Abstract
Heterosykliske aromatiske aminer dannes i kokt kjøtt kan være en underliggende mekanisme for den røde kjøtt- tykktarmskreft (CRC) forening. Disse forbindelsene krever bioactivaction av
N
-acetyltransferase 2 (NAT2). En interaksjonseffekt mellom rødt kjøtt forbruk og NAT2 i økende CRC risikoen er inkonsistent rapportert i hvite. Vi undersøkte dette samspillet i to populasjoner hvor høy aktivitet rask NAT2 fenotype er 10- og to ganger mer vanlig enn i hvite. Vi meta-analyse fire studier av japanske (2,217 tilfeller, 3.788 kontroller) og tre studier av afro-amerikanere (527 tilfeller, 4,527 kontroller). NAT2 fenotype ble utledet fra en optimalisert sju SNP genotyping panel. Bearbeidet og totale rødt kjøtt inntak ble assosiert med økt CRC risiko på japansk og i begge etniske grupper kombinert (P ≤ 0,002). Vi observerte en interaksjon mellom bearbeidet kjøtt inntak og NAT2 på japansk (P = 0,04), afro-amerikanere (P = 0,02), og i begge gruppene kombinert (P = 0,006). Foreningen av bearbeidet kjøtt med CRC var sterkest blant personer med den raske NAT2 fenotype (kombinert analyse, OR for høyeste vs laveste kvartil: 1,62, 95% CI: 01.28 til 02.05; P
trend = 8,0 × 10
-5), middels blant de med mellom NAT2 fenotype (1,29, 95% KI: 1,05 til 1,59; P
trend = 0,05) og null blant dem med treg fenotype (P
trend = 0,45). En tilsvarende interaksjon ble funnet for NAT2 og total rødt kjøtt (P
samhandling = 0,03). Våre funn støtter en rolle for NAT2 i å endre sammenhengen mellom rødt kjøtt forbruk og CRC i japanske og afrikanske amerikanere
Citation. Wang H, Iwasaki M, Haiman CA, Kono S, Wilkens LR, Keku TIL, et al. (2015) Samspill mellom rødt kjøtt inntak og
NAT2
Genotype i å øke risikoen for tykktarmskreft i japanske og afrikanske amerikanere. PLoS ONE 10 (12): e0144955. doi: 10,1371 /journal.pone.0144955
Redaktør: Georgina L. Hold, University of Aberdeen, Storbritannia
mottatt: 23 september 2015; Godkjent: 25 november 2015; Publisert: 18.12.2015
Dette er en åpen tilgang artikkel, fri for all opphavsrett, og kan bli fritt reproduseres, distribueres, overføres, endres, bygd på, eller brukes av alle for ethvert lovlig formål. Arbeidet er gjort tilgjengelig under Creative Commons CC0 public domain engasjement
Data Tilgjengelighet: Genetiske data for de amerikanske GWAS studier blir satt inn dbGAP (dataregister nummer ennå ikke tilgjengelig). Data om kjøtt inntak er tilgjengelige i Saksdokumenter filene
Finansiering:. Den tykktarmskreft GWAS i japanske og afrikanske amerikanere ble støttet med tilskudd fra National Institutes of Health (R01 CA126895 og CA126895-S01). Den multietnisk undersøkelsen er støttet av National Institutes of Health (U01 CA164973). Den genotyping av African American mannlige og kvinnelige kontroller ble støttet av National Institutes of Health (CA63464, CA54281, CA1326792, CA148085 og HG004726); og en Department of Defense Breast Cancer Research Program Era of Hope Scholar Award [W81XWH-08-1-0383 å CAH]. JPHC ble støttet av National Cancer Center Research and Development Fund (siden 2011) og en Grant-in-Aid for kreftforskning (1989-2010) fra Helsedepartementet, Arbeids- og velferds av Japan. UNC Studien ble støttet National Institutes of Health (P30 DK 034 987 og R01 CA66635). Finansiører hadde ingen rolle i studiedesign, datainnsamling og analyse, beslutning om å publisere, eller utarbeidelse av manuskriptet
Konkurrerende interesser:.. Forfatterne har erklært at ingen konkurrerende interesser eksisterer
Innledning
tykktarms~~POS=TRUNC kreft~~POS=HEADCOMP (CRC) er en ledende årsak til kreftdødelighet i verden, med rundt 1,4 millioner nye tilfeller og 694,000 sykdomsspesifikke dødsfall i 2012 [1]. I ikke-vestlige land og spesielt i Asia, som flere mennesker vedta en høy-energi kosthold og lav fysisk aktivitet som er en del av «vestlig» livsstil, er forekomsten av barnekonvensjonen har vært økende, med de høyeste forekomst tiden blir rapportert fra Japan. Rødt kjøtt og bearbeidet kjøtt forbruket er etablert risikofaktorer for CRC [2-5]. En hypotetisk mekanisme for denne foreningen er gjennom eksponering for heterosykliske aromatiske aminer (Haas), som dannes når kjøttet er kokt ved høy temperatur for en lang varighet [6-8].
N
-acetyltransferase 2 (NAT2) har vist seg å spille en avgjørende rolle i bioaktive av Haas.
N
-hydroxylated HAA metabolitter er substrater for
O
-acetylation hovedsakelig av NAT2 å danne reaktive
N
acetoksy arter som binder seg til DNA.
N
-acetylation aktivitet kan bestemmes ved å dosere fag med et substrat, slik som isoniazid, sulfamethazine eller koffein, og måle urinmetabolitter [9]. Mer enn 25 genetisk polymorfisme er identifisert for
NAT2
som kan påvirke den katalytiske aktiviteten av NAT mot Haas. Flere genotyping paneler har blitt brukt til å klassifisere
Nat2
genotyper og antyde fenotype. Et panel av syv SNPs for
NAT2
har vist seg å være optimal [10,11], selv om en enkelt SNP (rs1495741) har blitt foreslått å være tilstrekkelig for
NAT2
i europeere [12 ].
hyppigheten av den langsomme NAT2 fenotype varierer sterkt på tvers av befolkningsgrupper, fra ca 5% i kanadiske eskimoer, til 10% på japansk, 50% i europeere og 90% i nordafrikanere [13]. Det er bemerkelsesverdig at populasjoner med de høyeste frekvensene for den raske acetylering fenotype har også de høyeste CRC forekomst i verden (Native Alaskans og japanske amerikanere), og de med lavest rask acetylering Fenotypefrekvensene har svært lave CRC priser (for eksempel i nord-Afrika) [1,14]. Dessuten har de heve trendene i tykktarm kreft forekomst og dødelighet i Japan tett parallell økning i rødt kjøtt inntak med en 20 år etterslep [15]. En økologisk studie viste at NAT2 fenotype betydelig forbedret internasjonal sammenheng som eksisterer mellom landsspesifikke kjøttforbruk og CRC forekomsten [16]. En rekke studier har antydet en sterkere assosiasjon mellom CRC eller dens forløper, adenom, og rødt kjøtt forbruket blant personer med den raske NAT2 fenotype [17-22], men ikke konsekvent [23-26]. Denne mangelen på konsistens kan skyldes flere aspekter av studien heterogenitet, for eksempel forskjeller i dedusere NAT2 aktivitet fra genotype, studiepopulasjonen, utvalgsstørrelse, og i analysestrategier (for eksempel gruppere middels og raske fenotyper for europeere, en befolkning med en lav frekvens for den raske fenotype).
Vi rapporterer om modifiserings effekten av NAT2 på foreningen av rødt kjøtt inntak på risikoen for tykktarmskreft i et genom-wide forening studie (GWAS) gjennomførte i japansk og afroamerikanere . Disse to populasjoner har høy forekomst av CRC og en frekvens på rask acetylatorstatus fenotype som er 10- og 2 ganger høyere enn i hvite, henholdsvis.
Resultater
Den japanske prøver inkludert 2,217 CRC tilfeller og 3.788 kontroller fra den multietniske kohort studie (MEC), Fukuoka Colorectal Cancer Study (Fukuoka), Japan Public Health Center kohortstudie (JPHC) og Nagano Colorectal Cancer Study (Nagano). Den afroamerikanske prøver inkludert 527 tilfeller og 4,527 kontroller fra MEC, University of North Carolina Rektal Cancer Study (UNC) og prostata, lunge, tykktarms og eggstokkreft Screening (PLCO) Trial. Kjennetegn på deltagerne blir vist av etniske /rasegruppe og studier i tabell 1. Frekvensen av den raske NAT2 fenotype varierte på tvers av studier fra 46,4% til 48,4% i japansk og fra 6,5% til 10,7% i afrikanske amerikanere, i samsvar med tidligere studier [27]. Nat2 nivåer ble ikke signifikant assosiert med CRC i hver populasjon eller når de to ble kombinert (P 0,19, S1 tabell).
Studien spesifikke cut-poeng for å skape den 4-nivå kjøtt variabler er vist i S2 tabell. Større inntak av bearbeidet kjøtt, rødt kjøtt uten bearbeidet kjøtt og total rødt kjøtt ble all statistisk signifikant assosiert med CRC risiko på japansk, og når den japanske ble kombinert med afro-amerikanere (P
trend ≤ 0,0051) (tabell 2). I afrikanske amerikanere alene, foreninger var av samme retning, men med P-verdier 0.05, blant annet som følge av relativt lite antall tilfeller i denne gruppen. Den odds ratio (OR) for hvert kvartil økning i bearbeidet kjøtt nivå var 1,10 [95% konfidensintervall (CI): 1,05, 1,16] i japansk (P
trend = 0,0002), 1,02 (95% KI: 0,93, 1,13 ) i afrikanske amerikanere (P
trend = 0,62) og 1,09 (95% KI: 1,04, 1,14) i den kombinerte analysen (P
trend = 0,0004). Foreningen for rødt kjøtt uten bearbeidet kjøtt var lik, men av noe mindre omfang (tabell 2). Ingen ble observert innen etnisk gruppe heterogenitet på tvers av studier (P
het er 0,39). Tilsvarende ble ingen heterogenitet oppdaget av studiedesign (prospektiv vs. case-kontrollstudier) (P
het er 0,24). Det var svak bevis for mellom-etnisk gruppe heterogenitet (I
2 = 44%) for sammenhengen mellom bearbeidet kjøtt og CRC, men ikke for de andre to kjøtt variabler. Justert for flere risikofaktorer i disse dataene ikke vesentlig endre resultatene (S3 Table), bortsett fra at mellom-etniske gruppen heterogenitet ble svekket (jeg
2 = 8%) for sammenhengen mellom bearbeidet kjøtt og CRC.
de risikoestimater for disse foreningene heller ikke vesentlig endring i analysene begrenset til tykktarmskreft eller endetarmskreft for de japanske studier, som var store nok til å tillate slike Subsite spesifikke analyser. For eksempel, OR for bearbeidet kjøtt var 1,09 (95% KI: 1,03, 1,16, P = 0,003) for tykktarmskreft og 1,14 (95% KI: 1,06, 1,23, P = 0,001). For endetarmskreft
Vi har observert en statistisk signifikant interaksjon mellom bearbeidet kjøtt og NAT2 fenotype om risiko for CRC i japansk (P
interaksjon = 0,044), i afrikanske amerikanere (P
interaksjon = 0,018) og i begge etniske grupper kombinert (P
interaksjon = 0,006) (tabell 3). I den japanske, effekten av bearbeidet kjøtt var sterkest hos pasienter med rask NAT2 fenotype (eller for den høyeste til laveste kvartil: 1,61, 95% KI: 1,26, 2,06; P
trend = 1,8 × 10
– 4). Den tilsvarende OR for japansk med treg NAT2 fenotype var 1,06 (95% KI: 0,63, 1,79); P
trend = 0,70). I afro-amerikanere, for hvem antallet tilfeller var mye mindre, bearbeidet kjøtt var ikke signifikant assosiert med CRC i noen NAT2 undergruppe (alle p
trend 0,05). Likevel ble det observert en interaksjonseffekt mellom kvartil av bearbeidet kjøtt og NAT2 nivå (P
interaksjon = 0,018). Resultatene i analysen kombinerer både japanske og afro-amerikanere for bearbeidet rødt kjøtt lignet de i japansk med svake mellom-etniske gruppen heterogenitet (I
2 = 49,7%). Samspillet mellom total rødt kjøtt og NAT2 var også betydelig når begge etniske grupper ble kombinert (P
samhandling = 0,03). Total rødt kjøtt inntak var forbundet med CRC risiko både den raske og intermediære Nat2 kategorier (P
trend = 0,003 og 0,015, respektivt), men ikke i den langsomme NAT2 kategori (P
trend = 0,53). Siden vi ikke fant en statistisk signifikant interaksjon mellom NAT2 og rødt kjøtt uten bearbeidet kjøtt (P
samhandling er 0,17), samspillet mellom total rødt kjøtt og NAT2 på CRC risiko i den kombinerte analysen var stort sett gjenspeiler at mellom behandlet kjøtt og NAT2. Samspillet mellom NAT2 og rødt kjøtt ikke avviker med studiedesign (potensiell vs case-control) (P
het er 0,47).
I en sensitivitetsanalyse, den eller estimater for kjøtt variabler innenfor hver NAT2 kategorien endret ikke vesentlig ( 12%) etter justering for ytterligere CRC risikofaktorer i den japanske, selv om p-verdier for samspillet mellom NAT2 og bearbeidet kjøtt endret 0,044 til 0,075 (S4 tabell). I sekundært analyser i den japanske, samspillet mellom bearbeidet kjøtt og NAT2 var statistisk signifikant for tykktarmskreft (P = 0,04), men ikke for endetarmskreft (P = 0,41), selv om ORS for bearbeidet kjøtt innenfor NAT2 kategori i hvert sekundært analyse var lik de for tykktarmskreft (endringer 9%).
det ble rapportert at i kaukasiere, spår rs1495741 den NAT2 fenotype utledes fra 7-SNP panel godt, med sensitivitet og spesifisitet for bruk av genotype AA å tildele NAT2 langsom fenotypen til 99% og 95%, henholdsvis [12]. Tilsvarende i våre data, ble høy prediksjonsnøyaktigheten observert på japansk, men ikke i afrikanske amerikanere (S5 Table). Den tilsvarende sensitivitet og spesifisitet var 96,8% og 98,9% i japansk og 97,1% og 70,5% i afro-amerikanere. Avtalen rente, dvs. andelen av pasienter med AA, AG eller GG genotype som utledes til samme langsom, middels eller rask NAT2 fenotype kategori ved begge metodene, var 95,8% i japansk og 67,7% i afro-amerikanere.
Diskusjoner
i denne stor studie av japanske og afrikanske amerikanere, to populasjoner med høy risiko for CRC og med en høy og middels frekvens av NAT2 rask fenotype, henholdsvis, observerte vi en statistisk signifikant interaksjon mellom bearbeidet kjøtt inntak og NAT2 aktivitet i hver populasjon, og med total rødt kjøtt inntak i begge populasjoner kombinert. De interaksjoner for bearbeidet kjøtt og total rødt kjøtt syntes å være doseavhengig siden deres assosiasjoner med CRC var sterkest blant personer med den raske NAT2 fenotype, mellom blant personer med mellom NAT2 fenotype, og ikke-signifikant blant de med treg NAT2 fenotype .
N
-acetyltransferases (NAT) er tenkt å spille en avgjørende rolle i gentoksisitet av Haas.
N
-hydroxylated HAA metabolitter er substrater for
O
-acetylation hovedsakelig av NAT2 å danne reaktive
N
acetoksy arter som binder seg til DNA. Som et resultat, kan kreftrisiko være spesielt forhøyet hos personer som er raske acetylators. En rekke case-control og prospektive studier har antydet en økt risiko for tykktarmskreft for personer med den raske acetylatorstatus, vurdert etter fenotyping eller genotyping. Men meta-analyser av litteraturen på NAT2 acetylatorstatus (regnes som rask /middels vs. langsom genotype eller fenotype) har vanligvis ikke bekreftet denne foreningen [28-30]. Vår studie var også konsistent med en mangel på viktig effekt for NAT2 på CRC risiko.
I samsvar med våre resultater, interaksjoner ble foreslått i en rekke tidligere studier mellom inntak av rødt kjøtt, godt gjort kjøtt eller HAA og NAT2 acetylatorstatus på risikoen for tykktarms neoplasi [17-22]. Men andre studier, noen med store utvalgsstørrelser, klarte ikke å gjenskape dette samspillet mellom inntak av kjøtt og NAT2 på tykktarmskreft eller adenom risiko [23-26].
Dessverre, og legger til problemer med å tolke tidligere data, bare noen få studier og ingen meta-analyse eller sammenslåtte analyser har rapportert risikoestimater spesielt for raske acetylators (homozygote for
NAT2 * 4
allelet) (undergruppe forventes å være i størst risiko), som gruppering mellom med raske acetylators har vært normen, sannsynligvis fordi de fleste tidligere studier ble utført hos hvite, en befolkning med en lav frekvens av rask NAT2 fenotype. Et strøm beregning tilsier at replikering (med 80% effekt) av et samspill effekt på omfanget observert blant japanerne i vår studie i et europeisk avstamning befolkning ville kreve ca 6000 saker og så mange kontroller. Den største analyse for å date [26], som kombinert 9 studier begrenset til populasjoner av europeisk herkomst å undersøke samspillet mellom rødt kjøtt inntak og NAT2 på risiko for CRC skredet denne utvalgsstørrelse (8,290 tilfeller og 9,115 kontroller) og ikke oppdage eventuelle signifikant interaksjon. Det er mulig at den modifiserende virkning av NAT2 på sammenhengen mellom rødt kjøtt inntak og CRC er populasjon-spesifikk grunn av forskjeller i koke praksis og, således, HAA inntaket tvers populasjoner og /eller andre modifiserende faktorer. Pågående arbeidet med å utvikle biomarkører for lang tids eksponering for Haas kan være nyttig å avklare disse befolknings forskjeller [31].
I tillegg til sin store utvalgsstørrelse og evnen til å skille de tre Nat2 fenotyper i vår analyse , presenterer denne studien en rekke styrker. Vi var i stand til å harmonisere eksponering variabler som samles inn fra ulike populasjoner og ulike studie instrumenter som gjør det mulig for mer robuste og generaliseres funn. Vi var også i stand til å vurdere flere risikofaktorer for CRC som potensielle confounders, sikre uavhengighet av de observerte effektene.
Noen studie begrensninger fortjener overveielse. Det var variasjon i hvor omfattende kosten data som brukes i denne analysen som krevde at vi brukte studiespesifikke quantiles grunn av forskjeller i metodikk på tvers av studier. Dette eksemplifiseres i JPHC som vi brukte baseline data, som ble samlet inn ved hjelp av en ~ 50 varer food-frekvens spørreskjema. Vi merker oss at oppfølgingsundersøkelse i JPHC brukt en mer detaljert spørreskjema (~ 150 stk), lik den som brukes i Nagano Study, og ga lignende inntaksverdier som i Nagano studie [32], noe som bekrefter at inntaket variasjon i våre data var mest sannsynlig på grunn av instrumentforskjeller og ikke til seleksjonsskjevhet. Dessuten, ikke alle studier som er inkludert her forsøkt å kvantifisere HAA inntaket basert på kjøtt matlaging metoden og doneness nivå. Så vi var ikke i stand til å vurdere godt gjort kjøtt eller HAA inntak i våre analyser. Vi begrenset oss til kanskje den viktigste enzymet som er involvert i metabolismen av Haas. Men ville inter-individuell variasjon i aktiviteten til andre gener i denne veien være mer sannsynlig å fortynne enn å skape falske effekter i analysene gjennomført her.
I konklusjonen, gir dette stor studie betydelig støtte til en rollen NAT2 i å endre sammenhengen mellom inntak av rødt kjøtt og særlig bearbeidet kjøtt og tykktarmskreft i japanske og afrikanske amerikanere, to populasjoner med høy risiko for denne sykdommen. Senke forbruket av rødt kjøtt, særlig bearbeidet kjøtt, kan være en effektiv metode for CRC forebygging i disse og andre befolkningsgrupper med høy frekvens av den raske NAT2 fenotype.
Metoder
Fag, genotyper og kvalitetskontroll
den japanske prøver inkludert 2,217 CRC saker og 3.788 kontroller fra den multietniske kohort studie (MEC), Fukuoka Colorectal Cancer Study (Fukuoka), Japan Public Health Center kohortstudie (JPHC) og Nagano tykktarms Cancer Study (Nagano). Den afroamerikanske prøver inkludert 527 tilfeller og 4,527 kontroller fra MEC, University of North Carolina Rektal Cancer Study (UNC) og prostata, lunge, tykktarms og eggstokkreft Screening (PLCO) Trial. Detaljer om studiedesign, genotyping og kvalitetskontrollen kan finnes i tidligere publikasjoner [33,34]. Informasjon om grunnleggende demografi og livsstilsfaktorer ble hentet fra i-person intervjuer og /eller selvstyrte strukturerte spørreskjemaer. Alle deltakende studier ble godkjent av deres respektive Institutional Review Board (University of Hawaii, Japan National Cancer Center, University of Kyushu, University of North Carolina, USA National Cancer Institute) og hadde deltakere signere en samtykkeerklæring. Den nåværende GWAS Studien ble godkjent av University of Hawaii menneske Studies Program.
I korthet ble japanske individer genotypede med Illumina 1M-Duo eller Illumina 660W-Quad matrise og afro-amerikanere på Illumina 1M-Duo eller de Illumina Omni 2.5M arrays. Prøvene ble ekskludert for lave samtalepriser, kjønn mismatch eller å være en etnisitet avvikende eller en nær (≥ andre grad) i forhold til et annet emne. I tillegg studier eller fag mangler alder, ble kjønn eller kroppsmasseindeks (BMI) ekskludert. Genotypet SNPs ble ekskludert på grunnlag av ringeprisene, konkordans priser blant dupliserte par, avvik fra Hardy-Weinberg likevekt mellom kontrollene, mendelsk feil i familien trioer eller dårlig clustering kvalitet.
I forhold til vår forrige rapport søker etter genetisk mottakelighet varianter for CRC [33], begrenset vi denne analysen til studier som inkluderte begge tilfeller og kontroller, fordi blant annet studier uten kontroll vil generere differensial distribusjoner av «miljø» faktorer (på grunn av forskjeller i spørreskjemaer og målefeil) på tvers av studier og kunne skjevhet assosiasjoner mellom «miljø» variabler og sykdom
Forut NAT2 aktivitet
NAT2 acetylering fenotype ble utledet fra en 7-SNP genotyping panel. G191A (R64Q, rs1801279), C282T (rs1041983), T341C (I114T, rs1801280), C481T (rs1799929), G590A (R197Q, rs1799930), A803G (K268R, rs1208) og G857A (G286E, rs1799931), som anbefalt tidligere [10,11]. Bortsett fra G590A (R197Q, rs1799930) og G857A (G286E, rs1799931) i den japanske data (både regnet med R
2 = 1), de andre SNPs ble genotypet i begge etniske grupper. Haplotype utfasing ble utført med BEAGLE [35], ved hjelp av tusen genomer Project (fase 1, slipper 3) Østasiater som referansepaneler for de japanske data, og europeere og afrikanere som referansepaneler for afroamerikanske data. Personer med to, en og ingen «raske» alleler (Nat2 * 4, NAT2 * 11A, NAT2 * 12A, B, C og Nat2 * 13) ble tildelt den «raske», «middels» og «treg» NAT2 fenotype kategori hhv. Rs1495741 ble genotypet i begge etniske grupper.
Statistical Analysis
De japanske og afroamerikanske studier ble analysert separat. Logistisk regresjon ble brukt for å teste de viktigste effektene av NAT2, inntak av bearbeidet kjøtt, rødt kjøtt uten bearbeidet kjøtt, og total rødt kjøtt, og samspillet mellom NAT2 og kjøtt inntak variablene på CRC risiko, justert for alder, kjønn, studere , BMI og de første 4 viktigste komponentene i genetisk avstamning å kontrollere for befolkningen lagdeling. NAT2 ble modellert både som en lineær sikt (hurtig /middels /treg). Kjøtt inntak ble gruppert inn i 4 kategorier basert på studiespesifikke kvartil er definert fra fordelinger blant sakene for å maksimere makt. Interaksjon mellom NAT2 aktivitet (langsomme = 1, middels = 2; hurtig = 3) og kjøtt inntakskvartiler (1 til 4) ble testet ved anvendelse av en kryss-produkt ledd. P-verdier fra Wald test for samhandling innen hver etnisk gruppe ble verifisert av likelihood ratio test (LRT). Stratifiserte analyser av NAT2 fenotype ble utført for å tolke interaksjonseffekter. Resultatene i de japanske og afroamerikanske studier ble kombinert i meta-analyser ved hjelp av en fast effekt modell og jeg
2 ble beregnet til å vurdere mellom-etniske gruppen heterogenitet [36].
I sensitivitetsanalyser, vi undersøkte heterogenitet av de viktigste effektene for kjøtt variabler av studiet innenfor befolkningen (japansk eller afro-amerikanere) med LRT. I begge etniske grupper, sjekket vi om de viktigste effektene av kjøtt variabler ble endret av den ekstra justering for andre risikofaktorer [paknings år med røyking (0, 20, ≥20), kalsium og folat inntak (fra mat bare for det japanske og fra matvarer og kosttilskudd for afro-amerikanere, basert på data tilgjengelighet) og kostfiber inntaket], hvor kostholdsfaktorer ble kategorisert i studiespesifikke tertiles. I den japanske data, der utvalgsstørrelsen var større, vi også sjekket om samspillet mellom NAT2 og kjøttinntak ble endret av denne ekstra justering. I japansk, ble de viktigste effektene av rødt kjøtt og samspillet mellom NAT2 og rødt kjøtt også undersøkt av anatomiske sekundært (colon vs. endetarm).
Det ble rapportert at i kaukasiere, rs1495741 alene spådde NAT2 fenotype utledes fra 7-SNP panel med høy nøyaktighet. Vi sammenlignet avtalen av Nat2 fenotyper utledes fra rs1495741 alene med dem utledes fra 7-SNP panel med 3 × 3 kontin bord, hver for seg i japansk og afro-amerikanere.
Alle analyser ble utført med
R
3.0 (The Comprehensive R Archive Network https://www.r-project.org/). Alle testene var to-sidig og brukt et signifikansnivå på 0,05.
Hjelpemiddel Informasjon
S1 Table. Sammenhenger mellom NAT2 og endetarmskreft i japanske, afrikanske amerikanere, og når de to gruppene ble kombinert
doi:. 10,1371 /journal.pone.0144955.s001 plakater (docx)
S2 Table. Studie-spesifikke cut-poeng for fire-kategorien rødt kjøtt inntak
doi:. 10,1371 /journal.pone.0144955.s002 plakater (docx)
S3 Table. Association (odds ratio og 95% konfidensintervall) mellom kjøttinntak og endetarmskreft, med justering for andre risikofaktorer
doi:. 10,1371 /journal.pone.0144955.s003 plakater (docx)
S4 Table. Association of kjøtt inntaket med kolorektal kreft på japansk, stratifisert etter NAT2 fenotype, med justering for andre risikofaktorer
doi:. 10,1371 /journal.pone.0144955.s004 plakater (docx)
S5 Table. Sammenheng mellom rs1495741 genotype og inferred 7 SNP-baserte NAT2 fenotype i de japanske og afroamerikanske studier
doi:. 10,1371 /journal.pone.0144955.s005 plakater (docx)
