Abstract
Bakgrunn
For å undersøke sammenhengen mellom
XPD
Asp312Asn polymorfisme og hode- og halskreft risiko gjennom denne meta-analysen.
Metoder
Vi utførte en meta-analyse av 9 publiserte kasus-kontrollstudier inkludert 2,670 pasienter med hode- og nakkekreft og 4452 kontroller. En odds ratio (OR) med 95% konfidensintervall (KI) ble brukt for å vurdere sammenhengen mellom
XPD
Asp312Asn polymorfisme og hode- og halskreft risiko.
Resultater
Totalt ingen signifikant sammenheng mellom
XPD
Asp312Asn polymorfisme og hode og nakke kreft risiko ble funnet i denne meta-analyse (Asn /Asn vs. Asp /Asp: OR = 0,95, 95% CI = 0,80 til 1,13
P
= 0,550,
P
heterogenitet = 0,126; Asp /Asn vs. Asp /Asp: OR = 1,11, 95% CI = 0,99 til 1,24,
P
= 0,065,
P
heterogenitet = 0,663; Asn /Asn + Asp /Asn vs. Asp /Asp: OR = 1,07, 95% CI = 0,97 til 1,19,
P
= 0,189,
P
heterogenitet = 0,627; Asn /Asn vs. Asp /Asp + Asp /Asn: OR = 0,87, 95% CI = 0,68 til 1,10,
P
= 0,243,
P
heterogenitet = 0,089). I subgruppeanalyse HWE, etnisitet og studiedesign, var det fortsatt ingen signifikant sammenheng påvist i alle genetiske modeller.
Konklusjoner
Denne metaanalyse viser at
XPD
Asp312Asn polymorfisme kan ikke være en risikofaktor for å utvikle hode og nakke kreft
Citation. Hu YY, Yuan H, Jiang GB, Chen N, Wen L, Leng WD, et al. (2012) Sammenhenger mellom
XPD
Asp312Asn Polymorphism og risikoen for hode og nakke kreft: en meta-analyse Basert på 7122 emner. PLoS ONE 7 (4): e35220. doi: 10,1371 /journal.pone.0035220
Redaktør: Brock C. Christensen, Dartmouth College, USA
mottatt: 26 oktober 2011; Godkjent: 12 mars 2012; Publisert: 20 april 2012
Copyright: © 2012 Hu et al. Dette er en åpen-tilgang artikkelen distribueres under betingelsene i Creative Commons Attribution License, som tillater ubegrenset bruk, distribusjon og reproduksjon i ethvert medium, forutsatt den opprinnelige forfatteren og kilden krediteres
Finansiering:. Dette arbeidet ble delvis støttet med tilskudd fra Development Foundation of Health Department of Jiangsu-provinsen (H200811) og Science Foundation Natural av Jiangsu høgskolerådet (08KJB320008) Medisinsk. Finansiører hadde ingen rolle i studiedesign, datainnsamling og analyse, beslutning om å publisere, eller utarbeidelse av manuskriptet
Konkurrerende interesser:.. Forfatterne har erklært at ingen konkurrerende interesser eksisterer
Innledning
hode og nakke kreft (HNC) utgjør ca 5% av alle krefttilfeller registrert i USA, og forekomsten er økende i de fleste utviklede land og utviklingsland. Disse kreft er anslått til å være om lag seks ganger mer vanlig blant røykere enn ikke-røykere og er mest vanlig hos menn over 50 år gammel [1], [2], som øker til omtrent 15 ganger hvis røykerne er også stordrikkere [ ,,,0],3], [4]. Selv om mange tiltak hadde blitt gjort for å bedre diagnostikk og behandling, prognose var fremdeles dårlig.
Mange miljøfaktorer, som for eksempel stråling, kosthold, røyking, og endogene eller eksogene østrogener, er assosiert med DNA-skade. Reparert eller misrepaired DNA resulterer i genmutasjoner, kromosom endringer og genomisk ustabilitet. Flere studier har antydet at gener involvert i DNA-reparasjon spiller en avgjørende rolle i å beskytte mot mutasjoner. Pasienter med visse kreftformer har redusert kapasitet for DNA-reparasjon. Tilsvarende har enzymene i nukleotid excision reparasjon (NER) pathway vært implisert i kreft. Assosiasjoner mellom polymorfismer i flere DNA-reparasjonsgener og risikoen for flere typer kreft har blitt grundig undersøkt. Mange epidemiologiske studier av kreft har fokusert på enkeltnukleotidpolymorfi (SNPs) i gener i NER sti som
XPD
,
ERCC1
, og
XPC product: [5]. Den XPD-proteinet er en DNA helikase, og er en viktig del av den TFIIH transkripsjonsfaktor kompleks. Noen studier har antydet at
XPD
polymorfismer kan være forbundet med redusert DNA-reparasjon på grunn av en mulig reduksjon i helikaseaktivitet [6], [7]. En av de vanligste
XPD
polymorfismer i de kodende regionene er Asp312Asn i exon 10. funksjonell betydning er ennå ikke helt klart, selv om de aminosyre-mutasjoner i exon 10 gir opphav til et tap av en sur rest og en fullstendig forandring i den elektroniske konfigurasjon av aminosyren [8], [9].
den første studien om forholdet mellom HNC og
XPD
Asp312Asn polymorfisme ble utført ved Sturgis et al. [10]. De fant en border signifikant sammenheng mellom
XPD
Asp312Asn polymorfisme og HNC. Siden da har en rekke studier bekreftet eller motbevist dette funnet [11] – [18]. I 2010 ble en fersk meta-analyse utført av Flores-Obando et al. [19] viste at økt HNC risiko er forbundet med
XPD
Asp312Asn polymorfisme. Verdt å merke at meta-analysen inkluderte fem studier ble utført hos kaukasiske populasjoner og en i en asiatisk befolkning [10] – [15]. I dag, ni case-control studier på
XPD
Asp312Asn polymorfisme og HNC risiko har blitt publisert. trengs en omfattende meta-analyse for å gi en oppdatert tilnærming på det generelle forholdet. Subgruppeanalyser ble også utført på kaukasiske og asiatiske populasjoner for å undersøke etnisitet spesifikke effekter.
Metoder
Søkestrategi
PubMed-databasen ble søkt med begrepene «hode og nakke kreft «,» oral cancer «,» orofaryngeal kreft «,» strupekreft «,» svelget kreft «,» XPD «,» excision reparasjon kryss utfyller gruppe 2 «,» polymorfisme «, og de kombinerte setningene for alle genetiske studier på forholdet mellom
XPD
polymorfisme og HNC risiko fra 2000, da den første studien av sammenhengen mellom
XPD
Asp312Asn polymorfisme og HNC risiko ble rapportert, til oktober 2011. Vi har også brukt «Relaterte artikler . «i PubMed for å identifisere ytterligere studier om samme tema referanselister i hentede artiklene ble også screenet for Alle valgte studier oppfylte følgende tre kriterier:. (a) case-control studie på
XPD
Asp312Asn polymorfisme og HNC risiko, (b) tilstrekkelige publiserte data for å anslå odds ratio (OR) med 95% konfidensintervall (KI); (C) For flere publikasjoner som rapporterer på de samme data eller overlappende data, den største eller nyeste utgivelse ble valgt [20].
Data utvinning
To etterforskere (Hu og Yuan) uavhengig hentet følgende data fra hver inkludert publikasjon: den første forfatterens navn, publikasjonsdata, kilder til kontroller, rase nedstigningen av studiepopulasjonen (kategorisert som enten asiatisk eller kaukasisk), genotyping metode, antall saker, saker og kontroller med ulike genotyper, og Hardy-Weinberg likevekt (HWE).
Statistisk analyse
Crude ORS med 95% CI’er ble beregnet å vurdere styrken på korrelasjonen mellom
XPD
Asp312Asn polymorfisme og HNC fare. De sammenslåtte Ors ble utført for codominant modell (Asn /Asn vs. Asp /Asp, Asp /Asn vs. Asp /Asp), dominerende modellen (Asn /Asn + Asp /Asn vs. Asp /Asp), og recessive modell (Asn /Asn vs. Asp /Asp + Asp /Asn), henholdsvis. I subgruppeanalyse, ble statistisk analyse utført på asiatere og kaukasiere. Heterogenitet antakelsen ble vurdert av chi-kvadrat basert Q-test [21]. Den sammenslåtte OR estimering av hver studie ble beregnet av fast-effekt modellen (Mantel-Haenszel metoden) når
P
0,10. Ellers ble det tilfeldig effekt-modellen (DerSimonian og Laird metode) benyttes [22]. Potensialet publikasjonsskjevhet ble anslått av den modifiserte Egger lineære regresjon test, som foreslått av Harbord et al. [23]. Statistisk analyse ble utført ved hjelp av Stata versjon 11.0 (Stata Corporation, College Station, TX, USA) og omtale Manage (v.4.2, Oxford, England), ved hjelp av tosidige P-verdier, med
P
0,05 ansett som statistisk signifikant.
Resultater
Study karakteristisk
Denne meta-analysen er styrt av PRISMA regnskapet (Sjekkliste S1). Totalt 49 relevante studier ble identifisert (figur 1). Etter nøye gjennomgang, ni kvalifiserte case-control studier om forholdet mellom
XPD
Asp312Asn polymorfisme og HNC risiko ble inkludert i denne meta-analyse [10] – [18]. Tabell 1 viser de viktigste kjennetegnene på disse studiene. Syv studier involverte kaukasiske populasjoner [10] – [12], [14] – [16], [18], mens to studier involvert asiater [13], [17]. Diverse genotyping metoder ble brukt, inkludert PCR-SSCP, PCR-RFLP, Taqman, Real-time PCR og SEB PCR. Alle studier indikerer at det genotypisk fordeling av kontrollene var i samsvar med HWE bortsett fra én [17].
Meta-analyse
De viktigste resultatene av denne meta-analyse og heterogenitet testen er vist i tabell 2. Totalt ble det observert noen signifikant sammenheng mellom
XPD
Asp312Asn polymorfisme og HNC risiko i total populasjoner (for Asn /Asn vs. Asp /Asp: OR = 0,95, 95% CI = 0,80 til 1,13,
P
= 0,550,
P
heterogenitet = 0,126; Asp /Asn vs. Asp /Asp: OR = 1,11, 95% CI = 0,99 til 1,24
P
= 0,065,
P
heterogenitet = 0,663; Asn /Asn + Asp /Asn vs. Asp /Asp: OR = 1,07, 95% CI = 0,97 til 1,19,
P
= 0,189,
P
heterogenitet = 0,627; Asn /Asn vs. Asp /Asp + Asp /Asn: OR = 0,87, 95% CI = 0,68 til 1,10,
P
= 0,243,
P
heterogenitet = 0,089). Tilsvarende, i den etterfølgende analysen av Hwe studier, ble ingen signifikant sammenheng finnes mellom
XPD
Asp312Asn polymorfisme og HNC risiko (for Asn /Asn vs. Asp /Asp: OR = 0,95, 95% CI = 0,80 til 1,14
P
= 0,593,
P
heterogenitet = 0,120; Asp /Asn vs. Asp /Asp: OR = 1,11, 95% CI = 0,99 til 1,24,
P
= 0,089,
P
heterogenitet = 0,586; Asn /Asn + Asp /Asn vs. Asp /Asp: OR = 1,07, 95% CI = 0,96 til 1,19,
P
= 0,219,
P
heterogenitet = 0,528; Asn /Asn vs. Asp /Asp + Asp /Asn: OR = 0,82, 95% CI = 0,69 til 1,11,
P
= 0,278,
P
heterogenitet = 0,082). Til slutt, i den lagdelte analyse av etnisitet og studiedesign, vi også fant ingen signifikant sammenheng mellom
XPD
Asp312Asn polymorfisme og HNC.
Følsomhetsanalyse
En enkelt studie er involvert i den meta-analyse ble slettet hver gang for å reflektere påvirkning av de enkelte datasettet til de sammenslåtte ORS. Analyseresultatene viser et grense økt risiko etter eksklusiv undersøkelsene at i Asp /Asn Asp vs. /Asp modell [14], [16], [18] (figur 2). De andre tilsvarende sammenslåtte ORS ble ikke vesentlig endret (data ikke vist), noe som indikerer at resultatene er statistisk robust.
publiseringsskjevheter
Trakt tomten og modifisert Egger test ble utført for å estimere den publikasjonsskjevhet av litteratur. Figurer av trakt tomter i alle genetiske modeller viste ingen tegn på åpenbar asymmetri. Figur 3 viser figurer av trakt tomter på codominant modell (Asp /Asn vs. Asp /Asp), som brukes i studiene for å undersøke alle befolkningsgrupper. Resultatet ble også støttet av analyse via modifiserte Egger tester. Ingen signifikant publikasjonsskjevhet ble funnet i denne meta-analyse (
P
= 0,093 for Asn /Asn vs. Asp /Asp;
P
= 0,370 for Asp /Asn vs. Asp /Asp;
P
= 0,173 for Asn /Asn + Asp /Asn vs. Asp /Asp;
P
= 0,215 for Asn /Asn vs. Asp /Asp + Asp /Asn)
.
Hvert punkt representerer en egen studie for den angitte foreningen.
Diskusjoner
i dag har genetisk disposisjon for kreft tilt økende oppmerksomhet til studiet av genet polymorfismer som er involvert i tumordannelse.
XPD
genet er kartlagt til kromosom 19q13.3 og det består av 23 eksoner. Germline mutasjoner i
XPD
genet kan føre til xeroderma pigmentosum og andre sykdommer. Den XPD proteinet er involvert i transkripsjon-coupled NER og er en integrert medlem av basaltranskripsjonsfaktor BTF2 /TFIIH kompleks.
Asp til Asn forandring i posisjon 312 av XPD endrer elektronisk konfigurasjon av aminosyre og endrer interaksjonen mellom XPD-proteinet og dets helikase aktivator [6]. Wolfe et al. viste at 312 kodon polymorfismer betydelig redusere de konstituerende ERCC2 mRNA nivåer, særlig hos røykere [24]. Hou et al. rapporterte at
XPD
312 variant allel kan være forbundet med den reduserte reparasjon av aromatiske DNA-addukter [25]. Matullo et al. slås at eksponering for miljøkreftfremkallende, for eksempel polysykliske aromatiske hydrokarboner (PAH), også akselerere kreftutvikling gjennom kodon 312 variant allel av
XPD product: [26].
Korrelasjon mellom polymorfismer og noen kreftrisiko har blitt studert, men resultatene er fortsatt kontroversielt.
XPD
Asp312Asn polymorfisme har vist seg å øke risikoen for blærekreft og lungekreft, men det er ikke forbundet med brystkreft [27] -. [29]
Den første studien, utgitt i 2002, avdekket en border sammenheng mellom
XPD
Asp312Asn polymorfisme og HNC risiko i codominant modell (for Asn /Asn vs. Asp /Asp: OR, 1.41; 95% KI: 1,01 til 1,97) [10] . Til dags dato har ingen enighet er oppnådd på sammenhengen mellom
XPD
Asp312Asn polymorfisme og HNC risiko. Majumder et al. [13] fant at variant genotype (Asn /Asn) i kodon 312 av
XPD
er assosiert med økt risiko for kreft blant raske og mellom acetylators (OR = 1,9, 95% KI = 01.02 til 02.09). Men andre studier viste at HNC risikoen ikke er signifikant relatert til
XPD
Asp312Asn polymorfisme. Ji et al. [17] fant at OR av den Asp312Asn polymorfisme genotypen Asp /Asn er 1,94 (95% CI = 0,92 til 4,08) i forhold til Asp /Asp genotype. Matullo et al. [11], An et al. [12], Harth et al. [14], Abbasi et al. [15], og Jelonek et al. [16] også rapportert lignende risiko for HNC.
Den nåværende meta-analyse av ni utvalgte studier, inkludert 2670 tilfeller og 4452 kontroller med fokus på XPD Asp312Asn polymorfisme og HNC risiko, ble utført for å utlede en mer presist anslag på foreningen, men ingen signifikant sammenheng ble funnet i den totale befolkningen når alle studiene ble slått sammen. På lignende måte ble ingen signifikant sammenheng påvist i alle genetiske modeller under tilfreds analyse basert på HWE, etnisk og studiedesign. Våre funn er ikke i samsvar med det som tidligere er publisert av Flores-Obando et al [19]. En marginalt signifikant sammenheng ble observert mellom
XPD
Asp312Asn heterozygote og kombinerte varianter og HNC i sin studie. Den betydelig større utvalg av vår studie kan forklare denne forskjellen i forhold til forrige undersøkelse.
Til tross for en betydelig innsats for å teste for mulig sammenheng mellom
XPD
Asp312Asn polymorfi og HNC risiko, noen begrensninger skal rettes. For det første er disse resultatene basert på ukorrigerte anslag som mangler de opprinnelige data fra de utvalgte studier, som begrenser evalueringen av virkningene av genet-genet og genet-miljø interaksjoner under HNC utvikling. For det andre, er prøvestørrelsen fortsatt relativt liten. Dermed kunne vi ikke har nok statistiske data for å finne den sanne forholdet mellom
XPD
Asp312Asn polymorfisme og HNC risiko. Endelig er hvert gen er kjent for å ha en moderat effekt på HNC utvikling. Kombinasjoner av visse genotyper kan være mer kresne som risikofaktorer enn en enkelt locus genotype. I vår meta-analyse, ble koblingsulikevekt (LD) og haplotype analyse ikke utført. På tross av disse begrensningene, ble ingen publikasjonsskjevhet observert, og et stort antall fag fortsatt betydelig garantere statistisk styrke av analysen.
I konklusjonen, til tross for disse begrensningene, våre metaanalyse tyder på at
XPD
Asp312Asn polymorfisme kan ikke bli assosiert med HNC utvikling. I fremtiden storskala case-control og populasjonsbaserte assosiasjonsstudier er nødvendig for å validere den risiko som er identifisert i den nåværende meta-analyse og for å undersøke mulige gen-gen og gen-miljø interaksjoner mellom
XPD
Asp312Asn polymorfisme og HNC kreft.
Hjelpemiddel Informasjon
Sjekkliste S1.
PRISMA 2009 Sjekkliste.
doi:. 10,1371 /journal.pone.0035220.s001 plakater (DOC)
Takk
Vi takker alle som har hjulpet til med denne studien
