Abstract
Bakgrunn
Dødsfall-assosiert protein kinase1 (
DAPK1
) er en viktig tumor suppressor genet. DNA metylering kan inaktivere gener, som ofte har blitt observert i kreftutvikling av livmorhalskreft. I løpet av de siste tiårene, har mange studier utforsket sammenhengen mellom
DAPK1
promoter metylering og livmorhalskreft. Men mange studier ble begrenset av den lille prøvene størrelse og funnene var inkonsekvent blant dem. Derfor gjennomførte vi en meta-analyse for å vurdere sammenhengen mellom
DAPK1
promoter metylering og livmorhalskreft.
Metoder
Vi systematisk søkt utvalgte studier i PubMed, Web of Science, EMBASE og CNKI databaser. Ved hjelp av meta-regresjon, subgruppeanalyse og sensitivitetsanalyse, utforsket vi de potensielle kilder til heterogenitet. Den odds ratio (OR) og 95% konfidensintervall (95% KI) ble beregnet ved meta-analyse i R.
Resultater
I alt 15 studier 2001-2012, bestående av 818 tumorvev prøver og 671 normale vev prøvene ble analysert i denne meta-analysen. Frekvensen av
DAPK1
promoter metylering varierte fra 30,0% til 78,6% (median, 59,3%) i livmorhalskreft vev og 0,0% til 46,7% (median, 7,8%) i normal cervical vev. Den sammenslåtte OR var 19,66 (95% CI = 8,72 til 44,31) med tilfeldig effekt-modell, og heterogenitet ble funnet gjennom sensitivitetsanalyse.
I
2
= 60% (
P
= 0,002) ble redusert til
I
2
= 29,2% (
P
= 0,144) når en heterogen studien ble ekskludert, og den samlede OR økt til 21,80 (95% KI = 13,44 til 35,36) med fast effekt-modell.
Konklusjon
resultatene antydet en sterk Sammenhengen mellom
DAPK1
promoter metylering og livmorhalskreft. Denne studien viste også at
DAPK1
promoter metylering kan være en biomarkør under livmorhalskreftutvikling som kan tjene som en tidlig indikasjon på livmorhalskreft
Citation. Xiong J, Li Y, Huang K, Lu M, Shi H, Ma L, et al. (2014) Sammenheng mellom
DAPK1
Arrangøren Metylering og livmorhalskreft: A Meta-Analysis. PLoS ONE ni (9): e107272. doi: 10,1371 /journal.pone.0107272
Redaktør: Xuefeng Liu, Georgetown University, USA
mottatt: 17 mars 2014; Godkjent: 13 august 2014; Publisert: 30.09.2014
Copyright: © 2014 Xiong et al. Dette er en åpen-tilgang artikkelen distribueres under betingelsene i Creative Commons Attribution License, som tillater ubegrenset bruk, distribusjon og reproduksjon i ethvert medium, forutsatt den opprinnelige forfatteren og kilden krediteres
Finansiering:. Dette arbeidet ble støttet av Natural Science Foundation National of China (nr 81071663). Finansiører hadde ingen rolle i studiedesign, datainnsamling og analyse, beslutning om å publisere, eller utarbeidelse av manuskriptet
Konkurrerende interesser:.. Forfatterne har erklært at ingen konkurrerende interesser eksisterer
Innledning
livmorhals~~POS=TRUNC kreft~~POS=HEADCOMP er den tredje vanligste kreftformen, etter brystkreft og tykktarmskreft blant kvinner over hele verden, med 529,500 estimerte nye tilfeller og 275.000 dødsfall i 2008 i henhold til Ferlay et al. [1]. Utviklingen av invasiv livmorhalskreft er en gradvis prosess som skjer over en lang periode, fra cervical intraepitelial neoplastisk (CIN) lesjoner til livmorhalskreft. Således er det av avgjørende betydning å detektere forstadier til kreft for å hindre utvikling av livmorhalskreft. Selv om infeksjon med humant papillomavirus (HPV) er en akseptert viktig risikofaktor for livmorhalskreft [2], bare en liten andel av HPV-infiserte pasienter utvikle invasiv livmorhalskreft [3]. Andre risikofaktorer kan også bidra til dannelsen av denne krefttypen.
Hypermethylation av promotorområdene av tumorsuppressorgener kan føre geninaktivering, noe som er viktig i patogenesen av kreft, og vanligvis forekommer i de tidlige stadier av kreftutvikling i forskjellige typer kreft, inkludert kreft i livmorhalsen [4], [5]. DNA rmethylation er en tidlig begivenhet i karsinogenese, og er ofte relatert til en transkripsjonen blokk og tapet av et aktuelt protein [6]. Fordi
DAPK1
er en viktig tumor suppressor gen som har blitt studert, utførte vi en meta-analyse for å vurdere sammenhengen mellom
DAPK1
promoter metylering og livmorhalskreft.
materialer og metoder
studier søke og utvelgelseskriterier
Vi systematisk gjennomgått studier av
DAPK1
promoter metylering i livmorhalskreft, og forsøkte å finne kvalifiserte studier innen PubMed, EMBASE , Web of Science og CNKI, ved hjelp av ulike kombinasjoner av Medical Subject Headings (meSH) og ikke-meSH termer. Søkeordene var «cervical cancer», «
DAPK1
«, og «metylering», mens søkestrategien ble utført i PubMed med «livmorhals svulster» (mesh), «
DAPK1
» og «metylering». Studien ble gjennomført til 1 november 2013 uten språk begrensning
Studiene for inkludering i denne meta-analysen måtte oppfylle følgende standarder:. (I) studier vurdert foreningen av
DAPK1
metylering og livmorhalskreft, (ii) studiene følger med detaljert informasjon om frekvensen av
DAPK1
metylering for både kreft gruppen og normal kontrollgruppe, (iii) fremgangsmåter for påvisning av
DAPK1
metylering var begrenset til metylering spesifikke polymerase chain reaction (MSP) og sanntids kvantitativ polymerase chain reaction (QMSP)
studier ble ekskludert basert på følgende kriterier:. (i) studier gjorde ikke har en normal gruppe (kontrollgruppen), (ii) rådata kan ikke isoleres fra studiene der kreften gruppen (sak gruppe) også finnes personer med ulike typer forstadier til kreft som Atypisk plateepitel celler av usikker betydning ( ASCUS), Low-grade squamous intraepitelial lesjoner (LSIL), og høy grad av plateepitel intraepitelial lesjoner (HSIL), (iii) en case-control studien ikke har hyppigheten av
DAPK1
metylering.
data~~POS=TRUNC Extraction
To forfattere uavhengig gjennomført uttak av data fra de utvalgte studiene. Den hentet informasjon inneholdt følgende: Første forfatterens navn, årstall, pasientenes etnisiteter, metodene som brukes ved måling av
DAPK1
metylering, vevet kilde til kontrollgruppen, gjennomsnittsalderen av saken gruppe og antall deltakere i saken og kontrollgruppene. All informasjonen ble bekreftet av tre anmeldelser.
For å vurdere kvaliteten på studiene, Newcastle-Ottawa skala (NOS) (https://www.ohri.ca/programs/clinical_epidemiology/oxford.asp) ble gjennomført for kvalitetsvurdering av observasjonsstudier. NOS er en kvalitetsvurdering verktøy som ofte brukes for ikke-randomisert studier, spesielt case-control og kohortstudier, inkludert i systematiske. Det har også vært mye brukt i systematiske gjennomganger av ikke-randomisert studier av The Cochrane Collaboration
Det er maksimalt ni «stjerner» for hvert element:. Fire stjerner til valg av studiegruppene, to stjerner til sammenlignbarhet av gruppene, og tre stjerner til konstatering av utfallet av interesse. Evalueringen ble utført uavhengig av to anmeldelser. Studier med kvalitetspoeng større enn eller lik 6 ble inkludert.
Statistisk analyse
ORS og 95% CI’er ble beregnet til å vurdere sammenhengen mellom
DAPK1
promoter metylering og livmorhalskreftrisiko.
x
2-basert Cochran Q statistikk test og
Jeg
2 statistikk ble brukt til å teste heterogenitet blant de inkluderte studiene [7]. Betydelig heterogenitet ble bekreftet hvis
P
0,05;
Jeg
2 50% ble også ansett for å demonstrere betydelig heterogenitet [8]. Deretter ble en tilfeldig effekt-modell (den DerSimonian-Laird estimator) som brukes til å beregne de samlede ORS; ellers, ble en fast effekt-modell (den Mantel-Haenszel metoden) anvendt [9]. En meta-regresjon (begrenset maksimal sannsynlighet estimatoren-metoden) ble benyttet for å utforske kilden til heterogeniteten. Videre ble en undergruppe analyse utført for å vurdere kilden til heterogeniteten, og t
2 ble benyttet for å bestemme hvor mye heterogeniteten kan forklares ved forskjeller undergruppeidentifiserere. En sensitivitetsanalyse ble benyttet for å finne relativt dårlig kvalitet studier av utelatelsen av en enkelt studie om gangen, og for å se om en bestemt unnlatelse kan påvirke den samlede eller verdi. Trakten tomter [10] og Egger test ble brukt for å evaluere publikasjonsskjevhet. Den feilsikre nummer var også en indikator for å vurdere publikasjonsskjevhet. En asymmetrisk tomten foreslått en mulig publikasjonsskjevhet og
P
verdien av Egger test mindre enn 0,05 ble ansett for å være representativ for en statistisk signifikant publikasjonsskjevhet [10].
Alle statistiske analyser ble beregnet med Meta-pakke (versjon 2,5 til 1) i R (versjon 3.0.1, https://www.r-project.org/).
Resultater
Søkeresultater og studere Kjennetegn
i alt 15 studier som innlemmet 1489 pasienter ble inkludert i denne meta-analyse (fig 1). I alt ble 110 studier opprinnelig funnet etter et søk av de ovennevnte databaser, men 34 studier ble ekskludert på grunn av duplisering. Ved screening av titler og sammendrag av remaining76 studier, ble ytterligere 45 studier ekskludert (8 møtepapirer, en gjennomgang, en patent papir, 1 cellelinjer, 3 studier med terapi, og 31 irrelevante artikler). Elleve studier uten kontrollgruppe og 5 studier med forstadier vev som ASCUS, LSIL og HSIL i saken gruppe, noe som medførte at rådata av kreftpasienter ikke kan isoleres, ble ekskludert under prosessen med å fulltekst gjennomgang. Til slutt, 15 studier ble inkludert i denne meta-analyse [3], [11] – [24]. Antallet tilfeller varierte 22-350 blant studier med deltakere fra Asia (8 studier), Nord-Afrika (en studie), Europa og Nord-Amerika (7 studier). For de 15 studier, 5 studier anvendt i sanntid kvantitativ polymerasekjedereaksjon (QMSP) og de andre 10 studiene benyttet metylering-spesifikke polymerase kjedereaksjon (MSP) for å detektere
DAPK1
metylering i tilfelle gruppen og i kontrollgruppen (tabell 1).
Kvalitetsvurdering
resultatet av NOS vist at den laveste poengsummen var seks og høyest poengsum var 9 med en median score på 7,2. De fleste studier brukt friske frivillige fra sykehuset som kontroller unntatt de av Feng et al. [12] og Sun et al. [21]. Studien av Leung et al. [17] var den eneste hvor kontroll vev ble avledet fra nærliggende normalt vev (tabell 2).
Meta-regresjon og subgruppeanalyser
x
2
basert Cochran Q statistikk test og
jeg
2 statistikk funnet signifikant heterogenitet blant de 15 studiene (
i
2
= 60,0%,
P
= 0,002). Det ble observert en sterk sammenheng mellom
DAPK1
promoter metylering og livmorhalskreft med en samlet OR av = 19,66 (95% CI = 8,72 til 44,31) basert på tilfeldig effekt-modell (Fig. 2). For dette resultatet, vi prøvde å finne den mulige kilden til heterogenitet. Basert på tidligere studier og vår nåværende kunnskap, vi først brukt en multippel regresjonsmodell med fem variabler basert på årstall, etnisitet, metode, kilden til kontroller, og saken utvalgsstørrelsen. Case-grupper som utvalgsstørrelsen var mindre enn 60, ble klassifisert som gruppe A, mens de andre gruppene ble klassifisert som gruppe B. Gjennom regresjonsmodell, fant vi ikke en betydelig heterogenitet for de fem variablene nevnt ovenfor (Tabell 3). Vi gjennomførte en subgruppe analyse for å vurdere kilden til heterogenitet videre.
En av undergruppene i henhold til etnisitet, metode, og saken prøvestørrelsen. OR var 18.22 i kaukasiere (95% CI = 3,35 til 99,03; tilfeldig effekt-modell) og 17,88 (95% KI = 10,29 til 31,07, fast effekt-modell) i ikke-kaukasiere,
I
2
verdi ble innhentet separat og var fast bestemt på å være 75,9% og 42,6% sammenlignet med hele studiegruppen (
i
2
= 60%). Med denne metoden ORS fra studiene som brukte MSP var 19,10 (95% KI = 11,11 til 32,84, fast effekt-modell) og 15,30 (95% CI = 2,34 til 99,66; tilfeldig effekt-modell). Tilsvarende OR i gruppe A var 25,80 (95% KI = 12.56-53.02, faste effekter modell) mens OR i gruppe B var 13,55 (95% CI = 3,93 til 46,73; tilfeldig effekt-modell). (Tabell 4)
følsomhets~~POS=TRUNC analyse~~POS=HEADCOMP og subgruppeanalyser
resultatet av sensitivitetsanalyse viste at OR verdien varierte fra 13,97 (95% CI = 8,94 til 21,83) til 21,80 (95% KI = 13.44- 35.36) med en samlet OR av = 15,32 (95% CI = 9,97 til 23,66) med fast effekt-modell (fig. 3). Etter at utelatelse av den heterogene studien (Yang et al., 2010), den samlede OR endret seg dramatisk i forhold til når andre studier ble fjernet. I tillegg den første heterogenitet (
I
2
= 60,0%,
P
= 0,002) ble redusert til
I
2
= 29,2% (
P
= 0,144) med en samlet OR av = 21,80 (95% KI = 13,44 til 35,36;. fast effekt-modell) når den heterogene studien ble fjernet (Yang et al, 2010) (figur 4).. Når vi har gjort en videre analyse basert på etnisitet, metode, og saken sample størrelse, resultatene viste at heterogenitet i kaukasiere, QMSP metode og større utvalg forsvant når dataene fra den heterogene studien ble fjernet (Yang et al., 2010) (tabell 5).
publiseringsskjevheter
trakt plott og Egger test ble utført for å vurdere publikasjonsskjevhet av litteraturen. Formen av trakten plottet i Figur 5 viser en mulig asymmetri, men Egger test resulterte i
P
= 0,551, noe som indikerer at publikasjonsskjevhet var meget lav; ingen signifikant skjevhet ble funnet blant de inkluderte studiene. Den feilsikker nummer (Z = 61,12, NFS
0,05 = 1374,98, NFS
0,01 = 674,13) indikerte også at graden av publikasjonsskjevhet var svært liten.
Diskusjoner
dødsfall-assosiert protein kinase1 (
DAPK1
) kunne mekle celledød via IFN-gamma og kan føre til tumor patogenesen og metastase når inaktivert [25]. Nylig har flere studier vist at DNA-metylering endringer er involvert i kreft initiering og progresjon, og kan brukes til å forutsi diagnose og prognose av humane sykdommer og maligniteter [26], [27]. Tapet av
DAPK1
ekspresjon, hovedsakelig ved hypermethylation av dets promoter-regionen, forbedrer metastatisk potensial av kreftceller, og har vist seg å forekomme i en rekke kreftformer, inkludert kreft i livmorhalsen [14], [ ,,,0],24]. Selv om HPV-infeksjon er en av de viktigste risikofaktorene, gjør flertallet av pasienter med HPV-infeksjon ikke utvikle livmorhalskreft. HPV-infeksjon alene ikke er tilstrekkelig for ondartet transformasjon av livmorhalsen, noe som tyder på potensielle roller av andre genetiske og epigenetiske hendelser i livmorhalskreftutvikling [11].
resultatet av den samlede OR var 19,66 (95% KI = 8.72- 44.31) med tilfeldig effekt-modell (figur 1), som viste at
DAPK1
promoter metylering er assosiert med livmorhalskreft og derfor at det kan spille en viktig rolle i patogenesen av livmorhalskreft. Dette resultatet var i overensstemmelse med resultatene fra tidligere undersøkelser [11], [20]. Imidlertid betydelig heterogenitet ble observert i de 15 studier, og grunnen til heterogeniteten kan ikke bli forklart i begynnelsen. For å utforske mulige kilden til heterogenitet, gjennomførte vi en meta-regresjon og subgruppeanalyse. Resultatene viste en viss heterogenitet i hvite, den QMSP fremgangsmåte og i et større utvalg gjennom undergruppeanalyse (tabell 4); Da gjennomførte vi en sensitivitetsanalyse for å finne kilden til heterogenitet. Studien av Yang et al. (2010) synes å være den heterogene studie som påvirket meta-analyse, som
I
2
= 60% (
P
= 0,002) ble redusert til
I
2
= 29,2% (
P
= 0,144) da denne studien ble utelatt (fig 4). Dessuten bekreftet ytterligere statistisk analyse heterogenitet av studiet av Yang et al. (2010), og ingen signifikant heterogenitet av de resterende 14 studier (tabell 5).
Når den heterogene studien ble utelatt, ble slått sammen OR verdi økte 15,32 til 21,80 (fast effekt-modell), som foreslo en sterkere assosiasjon mellom
DAPK1
promoter metylering og livmorhalskreft. Den heterogenitet presentert i QMSP ble redusert fra
I
2
= 78,8% til
I
2
= 0,0%, noe som indikerte at metoden for QMSP er bedre enn for MSP. Denne konklusjonen var i overensstemmelse med studie av Eads et al. [28]. Den heterogenitet i kaukasiere også redusert fra
I
2
= 75,9% til
I
2
= 0,0%, noe som kan ha blitt forårsaket av to hovedgrunner. Først påvisning av
DAPK1
promoter metylering i kaukasiere ved QMSP metoden utelukket studie av Flatley et al .. Den andre grunnen kan være at heterogenitet i kaukasiere er relativt liten. Publikasjonsskjevhet ble evaluert gjennom trakt plott og Egger test, og den Egger test viste
P
= 0,551, noe som indikerte at det var ingen signifikant publikasjonsskjevhet. Den fail-safe antall ytterligere bekreftet at trenden for publikasjonsskjevhet var svært liten.
Denne metaanalysen hadde noen begrensninger. Den første begrensningen var at enkelte studier ikke gi detaljerte opplysninger om alder av individer i saksgrupper og kontrollgrupper. Den andre begrensningen i denne meta-analysen var at enkelte studier ikke avsløre stadium av livmorhalskreft eller subtype, som også kan være kilder til heterogenitet. Tatt i betraktning det lille antallet artikler som er beskrevet av stadium og type av livmorhalskreft, strømmen var for liten til å gjøre en undergruppe for dem. Andre konfunderende variabler som metode, etnisitet, utvalgsstørrelse, og kilden av kontroll kan også forekomme. Publikasjonsskjevhet var den tredje begrensning. Noen upubliserte og negative studier kan bidra til en viss skjevhet om ingen signifikant publikasjonsskjevhet ble oppdaget etter Egger test.
I konklusjonen ble det observert en sterk sammenheng mellom
DAPK1
promoter metylering og livmorhalskreft, og derfor
DAPK1
promoter metylering kan være verdifull som en biomarkør. Tatt i betraktning at kvaliteten og kvantiteten av de gjennomgåtte artiklene var begrenset, bør større og godt designede studier brukes i fremtiden for ytterligere bekreftelse på sammenhengen mellom
DAPK1
promoter metylering og livmorhalskreft.
Hjelpemiddel Informasjon
Sjekkliste S1.
PRISMA Sjekkliste
doi:. 10,1371 /journal.pone.0107272.s001 plakater (DOC)
Takk
Vi vil gjerne takke Wei Shen, Wang Man, Xiaofang Du og Deng Song for deres nyttige hjelp.
