Abstract
Bakgrunn
Prostatakreft representerer den ledende årsak til mannlig død over hele verden. En fersk genom-wide forening studie (GWAS) identifisert fem roman mottakelighet loci for prostatakreft i den japanske befolkningen. Denne studien er å gjenskape og fine kartet potensialet sammenslutning av disse fem loci med prostatakreft i det kinesiske Han befolkningen.
Metoder
I fase I av studien, vi testet fem enkelt nukleotid polymorfismer (SNPs) som viste den sterkeste foreningen bevis i den opprinnelige GWAS på japansk. Studien Utvalget består av 1169 kinesiske Hans, bestående av 483 pasienter og 686 friske kontroller. Så i fase II, flankerer SNPs av vellykket kopiert SNPs i fase I ble genotypet og testet for tilknytning til prostatakreft til fine kartet de signifikant sammenheng signaler.
Resultater
Vi lykkes replikert foreningen av
rs13385191 plakater (ligger i
C2orf43
genet,
P
= 8,60 × 10
-5),
rs12653946 product: (
P
= 1,33 × 10
-6),
rs1983891 product: (
FOXP4
,
P
= 6,22 × 10
-5), og
rs339331 product: (
GPRC6A /RFX6
,
P
= 1,42 × 10
-5) med prostatakreft. Den mest betydningsfulle odds ratio (OR) ble registrert som 1,41 (95% konfidensintervall 1,18 til 1,68) for
rs12653946
.
Rs9600079
ikke viste signifikant sammenheng (
P
= 8.07 × 10
-2) med prostatakreft i denne studien. Fase II-studien raffinert disse foreningen signalene, og identifisert flere SNPs viser mer signifikant sammenheng med prostatakreft enn de aller SNPs testet i fase I.
Konklusjoner
Våre resultater gir ytterligere støtte for foreningen av
C2orf43
,
FOXP4
,
GPRC6A Hotell og
RFX6
gener med prostatakreft i Øst-asiatiske populasjoner. Denne studien preget også romanen loci rapportert i den opprinnelige GWAS med flere detaljer. Videre arbeid er fortsatt nødvendig for å bestemme de funksjonelle varianter og til slutt klargjøre de underliggende biologiske mekanismer
Citation. Long Q-Z, Du Y-F, Ding X-Y, Li X, Song W-B, Yang Y, et al. (2012) Replication og fine Mapping for Forbund
C2orf43
,
FOXP4
,
GPRC6A Hotell og
RFX6
Gener med prostatakreft i den kinesiske befolkningen . PLoS ONE 7 (5): e37866. doi: 10,1371 /journal.pone.0037866
Redaktør: Karl X. Chai, University of Central Florida, USA
mottatt: 04.01.2012; Godkjent: 26 april 2012; Publisert: May 25, 2012
