Abstract
Bakgrunn
Både genetisk polymorfisme og miljømessige risikofaktorer spiller viktige roller i utviklingen av menneskelige kroniske sykdommer, inkludert lungekreft. Dette er den første case-control studie av interaksjon mellom polymorfismer i pre-miRNA gener og matolje røyk eksponering på risikoen for lungekreft.
Metoder
En sykehusbasert case-control studie av 258 tilfeller og 310 kontroller ble gjennomført. Seks polymorfismer i mirnas ble bestemt av Taqman allel diskriminering metode. De gen-miljø interaksjoner ble vurdert på både additiv og multiplikativ skala. De statistiske analysene ble utført for det meste med SPSS.
Resultater
Kombinasjonen av risiko genotyper av fem miRNA SNPs (MIR-146a rs2910164, MIR-196a2 rs11614913, MIR-608 rs4919510, speil 27a rs895819 og MIR-423 rs6505162) med risikofaktor (matolje røyk eksponering) bidro til en betydelig høyere risiko for lungekreft, og de tilsvarende ORS (95% konfidensintervall) var 1,91 (1,04 til 3,52), 1,94 (01.16 til 03.25 ), 2,06 (1,22 til 3,49), 1,76 (1,03 til 2,98) og 2,13 (1,29 til 3,51). De personer med både risiko genotyper av miRNA SNPs og eksponering for risikofaktor (matlaging oljedamp) var i en høyere risiko for lungekreft enn personer med bare én av de to risikofaktorer (ORS var 1,91, 1,05 og 1,41 for MIR-146a rs2910164 , ORS var 1,94, 1,23 og 1,34 for MIR-196a2 rs11614913, ORS var 2,06, 1,41 og 1,68 for MIR-608 rs4919510, ORS var 1,76, 0,82 og 1,07 for MIR-27a rs895819, og ORS var 2,13, 1,15 og 1,02 for MIR -423 rs6505162, henholdsvis). Alle tiltak av biologisk interaksjon tyder på at det ikke var faktisk biologiske interaksjoner mellom de seks SNPs av mirnas og eksponering for matolje røyk på en additiv skala. Logistiske modeller antydet at gen-miljø interaksjoner var ikke statistisk signifikant på en multiplikativ skala.
Konklusjoner
interaksjoner mellom miRNA SNPs og matolje røyk eksponering foreslått av ORS av forskjellige kombinasjoner var ikke statistisk betydelig
Citation. Yin Z, Cui Z, Guan P, Li X, Wu W, Ren Y, et al. (2015) Samspill mellom Polymorfisme i Pre-miRNA Gener og matolje Fume Eksponering på risikoen for lungekreft i kinesisk Røykfrie kvinnelige befolkningen. PLoS ONE 10 (6): e0128572. doi: 10,1371 /journal.pone.0128572
Academic Redaktør: Hiromu Suzuki, Sapporo Medical University, JAPAN
mottatt: 31 oktober 2014; Godkjent: 28 april 2015; Publisert: 17 juni 2015
Copyright: © 2015 Yin et al. Dette er en åpen tilgang artikkelen distribueres under betingelsene i Creative Commons Attribution License, som tillater ubegrenset bruk, distribusjon og reproduksjon i ethvert medium, forutsatt den opprinnelige forfatteren og kilden krediteres
Data Tilgjengelighet: All relevant data er i avisen og dens saksdokumenter filer
Finansiering:. Denne studien ble støttet av National Natural Science Foundation of China (nr 81102194). ZY mottatt finansiering. Finansiører hadde ingen rolle i studiedesign, datainnsamling og analyse, beslutning om å publisere, eller utarbeidelse av manuskriptet
Konkurrerende interesser:.. Forfatterne har erklært at ingen konkurrerende interesser eksisterer
Bakgrunn
i Kina har lungekreft blitt den ledende årsak til kreft dødsfall for både menn og kvinner [1]. Forekomsten og dødeligheten av lungekreft i kinesiske urbane befolkningen har nådd nummer én blant ondartede svulster [2]. Røyking er den viktigste risikofaktoren for lungekreft; imidlertid, er det anslått at 15% menn og 53% kvinner av lungekreftpasienter er røykere [3], noe som tyder på at andre risikofaktorer har også vært implisert i etiologien av lungekreft. Sigarettrøyking kan ikke fullt ut forklare epidemiologiske egenskapene til lungekreft i kinesiske kvinner, så det er veldig viktig å utforske andre viktige risikofaktorer for lungekreft i kinesiske ikke-røykende kvinner for å kontrollere effekten av sigarettrøyk.
eksponering for miljørisikofaktorer spiller viktige roller i utviklingen av lungekreft, men i det samme miljøet mennesker har ulik mottakelighet for kreft. Noen av disse forskjellene skyldes konseptet som genetisk disposisjon modifiserer effekten av miljømessige eksponeringer [4].
Molekylære epidemiologiske studier viste at det var hundrevis av gener involvert i lunge kreft [5]. I de senere år frem bevis støtter en ekstraordinær rolle for microRNAs (mirnas) i patogenesen av human lungekreft. Mirnas er klasser av ikke-kodende RNA, omtrent 20 nukleotider i lengde, som anses for å regulere ekspresjon ved binding til cis-regulatoriske regioner av 3′-UTR regioner av målgener [6]. Mirnas har vært innblandet i avgjørende biologiske prosesser, herunder utvikling, differensiering, apoptose, spredning og utvikling av de fleste sykdommer, inkludert kreft [7]. Studien viste at mer enn 50% av miRNA gener finne i kreftrelaterte genomiske regioner eller i sårbare områder, noe som tyder på at mirnas kan spille en viktig rolle i utviklingen kreft [8]. Enkeltnukleotidpolymorfi (SNPs) i frøet region eller forløperen stilk-løkke av miRNA er rapportert å påvirke produksjon eller foredling av miRNA [9-10]. Disse linjene av bevis tyder på at miRNA SNPs kan påvirke uttrykk eller funksjon av deres verts miRNAs. Nå forskerne konkludere med at SNP eller mutasjoner i miRNA sekvensen kan endre uttrykk, modning og /eller target utvalg av miRNA, og dermed bidra til å endre kreftrisiko. I de siste årene har foreningen mellom miRNA SNPs og risikoen for kreft blitt et hett tema i kreft etiologi forskning.
Det finnes studier på sammenhengen mellom miRNA SNPs og lunge kreftrisiko. For eksempel, Tian et al. fant at rs11614913 SNP i MIR-196a2 var assosiert med mottakelighet av lungekreft, men ingen signifikante effekter ble observert på foreningen for de andre tre SNPs (rs2910164, rs2292832 og rs3746444) ligger på pre-miRNA regioner av MIR -146a, MIR-149, MIR-196a2, og MIR-499 [11]. Den siste studien på koreansk antydet at rs2910164C G i pre-MIR-146a kan bidra til genetisk disposisjon for lungekreft [12]. En meta-analyse viste at lungekreft var assosiert med SNP rs11614913 men ikke med SNP rs3746444 [13].
Vi har studert effekten av de vanlige SNPs i utvalgte seks mirnas på mottakelighet for lungekreft hos ikke -Røyking hunner (MIR-146a rs2910164, MIR-196a2 rs11614913, MIR-30c-en rs928508, MIR-608 rs4919510, MIR-27a rs895819, og MIR-423 rs6505162) og fant signifikant assosiert miRNA SNPs (manuskriptet har blitt innsendt ). Men blant mennesker som bærer samme genotype av SNPs, noen av dem utvikler kreft og andre ikke. I samme miljø, mennesker varierer i deres følsomhet overfor kreft. Noen av disse forskjellene kan skyldes endring av genetiske faktorer på virkningen av miljømessige risikofaktorer. Utforske gen-miljø interaksjon, som kombinerer genetisk mottakelighet og miljømessige eksponeringer sammen, kan være god måte å forstå etiologi av kreft. Samspillet av miRNA SNPs og miljømessige risikofaktorer på lungekreft mottakelighet er ikke blitt rapportert så langt.
Cooking olje røyk eksponering er foreslått å være en risikofaktor for lungekreft i tidligere studier. Våre tidligere rapporter viste at husholdningenes eksponering for matolje røyk var assosiert med risiko for røykfrie kvinnelige lungekreft [14-18]. En studie i en høy forekomst befolkningen i North East India fant at samspillet mellom XRCC1Gln /Gin genotype med eksponering av eksponering av matolje røyk var signifikant assosiert med økt risiko for lungekreft [19]. Det er noen vurderinger på risikofaktorer for lungekreft konkluderte signifikant sammenheng mellom matolje røyk eksponering og risiko for lungekreft [20-21].
I forrige generell samhandling analyser, logistisk regresjon har vært vanlig. Men i logis eller Cox regresjonsmodell, regresjonskoeffisienten av produktet sikt anslår samspillet på en multiplikativ skala mens statistisk signifikans indikerer avgang fra multiplicativity. Rothman hevder at når biologisk interaksjon er undersøkt, må vi fokusere på samhandling som avvik fra additivity snarere enn avgang fra multiplicativity [22]. I denne artikkelen, beregner vi både additiv samhandling og multiplikativ interaksjon. Resultatene kan brukes som referanse av epidemiologer å vurdere den biologiske samspillet mellom faktorer.
Så vidt vi vet, er dette den første og omfattende case-control studie av lungekreft for å vurdere samspillet mellom SNPs i pre- mirnas og eksponering for miljørisiko faktor i utviklingen av lungekreft. I denne studien beskriver vi en case-control studie av lungekreft i røykfrie kvinnelige befolkningen i Shenyang, nordøst Kina for å studere samspillet mellom miRNA SNPs og matolje røyk eksponering.
Materialer og metoder
Etikk erklæringen
studiet ble godkjent av Institutional Review Board of China Medical University, Shenyang, Kina. Alle pasienter gitt skriftlig informert samtykke.
Studie fag og datainnsamling
Dette er en pågående molekylære epidemiologiske studier av lungekreft i Shenyang City, som ligger nordøst i Kina. Hver gjenstand ble intervjuet for å samle demografisk data og miljøfaktorer, samt 5 ml venøs blod å oppdage SNP. Miljøfaktorer inkluderer passiv røyking, matolje røyk eksponering, drivstoff røyk eksponering, familiehistorie med kreft, yrkesmessig eksponering og kosttilskudd vane, som ble oppnådd for hvert tilfelle og kontroll av utdannet intervjuere. Individuell med totalt 100 sigaretter i hans levetid ble definert som en røyker, ellers ble han ansett som en ikke-røyker.
I denne sykehusbasert case-control studie, studere fag inkludert 258 saker og 310 matchede kontroller for alder og kjønn, fortløpende ble inkludert i studien i løpet av juli 2006 og desember 2012. inkludering av saken gruppe: (1) pasienter nylig diagnostisert lungekreft, (2) histologisk bekreftet lungekreft av erfarne patologer, (3) aldri mottatt kjemoterapi eller strålebehandling, (4), ikke-røyk kvinnelige pasienter, (5) evne for å gjennomgå en 1,5 timers intervju, (6) med fullstendig informasjon om miljøeksponering. Eksklusjonskriterier inkluderte tidligere kreft eller spredning kreft fra en annen svulst. I samme periode, kontrollene besto av friske mennesker besøker andre enn de saker eller andre kreftpasienter ble rekruttert fra medisinsk eksamen sentre i samme sykehus, unntatt de med svulst og luftveissykdommer. Kontrollene var alle ikke-røykende kvinner og frekvens tilpasset tilfeller av alder (± 5 år). Deltakerne var urelaterte etniske Han-kinesiske kvinner.
I våre tidligere publiserte artikler, var matolje røyk eksponering funnet å være signifikant assosiert med risiko for lungekreft hos ikke-røykende kvinner [14-18], så i studien vi analysere samspillet mellom SNPs og matolje røyk eksponering. For matolje røyk eksponering, ble deltakerne spurt om hyppigheten av matlaging og typer oljer. Forsøkspersonene ble også spurt om «Hvor ofte gjorde luften i kjøkkenet bli fylt med fet «røyken» under matlagingen?» For hvert av disse spørsmålene, var det fire mulige svar som spenner fra «aldri», «sjelden», «noen ganger», for å «ofte». Eksponering for matolje røyk ble kategorisert som en indikator variabel lik 1 hvis deltakerne rapportert ofte eller noen ganger, og lik 0 ellers.
SNP genotyping
Genomisk DNA-prøver ble isolert ved hjelp av Fenol-kloroform Metode. Genotyping av SNPs ble gjort på et Applied Biosystems 7500 FAST Real-Time PCR System (Foster City, CA, USA) ved bruk av Taqman allel diskriminering (Applied Biosystems, Foster City, California) med en kommersielt tilgjengelig primer probe sett (assay ID C_15946974_10 for rs2910164, C_31185852_10 for rs11614913, C_1766455_10 for rs928508, C_2826025_10 for rs4919510, C_3056952_20 for rs895819 og C___11613678_10 for rs6505162). Kvalitetskontroller er inkludert som egnede negative kontroller ble inkludert i hvert forsøk, og 10% av pasienter ble tilfeldig utvalgt for å bli genotypede to ganger av forskjellige personer, og resultatene ble funnet å være overensstemmende for alle av de maskerte dupliserte sett.
statistisk analyse
Ubetinget logistisk regresjonsanalyse ble utført for å beregne odds ratio (OR) og deres 95% konfidensintervall (KI) for å vurdere sammenhengen mellom kombinasjon eller samspill av SNPs og miljøfaktorer med lungekreft eller lunge adenokarsinom risikoer. Genet-miljø interaksjon ble vurdert av crossover-analyse (additiv interaksjon) og logistikk regresjonsmodeller (multiplikativ interaksjon). I disse analysene ble kombinasjoner av beskyttende genotyper av hver SNP og fravær av matolje røyk eksponering anses som referansegruppe. Vi bruker regresjonskoeffisienter og kovariansmatrise av logistiske modellen i SPSS programvare, og deretter innføre et Excel-regneark satt opp av Tomas Andersson å beregne indekser for interaksjon på en additiv skala og de tilhørende konfidensintervall [23]. Tre mål på biologisk interaksjon: den relative overskytende risiko på grunn av interaksjon (RERI), den skyldes forhold på grunn av interaksjon (AP), og synergi-indeksen (S); samt deres 95% CI’er ble beregnet på grunnlag av de tre relative risikoestimater og den tilsvarende kovariansmatrisen fra en logistisk regresjonsmodell. De fleste av de statistiske analyser ble utført ved bruk av SPSS 20,0 programvare, med unntak av tiltak av additiv interaksjon som er angitt ovenfor. Alle testene var tosidig og statistisk signifikans ble definert som P . 0,05
Resultater
Det er 258 tilfeller og 310 kontroller i dagens analyser. Alle individer er røykfrie kvinner. Av de 258 lungekreft tilfeller 194 (75,19%) av pasientene var adenokarsinom, 34 (13,18%) var plateepitel celler karsinom og 30 (11.63%) var andre typer.
Analyser av miljøpåvirkningsfaktorer antydet at det var en signifikant sammenheng mellom risikoen for lungekreft med matolje røyk eksponering (OR = 1,52, 95% CI = 01.06 til 02.17, P = 0,023), men ikke med andre miljømessige risikofaktorer (data ikke vist). I våre tidligere studier og dagens analyser, CG eller GG genotype av rs2910164, TT genotype av rs11614913, AG eller GG genotype av rs928508, GG genotype av rs4919510, TC eller CC genotype av rs895819, CA eller AA genotype av rs6505162 ble foreslått å være beskyttende genotype (e), slik at kombinasjoner av disse genotyper og ikke-eksponering til matolje røyk ble definert som referansegrupper i interaksjonen analysene.
tabell 1 viste omfattende kombinasjonen av seks SNPs i mirnas og matolje ryke eksponering på resistens av lungekreft og lunge adenokarsinom i kinesisk røykfrie kvinnelige befolkningen. Fagene som frakter MIR-196a2 rs11614913 TC genotype og eksponering for matolje røyk hadde en 2.08-fold risikoen for lungekreft sammenlignet med kombinasjonen av TT genotype og ikke-eksponering for matolje røyk (95% CI = 1,18 til 3,65). Personer med MIR-608 rs4919510 GC genotype og eksponering for matolje røyk hadde en 2,33 ganger økt risiko for kreft sammenlignet med kombinasjonen av GG genotype og ikke-eksponering for matolje røyk (95% KI = 01.29 til 04.23). Kombinasjonen av MIR-423 rs6505162 CC genotype og matolje røyk eksponering var signifikant assosiert med risikoen for lungekreft sammenlignet med kombinasjonen av AA genotype og ikke-eksponering for matolje røyk (OR = 3,14, 95% CI = 1,02 til 9,62). De tilsvarende resultater ble vist i lunge adenokarsinom. Selv i andre SNPs, resultatene var ikke signifikante, kan det bli foreslått at kombinasjoner av risiko genotyper og matolje røyk eksponering kan være assosiert med økt risiko for lungekreft. I tillegg ble kombinasjonen av SNPs i miRNAs og matolje eksponering på resistens av lungekreft og lunge adenokarsinom etter andre sammenligninger presentert i S1 tabell.
Tabell 2 viste crossover analyserer resultater om samspillet mellom SNPs i mirnas og matolje røyk eksponering på lungekreft mottakelighet kinesisk røykfrie kvinnelige befolkningen. For MIR-146a rs2910164 polymorfisme, hadde større sannsynlighet for å utvikle lungekreft sammenlignet med de med CG /GG genotype og ikke-eksponering for matolje røyk (de personer med CC genotypen (risiko genotype) og eksponering for matolje røyk (risikofaktor) OR = 1,91, 95% CI = 1,04 til 3,52, P = 0,037). De tilsvarende statistisk signifikante resultater ble også funnet i MIR-196a2 rs11614913, MIR-608 rs4919510, MIR-27a rs895819 og Mir-423 rs6505162 polymorfismer, som var en kombinasjon av risiko genotyper av disse miRNA SNPs med risikofaktor for matolje røyk eksponering bidratt til en betydelig høyere risiko for lungekreft, og de tilsvarende ORS (95% CIS) var 1,94 (01.16 til 03.25), 2,06 (1,22 til 3,49), 1,76 (1,03 til 2,98) og 2,13 (1,29 til 3,51). I tabell 2, kan det bli funnet at folk både bærer risiko genotyper av miRNA SNPs og eksponering for risikofaktoren (matolje røyk) var i en høyere risiko for lungekreft enn personer med bare én av de to risikofaktorer (ORS var 1,91, 1,05 og 1,41 for MIR-146a rs2910164, ORS var 1,94, 1,23 og 1,34 for MIR-196a2 rs11614913, ORS var 2,06, 1,41 og 1,68 for MIR-608 rs4919510, ORS var 1,76, 0,82 og 1,07 for MIR-27a rs895819, og ORS var 2,13, 1,15 og 1,02 for MIR-423 rs6505162, henholdsvis), som foreslo at det kan være samspillet mellom disse SNPs og matolje røyk eksponering, så vi utforsket samspillet på en additiv skala og en multiplikativ skala av kvantitativ og statistisk signifikant mer analyser.
Fordi adenokarsinom er den hyppigste subtype av lungekreft, med en høyere forekomst hos kvinner, vi analysert samspillet mellom over SNPs i mirnas og matolje røyk eksponering på lunge adenokarsinom mottakelighet i kinesisk ikke -Røyking kvinnelige befolkningen (tabell 3). For MIR-146a rs2910164, MIR-196a2 rs11614913, MIR-608 rs4919510, MIR-27a rs895819 og MIR-423 rs6505162 polymorfismer, risiko genotyper kombinere med risikofaktor (matolje røyk eksponering) var signifikant assosiert med lunge adenokarsinom risiko, og de tilsvarende ORS (95% cIS) var 2,13 (01.12 til 04.04), 2,18 (1,25 til 3,81), 2,18 (1,24 til 3,83), 2,19 (1,24 til 3,88) og 2,06 (1,20 til 3,55). Kombinasjonen av to risikofaktorer bidro til en høyere risiko for lunge adenokarsinom enn de med bare en av dem (ORS var 2,13, 1,07 og 1,37 for MIR-146a rs2910164, ORS var 2,18, 1,31 og 1,20 for MIR-196a2 rs11614913, ORS var 2,18, 1,04 og 1,13 for MIR-608 rs4919510, ORS var 2,19, 1,04 og 1,13 for MIR-27a rs895819, og ORS var 2,06, 1,13 og 1,13 for MIR-423 rs6505162, henholdsvis). I tillegg støtter Informasjon S2 Tabell viste samspillet mellom SNPs i mirnas og matolje eksponering på lungekreft og lunge adenokarsinom mottakelighet under annen sammenligninger.
Tabell 4 viser de kvantitative og statistisk signifikante analyser resultater om tiltak av biologisk interaksjon mellom SNPs i mirnas og matolje eksponering på lungekreft og adenokarsinom i kinesisk røykfrie kvinnelige befolkningen. Det er tre mål samhandling og deres konfidensintervall. Hvis det ikke er biologisk interaksjon, RERI og AP er lik 0, og S er lik 1. Alle målinger av biologisk interaksjon indikerer at det ikke var faktisk biologiske interaksjoner mellom de seks SNP’er av mirnas og eksponering for matlaging oljedamp på en additiv skala. Logistiske modeller antydet at gen-miljø interaksjoner var ikke statistisk signifikant på en multiplikativ skala (data ikke vist). Fra resultatene av våre analyser, kan det ikke være noen statistisk signifikant interaksjon mellom seks miRNA SNPs og matolje røyk eksponering i lungekreft eller lunge adenokarsinom blant nonsmoking kvinner i Kina.
Diskusjoner
i de siste årene, etiologisk studie av lungekreft er fortsatt populær over hele verden, men resultatene er inkonsekvent. Det er velkjent at i tillegg tobakksrøyking, andre påvirkningsfaktorer for lungekreft er ikke entydige. Sigarettrøyking kan ikke fullt ut forklare epidemiologiske egenskapene til lungekreft i kinesiske kvinner som røyker sjelden, men har lungekreft relativt ofte. Utvilsomt røykfrie kvinner er de ideelle fag for å undersøke ukjente, men viktige miljømessige og genetiske faktorer av lungekreft. Vårt forskningsteam har pågått studier av risikofaktorer og genetisk disposisjon for lungekreft hos kinesiske befolkningen. I tidligere studier, rapporterte vi assosiasjoner mellom matolje røyk eksponering og lunge kreftrisiko. Flere nylig, analyserer vi miRNA SNPs og lunge kreftrisiko. Tatt i betraktning den viktige rollen av gen-miljø interaksjoner i utvikling av lungekreft, i denne studien evaluerte vi samspillet mellom seks funksjonelle polymorfismer av seks mirnas og lunge kreftrisiko i en kinesisk røykfrie kvinnelige befolkningen.
Så langt vi kjenner til, er dette den første studien grundig utforske samspillet mellom miRNA SNPs og miljø risikofaktor både additiv skala og multiplikativ skala av kvalitative og kvantitative analyser. De kvalitative resultatene etter cross-over-analyser antydet at det kan være samspill mellom seks miRNA SNPs og matolje røyk eksponering i utvikling av lungekreft eller lunge adenokarsinom blant kinesiske røykfrie kvinnelige befolkningen. Men ytterligere kvantitative analyser på både additiv skala og multiplikativ skala viste at ingen statistisk signifikant interaksjon mellom miRNA SNPs og matolje røyk eksponering ble funnet i lungekreft eller lunge adenokarsinom blant nonsmoking kvinner i Kina.
I denne undersøkelsen , personer med eksponering for matolje røyk hadde en 1,52 ganger økt risiko for å utvikle lungekreft, som var konkordant med våre tidligere rapporter [14-18]. Det er studier som viser at matolje avtrekk kondensater kan indusere DNA-skader og innflytelse DNA kryssbindinger i en viss konsentrasjon [24-25]. Tung et al funnet at eksponering for matolje røyk kan hemme cellevekst og induserer oksidativt stress i lunge epitelceller [26]. Det er andre studier som tyder på de viktige rollene matolje røyk eksponering i risikoen for lungekreft blant nonsmoking kvinner [27-29]. Over bevisene støtter viktige roller matolje røyk eksponering i lungekreft utvikling.
En sterk kobling mellom endrede mirnas, enten strukturen endres eller uttrykk for modne miRNA og kreftrisiko er etablert, åpner opp en ny vei etterforskning for molekylære mekanismene for kreftutvikling [30]. Selv om deres biologiske funksjoner fortsatt i stor grad uklart, det finnes studier som viser at mirnas kan fungere som onkogener og /eller tumorsuppressorgener [30-34]. SNPs eller mutasjoner av mirnas kan påvirke deres eiendom gjennom å endre miRNA uttrykk og /eller modning, og dermed kan bidra til kreftrisiko [9,35]. Forskere regner med at mirnas kan bli ideelle kandidater for kreft predisposisjon faktor fordi deres små variasjoner kan påvirke tusenvis av mål mRNA og resultere i ulike funksjonelle konsekvenser. Imidlertid er rollen til genetiske varianter i mirnas i kreft mottakelighet for det meste ukjent.
De fleste av de etiologiske studier av kreft ikke analysere gen-miljø interaksjon, som er ansett som viktigere i etiologien av kreft, eller bare analysert multiplikativ samhandling ved å legge samspillet begrepet i logistisk regresjon. En lederartikkel har uttalt at statistisk interaksjon er ganske forskjellig fra biologisk interaksjon, kan den tidligere reflektere enten avgang fra additivity eller multiplicativity avhengig av valgt statistisk modell og graden av biologiske samspillet mellom risikofaktorer er målt som avvik fra additivity og ikke som avvik fra multiplicativity [36]. Den logistisk regresjon modellen er trolig den mest brukte statistisk modell i epidemiologiske analyser til dag, men logistisk regresjon er iboende multiplikativ, så det er mye brukt til å bare analysere multiplikativ interaksjon. Således vil en betydelig kryssledd i en slik modell innebærer en multiplikativ forbindelse mellom sykdommen og tilstedeværelsen av en interaksjon begrepet innebærer avvik fra multiplicativity, snarere enn fra additivitet. Derfor samspillet begrepet i logistisk modell har ingen direkte mulighet til å opplyse hvorvidt biologisk interaksjon er tilstede. På den annen side kan den biologisk interaksjon likevel bli utforsket fra resultatene av en logistisk regresjonsmodell, men dette forutsetter at modellen er definert på en spesiell måte, og at analysen er gjort tilstrekkelig. Andersson et al. beskrive hvordan en logistisk regresjonsmodell kan defineres for å produsere den produksjonen som er nødvendig for vurdering av biologisk interaksjon [23].
I denne studien, samspillet analyseresultatene med å sammenligne ORS av forskjellige gen-miljø kombinasjon av kryssende analyser viste at i fem miRNA SNPs kombinasjonen av risiko genotyper med risikofaktor (matolje røyk eksponering) bidro til en betydelig høyere risiko for lungekreft, noe som tyder på det kan være gen-miljø interaksjon. Imidlertid ytterligere statistiske analyser for additiv interaksjon og multiplikativ interaksjon viste at interaksjoner mellom miRNA SNP’er og matolje røyk eksponering var ikke signifikant, enten fra multiplicativity ved hjelp av kryssledd av logistisk regresjon eller fra additivitet ved Andersson et al. Metode. Mulig årsak er at prøvestørrelsen av denne studien er for liten til å oppnå statistisk signifikante resultater. Så større populasjon av lungekreft er nødvendig for å bekrefte konklusjonen i fremtiden. Fordi det er bare en statistisk beregning, videre studier om deres biologiske gyldighet er nødvendig.
Denne studien er den første studien for å evaluere gen-miljø interaksjoner mellom mirnas SNPs og miljømessige risikofaktorer i utviklingen av lungekreft på både multiplikativ og additiv skala. Selv om resultatene var statistisk signifikant, ideen og en fremgangsmåte for å grundig vurdere samspillet mellom to faktorene er verdifulle og har indikative betydning for fremtidige lignende studier. De viktigste begrensningene ved studien var den lille utvalgsstørrelse og fravær av andre faktorer, inkludert mulige konfunderende faktorer i analysene. Følgelig er fremtidige studier med større utvalg populasjon av lungekreft, vurderer flere påvirkningsfaktorer og om deres biologiske gyldighet nødvendig for å bekrefte konklusjonen.
I sammendraget, denne studien først rapportert samspillet mellom enkeltnukleotidpolymorfi i mirnas og miljø risikofaktor i utviklingen av lungekreft, sier det var ingen statistisk signifikant interaksjon. Vår studie ville ha en viss positiv betydning i forståelsen av lungekreft patogenesen og i fremtiden analyse av interaksjon.
Konklusjoner
interaksjoner mellom miRNA SNPs og matolje røyk eksponering foreslått av ORS av annen kombinasjon var ikke statistisk signifikant.
Hjelpemiddel Informasjon
S1 Table. . Kombinasjon av SNPs i miRNAs og matolje eksponering på resistens av lungekreft og lunge adenokarsinom i kinesisk røykfrie kvinnelige befolkningen under andre sammenligninger
doi: 10,1371 /journal.pone.0128572.s001 plakater (DOC)
S2 Table. Interaksjon mellom SNPs i mirnas og matolje eksponering på lungekreft mottakelighet kinesisk røykfrie kvinnelige befolkningen under andre sammenligninger
doi:. 10,1371 /journal.pone.0128572.s002 plakater (DOC)
Takk til
Vi er takknemlige for pasienter for deres deltakelse. Vi ønsker å takke alle de ansatte på sykehusene i vår studie. Denne studien ble støttet av National Natural Science Foundation of China (nr 81102194).
