble indikert. Hardy-Weinberg likevekt (HWE) i kontrollgruppen ble undersøkt ved chi-kvadrat-test. Publikasjonsskjevhet ble undersøkt av to brukte analyseverktøy: trakt tomt og Egger lineære regresjon test [17]

De statistiske analysene for denne studien ble gjort ved hjelp av Stata (versjon 12.0, StataCorp LP, College Station. , TX, USA). Alle testene var tosidig og signifikansnivå ble opprettholdt på

P

. 0,10

Resultater

Study utvalg

Vi har fått 535 artikler som samsvarer med fag begrep som brukes i søkestrategi. Etter gjennomgang av sine titler og sammendrag, vi valgte 30 artikler i fulltekst for valgbarhet evaluering. Blant disse ble ni endelig slettet av ulike grunner, inkludert utilstrekkelige data [18-22], artikler [23,24], med ingen kontroll befolkningen [25] og forskning irrelevant for tiden studert polymorphism [26]. Derfor ble 27, 197 krefttilfeller og 48, 237 kontroller fra 21 artikler med 24 studier inkludert i denne meta-analyse [4,8-14,27-39] (Fig 1).

kjennetegn på inkluderte studiene

De grunnleggende egenskapene til alle inkluderte studiene er oppført i tabell 1. totalt tjuefire studiene var kvalifisert for denne meta-analysen, hvorav åtte var for europear fag og seksten for asiatiske fag. Det var store forskjeller i litteraturen med hensyn til antallet av deltakere i hver studie, varierende 77-5, 303 i tilfelle gruppe og 200-16, 567 i kontrollpopulasjon. Bare to studier merkelig fra p-verdiene av HWE [10,33]

PCR-RFLP. Polymerase chain reaction-rflp; PCR-LDR: PCR-ligation påvisningsreaksjon; DHPLC: denaturerende væskekromatografi med høy ytelse; AS-PCR: allel-spesifikk PCR; SNP: enkeltnukleotidpolymorfi, PB: befolkningsbaserte studier; HB:. Sykehus-baserte studier

Kvantitativ syntese

Ved å samle alle kvalifiserte studier i ett stort datasett, har vi funnet sammenheng mellom

PSCA

rs2294008 polymorfisme og kreft risikoen var statistisk signifikant. Foreningen dukket opp mer uttalt hos TT vs CC og TT vs CT + CC: OR = 1,18, 95% CI, 1.10 til 1.27 (figur 2); OR = 1,14, 95% CI, 01.07 til 01.21, henholdsvis. Vi registrerte også en moderat økning ved bruk av TT + CT vs CC (OR = 1,08, 95% CI, 01.05 til 01.10) (figur 3), T vs C (OR = 1,10, 95% CI, 01.06 til 01.14), og CT vs CC (OR = 1,10, 95% CI, 01.06 til 01.13) (tabell 2).

for hver studie, estimatene for OR og dens 95% KI ble plottet med en boks og en horisontal linje. Symbolet fylt diamant indikerer slått sammen OR, og dens 95% CI. Tilfeldige effekter meta-analysen viser en signifikant sammenheng.

For hver studie, estimatene for OR og dens 95% KI ble plottet med en boks og en horisontal linje. Symbolet fylt diamant indikerer slått sammen OR, og dens 95% CI. Faste effekter meta-analysen viser en signifikant sammenheng.

P, p-verdi av Q test for heterogenitet.

Stratifisering analyser for ulike krefttypen viste tilsvarende økt risiko i mage kreft og blærekreft. Når stratifisering befolkningen i henhold til etnisitet, både asiatiske og kaukasiske populasjoner indikerte en tendens til en økning i risikoen for kreft (tabell 2).

Heterogenitet og sensitivitetsanalyser

På grunn av betydelig heterogenitet på tvers studier (TT vs CC:

P

= 0,007; TT vs CT + CC:

P

= 0,029; T vs C:

P

= 0,007), sensitivitetsanalyse av å gjenta den meta-analyse mens utelatelse av hver studie, en om gangen, ble utført for å identifisere kilden. Resultatene viste Matsuo et al. [27] gjort store bidrag til den bemerkelsesverdige heterogenitet. Utelukkelsen av denne studien dramatisk redusert heterogenitet (TT vs CC:

P

= 0,440; TT vs CT + CC:

P

= 0,710; T vs C:

P

= 0,245). Men de samlede resultatene ble ikke statistisk påvirket av eksklusive hver undersøkelse, herunder studiet i uenighet med HWE. Disse data antydet at resultatene er stabile og robuste.

publiseringsskjevheter

Begg trakten tomten og Egger test ble benyttet for å bestemme publikasjonsskjevhet i denne meta-analysen. Det var ingen åpenbar asymmetri angitt i tomter. Egger test også støttende bevis for noen betydelig publikasjonsskjevhet i meta-analyse (Begg:

P

= 0,442; Egger:

P

= 0,316; modell: TT + CT vs CC) ( fig 4).

Hvert punkt representerer et individuelt studium for den angitte foreningen.

Diskusjoner

PSCA

som en prostata-spesifikt antigen spiller en sentral rolle i celle adhesjon, spredning og overlevelse [40]. Serumnivået er direkte eller indirekte assosiert med kreft progresjon.

PSCA

over-ekspresjon ble først rapportert i prostatakreft [2], etterfulgt av flere andre kreftformer, så som kreft i bukspyttkjertelen [41,42]. Undersøkelser sammenhengen mellom

PSCA

rs2294008 polymorfisme og kreftrisiko er ofte utført i enten en liten eller stor befolkning for å identifisere forholdet. Foreløpig er det ingen entydig bevis som støtter denne foreningen. Noen studier indikerte rs2294008 polymorfisme av

PSCA

genet kan ha en betydelig rolle i blæren kreftutvikling, og det kan tjene som en biomarkør for genetisk mottakelighet for denne kreftformen [37,38], mens dette funnet motsa en følge replikering studie om magekreft i japanske befolkningen, hvor en redusert risiko for magekreft ble foreslått [10]. En siste studien, men selv viste ingen genotypisk sammenheng mellom

PSCA

rs2294008 polymorfisme og risikoen for tykktarmskreft. I lys av den relativt begrensede utvalgsstørrelsen, er det ubestemt å finne en stabil effekt størrelse på

PSCA

rs2294008 polymorfisme i forhold til kreft.

Meta-analysen har blitt allment akseptert som et viktig verktøy å analysere kumulative data fra studier hvor resultatene med lav statistisk styrke ble produsert på grunn av begrenset forsøkspersonene [43]. I den foreliggende meta-analyse, består av 27, 197 krefttilfeller og 48, 237 kontroller fra 21 artikler med 24 studier, omfattende utforsket sammenhengen mellom

PSCA

rs2294008 polymorfisme og kreftrisiko. De kombinerte resultatene antydet en statistisk sammenheng med samlede kreftrisiko. I lagdelte analyser i henhold til type kreft, ble forhøyet risiko for magekreft og blærekreft indikert. I samsvar med funnene i de tidligere analysene, lagdeling analyser i etnisitet viste også

PSCA

rs2294008 polymorfisme var forbundet med en økt risiko for kreft i asiatiske samt kaukasiske populasjoner.

Dette er den første studie adressering kreftrisiko forbundet med

PSCA

rs2294008 polymorfisme til dags dato, selv om en rekke meta-analyser har undersøkt predisposisjon effektene av

PSCA

rs2294008 polymorfisme på magekreft [6060 tilfeller og 4,824 kontroller, 10,717 saker og 9,028 kontroller, 10,836 saker og 9,235 kontroller i studien utført av Wang et al., Zhang et al. (Asiatisk Pac J Cancer Prev), Zhang et al. (Exp Ther Med), henholdsvis] [44-46]. Alle disse studiene viste PSCA rs2294008 polymorfisme er en risikofaktor for utvikling av magekreft, en observasjon i overensstemmelse med gjeldende arbeids (55,363 flere deltakere selv i forhold til den største undersøkelsen) som ble utvidet til ved inkluderingen av flere senere publiserte studier. Henvisningen til økt kreft mottakelighet innebærer at variasjonen av rs2294008 polymorfisme fører til unormal uttrykk for PSCA dermed fremme kreft progresjon uavhengig av krefttype eller etnisk opprinnelse.

Det er kjent at H. pylori infeksjon representerer en hoved og spesifikk smittsomme årsaken til human kreft, magekreft spesielt. Ulike bevisføringer har vist den viktige rollen H. pylori-infeksjon spiller i magekreft. For eksempel, Levi et al. rapporterte at ikke bare H. pylori-infeksjon i seg selv virker som en følsomhetsfaktor, men den kan ha additive effekter på gastriske karsinogenese ved å kombinere med andre forstyrrende faktorer [47]. Nesten samtidig, Wang et al. gitt ytterligere bevis på at vedvarende H. pylori infeksjon og smitte-indusert kronisk betennelse kan øke sannsynligheten for mage Cardia kreft i kinesisk [48]. Også Lunet et al. indikerte at H. pylori har en stor innvirkning med virkningene varierende utstrekning på tvers av geografiske områder på grunn av de forskjellige livsstil og eksponering for miljøkreftfremkallende [49]. Disse rapportene synes å støtte våre funn av noe lavere risiko for kreft forbundet med rs2294008 genotyper, sammenlignet med det som er rapportert i en tidligere forening studie av H. pylori infeksjon [36]. Denne forskjellen indikerer at rs2294008 polymorfisme i forhold til andre kreftfremkallende, slik som infeksjon med Helicobacter pylori, bidrar med en mindre del til kreftutvikling. Etiologien av kreft er multifaktoriell og heterogen, videre undersøkelser er nødvendig for å identifisere risikofaktorer, og dermed tilrettelegge for en tidlig oppdagelse og forebygging.

Det er betydelig mellom-studie heterogenitet i denne meta-analysen. Selv om ingen vesentlig endring ble funnet i den kombinerte resultater når du tar studiet donere heterogenitet, kan vi ikke utelukke potensielle innflytelse og dagens funn bør behandles med forsiktighet. Videre, i form av den moderate utvalgsstørrelsen i stratifisert analysene, er det fortsatt ubesluttsom om stabil effekt størrelsen på

PSCA

rs2294008 polymorfisme i forbindelse med kreftrisiko. Endelig avgang fra HWE ble påvist i to studier. Ved å sammenligne resultatene mellom med og uten dem, observerte vi mindre veksling i resultatene unnlater å nå det signifikant nivå. Likevel, i lys av få betydelige virkninger som følge av tilstedeværelsen av heterogenitet og avreise skjema HWE, våre funn er pålitelige basert på statistiske bevis.

I sammendraget, denne meta-analysen antydet at

PSCA

rs2294008 polymorfisme var signifikant assosiert med økt risiko for kreft. Stratifisert analysene i krefttype og etnisitet viste lignende resultater. Det er imidlertid verdt å gjennomføre store studier i fremtiden for å validere dagens funn.

Hjelpemiddel Informasjon

S1 PRISMA sjekkliste.

doi: 10,1371 /journal.pone.0136269.s001 plakater (DOC)

Legg att eit svar