PLoS ONE: Vitamin D metabolismen Gener og kreft i bukspyttkjertelen Risk

Abstract

Bevis på sammenhengen mellom vitamin D-status og bukspyttkjertelkreft risiko er inkonsekvent. Denne inkonsekvensen kan være delvis tilskrives variasjon i vitamin D regulerer gener. Vi valgte 11 vitamin D-relaterte gener (

GC

,

DHCR7

,

CYP2R1

,

VDR

,

CYP27B1

,

CYP24A1

,

CYP27A1

,

RXRA

,

CRP2

,

CASR Hotell og

CUBN

) på totalt 213 enkelt nukleotid polymorfismer (SNPs), og undersøkte assosiasjoner med bukspyttkjertelen adenokarsinom. Vår studie inkluderte 3.583 bukspyttkjertelkreft tilfeller og 7,053 kontroller fra genom-wide association studier av kreft i bukspyttkjertelen PanScans-I-III. Vi brukte Adaptive Joint Test og Adaptive Rank avkortet Vare statistikk for sti og gen-analyser, og ubetinget logistisk regresjon for SNP analyser, justert for alder, kjønn, studere og befolkning lagdeling. Vi undersøkte effekten modifisering av sirkulerende vitamin D konsentrasjon (≤50, 50 nmol /L) for de mest betydelige SNPs ved hjelp av en undergruppe av kohort tilfeller (n = 713) og kontroller (n = 878). Vitamin D metabolske veien var ikke assosiert med kreft i bukspyttkjertelen risiko (p = 0,830). Av enkeltgener, ble ingen assosiert med kreft i bukspyttkjertelen risiko på et signifikansnivå på p 0,05. SNPs nær

VDR plakater (rs2239186),

LRP2 plakater (rs4668123),

CYP24A1 plakater (rs2762932),

GC plakater (rs2282679), og

CUBN product: (rs1810205) gener var de beste SNPs assosiert med kreft i bukspyttkjertelen (p-verdier 0.008-0.037), men ingen var statistisk signifikant etter justering for multiple sammenligninger. Assosiasjoner mellom disse SNPs og kreft i bukspyttkjertelen ble ikke endret ved sirkulerende konsentrasjoner av vitamin D. Disse funnene støtter ikke en sammenheng mellom vitamin D-relaterte gener og kreft i bukspyttkjertelen risiko. Fremtidig forskning bør utforske andre veier der vitamin D-status kan være assosiert med kreft i bukspyttkjertelen risiko

Citation. Arem H, Yu K, Xiong X, Moy K, Freedman ND, Mayne ST, et al. (2015) Vitamin D metabolismen Gener og kreft i bukspyttkjertelen risiko. PLoS ONE 10 (3): e0117574. doi: 10,1371 /journal.pone.0117574

Academic Redaktør: Jeffrey S. Chang, National Health Research Institutes, TAIWAN

mottatt: 14 juli 2014; Godkjent: 28 desember 2014; Publisert: 23 mars 2015

Dette er en åpen tilgang artikkel, fri for all opphavsrett, og kan bli fritt reproduseres, distribueres, overføres, endres, bygd på, eller brukes av alle for ethvert lovlig formål. Arbeidet er gjort tilgjengelig under Creative Commons CC0 public domain engasjement

Data Tilgjengelighet: Alle data som brukes i vår genetiske analyser er tilgjengelig fra DBGAP ved tiltredelse # phs000206.v5. Under kohort analyse stratifisert etter sirkulerende vitamin D ble utført ved hjelp av data fra tredjeparts kohorter. Noen av dataene involverer mennesker med identifiserbar informasjon og etiske restriksjoner hindrer legger denne informasjonen på nettet. Ta kontakt [email protected] å be om data som brukes i denne analysen. Interesserte etterforskere må følge tredjeparts regler fra hvert årskull om hvordan du får de forespurte dataene

Finansiering:. Dette prosjektet er finansiert helt eller delvis med føderale midler fra National Cancer Institute, National Institutes of Helse under kontrakt nummer HHSN261200800001E. Innholdet i denne publikasjonen gjenspeiler ikke nødvendigvis synspunktene eller retningslinjer ved Institutt for helse-og omsorgs, heller ikke nevner av varemerker, kommersielle produkter, eller organisasjoner innebærer godkjennelse av den amerikanske regjeringen. Vennligst se tilleggsinformasjon seksjonen for en detaljert oversikt over studiespesifikke finansiering. Medforfattere Xiaoqin Xiong (informasjon styringssystemer, Inc.), Dennis Maeder (Leidos Biomedical Research, Inc.) og Michelle Brotzman (Westat) er ansatt av kommersielle virksomheter, og mottok lønn fra disse selskapene for å støtte denne studien. Finansiører hadde ingen rolle i studiedesign, datainnsamling og analyse, beslutning om å publisere, eller utarbeidelse av manuskriptet

Konkurrerende interesser:. Medforfattere Xiaoqin Xiong (informasjon styringssystemer, Inc.), Dennis Maeder ( Leidos Biomedical Research, Inc.) og Michelle Brotzman (Westat) er ansatt i kommersielle foretak. Dette endrer ikke forfatternes tilslutning til PLoS ONE politikk på deling av data og materialer.

Innledning

Vitamin D signalering er av interesse i forhold til kreft på grunn av sin hypotese rolle i å indusere immunceller differensiering og hemme tumor spredning og angiogenese [1]. Hos mennesker er mest vitamin D syntetisert endogent via eksponering av huden til solens ultrafiolette stråling, som omdanner 7-dehyrocholesterol i huden til vitamin D. Små mengder kommer også fra kosten kilder som fisk eller befestet meieriprodukter, og i noen bestander, kosttilskudd [2].

noen tidligere studier har antydet lavere bukspyttkjertelkreft risiko med proxy-markører for høyere vitamin D-status. Økologiske studier, som er basert på befolknings gjennomsnitt i stedet for individuelle nivå data, har vist lavere bukspyttkjertelkreft dødelighet i områder med mer soleksponering i Spania [3], USA [4,5], og Japan [6,7] . En stor, prospektiv studie som brukte en spådd estimat av vitamin D-status basert på fem faktorer som bestemmer serum 25-hydroksyvitamin D (25 (OH) D) (kosttilskudd og supplerende vitamin D, pigment i huden, fedme, geografisk bosted og fritidsaktivitet) også funnet en invers sammenheng med kreft i bukspyttkjertelen risiko [8].

Serum 25 (OH) D er den mest brukte biomarkør for å vurdere vitamin D-status i epidemiologiske studier som det gjenspeiler både endogen syntese og kosttilskudd vitamin D-inntak [9]. Men tidligere studier som evaluerte målt sirkulerende 25 (OH) D konsentrasjon med risiko for kreft i bukspyttkjertelen viser motstridende resultater. En stor, samlet studie av serumkonsentrasjoner fra åtte kohorter som en del av vitamin D Pool-prosjektet (952 tilfeller, 1.333 kontroller) rapporterte økt kreft i bukspyttkjertelen risiko med høyere sirkulerende vitamin D konsentrasjoner (odds ratio (OR) = 2,12, 95% konfidensintervall (CI)) sammenligne serumnivåer ≥100 nmol /L til referent 50-75nmol /L [10]. I motsetning til en nestet case-control studie pooling fem potensielle gruppene (451 saker, 1,167 kontroller) foreslo en invers assosiasjon OR = 0,67, 95% KI 0,46 til 0,97 sammenligne plasma 25 (OH) D kvintilene ( 81,05 til 45.64 nmol /L) og ingen forbindelse ved bruk av de sysselsatte i Vitamin D Samling Prosjekt kategorier [11].

Pathway basert analyse av GWAS kan oppdage foreninger som kan være savnet ved å fokusere på enkelt loci eller gener [ ,,,0],12]. Så vidt vi vet bare en tidligere populasjonsbasert case-control studie (628 tilfeller, 1,193 kontroller) evaluert assosiasjoner mellom genetiske varianter knyttet til vitamin D og kreft i bukspyttkjertelen, og rapporterte ingen enkeltnukleotidpolymorfi (SNP) foreninger etter justering for multiple sammenligninger [13 ]. I denne studien har vi brukt data fra 20 studier i PanScans I-III til å undersøke 11 gener i vitamin D metabolismen og 213 tilsvarende SNPs med risiko for kreft i bukspyttkjertelen. I en undergruppe av kohorter vurderes vi effekten tiltaket modifisering av sirkulerende vitamin D konsentrasjoner. Noen av prøvene som anvendes i denne analysen overlapper med de som anvendes i vitamin D Pool-prosjekt [10]. Vi antok at motstridende bevis på sirkulerende vitamin D og risiko for kreft i bukspyttkjertelen, kan forklares med genetiske variasjoner i vitamin D-relaterte gener og multiplikativ interaksjon mellom sirkulerende vitamin D og genetisk variasjon.

Materialer og Metoder

deltagerne

Vi har innhentet data fra de 20 studiene i Panscan samarbeidet som ble enige om å delta i denne veien analysen. Panscan faser I-III har blitt beskrevet tidligere [14-16]. Vårt primære analysen inkluderte genotype data fra 10 kohortstudier og 10 tilfelle kontroll studier i Panscan samarbeid. Deltakende kohorter inkludert Agricultural Health Study, Alpha-Tocopherol, betakaroten Cancer Prevention Study (ATBC): Gi oss et hint til kreft og hjertesykdommer Study (CLUE II), Cancer Prevention Study II (CPS-II), Melbourne Collaborative Cohort Study (MCC), fleretnisk Cohort (MEC), Helseundersøkelsen (NYU-WHS) New York University kvinner, prostata Lung Colorectal og eggstokkreft Screening Trial (PLCO), selen og vitamin E Cancer Prevention Trial (VELG) og vitaminer og Livsstil kohort (VITAL). De inkluderte kasus-kontrollstudier var de Mayo Clinic molekylær epidemiologi av kreft i bukspyttkjertelen Study, University of California San Francisco, Yale University, MD Anderson Cancer Center, University of Toronto, Johns Hopkins University, Memorial Sloan-Kettering Cancer Center, PACIFIC Study of Gruppen Helse og Northern California Kaiser Permanente, spansk bukspyttkjertel~~POS=TRUNC kreft~~POS=HEADCOMP Study (PANKRAS II) [17], og pancreas disease forskning (Pandora) (Heidelberg, Tyskland) [18]. Alle saker ble diagnostisert med primær bukspyttkjertelen adenokarsinom (ICD-O-3 kode C250-C259 eller C25.0-C25.3, C25.7-C25.9). Kort sagt, PanScans-I og II brukte en nestet case-control studie design for kohortstudier. Cohort tilfeller ble bekreftet gjennom kreftregistre, dødsattester eller gjennomgang av journaler av medisinsk personell. Cohort kontroller for Panscan-jeg var insidensen tetthet samplet med en 1: 1-forhold og var i live og kreft gratis på tidspunktet for diagnostisering av matchet saken. I alle kasus-kontrollstudier, matchende kriterier inkludert kalenderår av fødsel i løpet av fem år, kjønn, rase og etnisitet, mens noen kohorter også matchet på alder ved baseline eller blodprøvetaking, røyking, dato /klokkeslett for blodprøvetaking, faste status på tidspunktet av blodprøvetaking, og lengden på oppfølging. Alle data ble avidentifisert før genotyping og før prøvene ble sendt til NCI. Genotyping ble utført ved National Cancer Institute (NCI er) Kreft Genomics Research Laboratory (tidligere kjent som Core genotyping Facility) ved hjelp av Illumina HumanHap550 array for Panscan-I, Illumina Menneskelig 610-Quad array for Panscan II, og Illumina Menneskelig 770 -Quad chip for Panscan III. I Panscan III kontroller ble tidligere genotypet ved hjelp av andre generasjons Illumina SNP mikromatriser (f.eks OmniExpress, Omni 1M eller Omni 2.5M) og trukket fra Panscan III potensielle kohorter og en spansk case-kontrollstudie og dermed ble ikke tilpasset de tilfeller [19] . SNPs rapporteres her var begrenset til de med mindre allelfrekvensene (MAF) ≥5%. Totalt brukte vi data fra 3.583 bukspyttkjertelkreft tilfeller og 7,053 kontroller (1.108 saker og 4,353 kontroller fra kohorter og 2.475 tilfeller og 2700 kontroller fra kasus-kontrollstudier) av europeisk avstamning. Den alders- og kjønnsfordeling av saker og kontroller er beskrevet i S1 tabell. Skriftlig samtykke ble innhentet fra alle deltagerne. Hver deltaker Studien ble gjennomgått og godkjent av deres lokale IRB for hensiktsmessigheten i Panscan deltakelse (S2 Table) [15].

Vitamin D måling

En undergruppe av kohorten deltakere med GWAS data hadde også 25 (OH) D målt i serum som en del av vitamin D Samling Project (713 tilfeller og 878 kontroller) [20]. Disse fagene var fra følgende kohorter: ATBC, CLUE-II, CPS-II, NYU-WHS, og PLCO. Fremgangsmåter for analysering av 25 (OH) D er tidligere blitt beskrevet [10]. Kort sagt, Heartland Assays, Inc. (Ames) utført analyser for 25 (OH) D for prøver fra spor-II, CPS-II, nyu-WHS, PLCO, og en undergruppe av ATBC prøver ved hjelp av den DiaSorin LIAISON 25 OH vitamin D TOTAL analysen (DIASORIN, Inc., Stillwater, Minnesota). De gjenværende ATBC Prøvene ble analysert som tidligere ved anvendelse av en lignende metode i laboratoriet til Dr. R. vieth [21]. Fremgangsmåtene og variasjonskoeffisient prosenter for de blinde kvalitetskontroll prøver av kjerneområdet 25 (OH) D-tiltak er tidligere rapportert (10). Ved hjelp av en nestet komponenter av avviksanalyse med logaritmisk transform kvalitetskontroll tiltak på tvers av partier, generell intra- og mellom satsene variasjonskoeffisient ble 16,5% og 4,7% for de tidligere analysert konsentrasjonene i ATBC og PLCO studiene.

vitamin D relaterte funksjonene inkludert gener

DHCR7 plakater (DHC-7 reduktase) scorer pro-vitamin D

3 (7-dehydrokolesterol) i huden til kolesterol. Alternativt er pre-vitamin D dannes fra 7-dehydrocholestrol følgende dermal UVB eksponering. Vitamin D er også avledet fra kosten eller kosttilskudd i form av kolekalsiferol (D

3) eller ergocalciferol (D

2). Vitamin D-bindende protein (DBP, også kjent som GC), transporterer provitamin D til leveren, så vel som andre vitamin D-forbindelser til målvevet. I leveren 25-hydroksylaser

CYP2R1 Hotell og

CYP27A1 Konverter vitamin D

2 og D

3 fra kosten og soleksponering til 25 (OH) D (calcidiol), den viktigste sirkulerende vitamin D metabolitten. Calcidiol omdannes deretter til den aktive formen 1,25 (OH)

2D

3 (calcitriol) ved 1α-hydroksylase (

CYP27B1

) i nyrene og andre organer. 1α-hydroksylase (

CYP27B1

) er lokalisert på den indre mitokondrie-membran, hvor den produserer den aktive form av vitamin D som binder den vitamin D-reseptor (

VDR)

med vesentlig høyere affinitet enn 25 ( OH) D. Vitamin D-binding protein, GC, transporterer vitamin D-metabolitter å målrette organer, hvor kalsitriol binder til

VDR Hotell og danner en heterodimer med

RXRA plakater (retinoid X-reseptor alfa). Dette heterodimer festes til vitamin D responselementer på ulike mål gener, hvorav noen er tenkt å ha anti-kreftfremkallende egenskaper [1]. Vitamin D er catabolized av 24-hydroksylase (

CYP24A1

) til inaktive former [22].

Tre ekstra gener, cubulin (

CUBN

), megalin (

LRP2) Hotell og Kalsium Sensing Receptor (

CASR

) ble lagt inn i vår analyse for å være i samsvar med forrige undersøkelse på vitamin D-relaterte gener og kreft i bukspyttkjertelen [13]. Både cubulin og megalin er plasmamembranreseptorer som i kombinasjon megle en endocytic oppdatering av GC-bundet vitamin D.

CASR

membranproteinet binder kalsium i ekstracellulære matrise og spiller en viktig rolle i kalsium homeostase.

totalt genotype data fra 213 tag SNPs med MAF 0,05 i 11 gener som er involvert i syntesen (

DHCR7

,

CYP27A1

,

CYP2R1

), transport (

GC

,

CASR

), metabolisme (

CYP27B1

,

LRP2

,

CUBN

), signaltransduksjon (

VDR

,

RXRA

) eller katabolisme (

CYP24A1

) av endogen vitamin D ble brukt i vår analyse [1]. Disse SNPs ligger innenfor et spenn på 20kb 5 «oppstrøms og 10kb 3» nedstrøms av genet kodende region som definert av National Center for Biotechnology Information menneskelige genom bygge 36.3. SNPs og tilhørende genene er oppført i S3 tabell.

Statistisk analyse

Vi brukte ubetinget logistisk regresjon for å teste sammenhengen mellom individuelle SNPs og bukspyttkjertelkreft risiko, justert for alder (≤50, 51- 60, 61-70, 71-80, ≥81 år), kjønn, studere, og 5 egenvektorer fange etnisk opphav. Vi utførte veien og gen-analyser ved hjelp av R-pakken AdaJoint og adaptive rang avkortet produkt (ARTP) statistikk [23]. I hver analyse 1.000.000 permutasjoner ble utført. Denne statistikken står for gen eller sti størrelse og koblingsulikevekt og oppsummerer felles forening signaler i et gen eller sti. Analysene ble begrenset til kaukasiere. Vi har også testet for heterogenitet mellom de tre fasene (Panscan I, Panscan II og Panscan III) ved hjelp av R-pakke for faste effekter meta-analyse. Vi justert for multiple sammenligninger i p-heterogenitet analyse vurderer en p-verdi 0,0002 som betydelig. Analyser stratifisert etter de tre Panscan fasene ble utført for å undersøke mulige forskjeller i foreninger av fase.

For å teste mulig effekt modifisering av vitamin D-status, utførte vi stratifisert analysene i undergruppe av kohortstudier med målte 25 (OH) D; vi laget en dikotom variabel for sirkulerende vitamin D (≤50 nmol /L eller 50 nmol /L), som over denne terskelen anses å være tilstrekkelig for bein og generell helse i nasjonale anbefalinger [24,25] og var nær medianen for kontrollene i våre studiepopulasjonen (kontrollere median 25 (OH) D = 51,5 nmol /L). I denne undergruppe analysen vi i tillegg justert for røyking (aldri, tidligere, nåværende), body mass index (BMI), og sesong for blodprøvetaking (høst, vinter, vår, sommer). For å teste for multiplikativ samhandling, opprettet vi et interaksjonsledd mellom sirkulerende vitamin D som en dikotom variabel og individuelle SNPs. Ved hjelp av en Bonferroni korreksjon for multiple sammenligninger, gener med en p-verdi 0.006 og SNPs med en p-verdi 0,0002 ble ansett som statistisk signifikant. Vi vurderte også om SNPs assosiert med vitamin D-nivåer i publisert GWAS (rs2282679, rs12785878, rs10741657, rs6013897) på sirkulerende vitamin D [26,27], eller representative tag SNPs, var assosiert med vitamin D i en undergruppe av vår studie prøven.

Resultater

Genetisk variasjon i vitamin D metabolismen samlet var ikke forbundet med risiko for kreft i bukspyttkjertelen (pathway ARTP p-verdi = 0,830, Tabell 1). Ingen av de 11 gener ble assosiert med kreft i bukspyttkjertelen (tabell 1). SNPs nær

VDR plakater (rs2239186),

GC plakater (rs2282679),

LRP2 plakater (rs4668123),

CYP24A1 plakater (rs2762932), og

CUBN product: (rs1810205) gener var de beste SNPs assosiert med kreft i bukspyttkjertelen (p-verdier 0.008-0.037) (tabell 2), selv om de ikke nådde grensen for statistisk signifikans, justert for multiple sammenligninger.

En test for heterogenitet mellom de tre fasene av Panscan viste ingen tegn på heterogenitet etter justering for multiple sammenligninger. Resultater stratifisert etter Panscan fase presenteres for den generelle sti og 11 gener i S4 tabell og for SNPs med nominell p-verdier og 0,05 i S5 tabell. Ingen foreninger var signifikant etter justering for multiple sammenligninger. I analyser stratifisert ved høy vs lav sirkulerende vitamin D konsentrasjon, ble ingen signifikante forskjeller observeres og tester for interaksjon mellom vitamin D konsentrasjon og hver av de 20 beste SNPs var ikke signifikant (alle p-verdier 0,1; data ikke vist).

av de fire variantene identifisert som assosiert med sirkulerende vitamin D-konsentrasjon i publisert GWAS [26,27], i vårt utvalg bare en tag SNP i

GC

viste en sammenheng (p = 5,30 x10

-7) med vitamin D-status; tag SNPs i eller i nærheten av

DHCR7 /NADSYN1 Hotell og

CYP2R1

ikke vist noen assosiasjon og rs6013897 i

CYP24A1

kunne ikke bli studert som Illumina HumanHap550 plattformen inkluderer ikke en tag SNP for rs6013897.

Diskusjoner

Denne studien er den største hittil for å vurdere felles effekter av SNPs i vitamin D metabolismen og risiko for kreft i bukspyttkjertelen. I motsetning til vår hypotese om at vi skulle observere en sammenheng mellom vitamin D metabolismen og risiko for kreft i bukspyttkjertelen, fant vi ingen bevis for en sammenheng, enten for veien, gener, individuelle SNPs, og heller ikke for interaksjoner med målte serum vitamin D konsentrasjoner.

den tidligere studie på genetiske varianter i vitamin D sti og bukspyttkjertelkreft risiko basert i Canada viste signifikante p-verdier for SNPs i

CASR

,

CYP24A1

,

CYP2R1

,

DHCR7

, og

LRP2

gener (p-verdier varierte 0,011 til 0,050), men etter justering for multiple sammenligninger ingen av foreningene forble signifikant [13] . Selv for ulike SNPs, våre resultater viser assosiasjoner til SNPs i

CYP24A1 Hotell og

LRP2

regioner kan tilby noe støtte disse funnene. Den sterkeste SNP foreningen demonstrert i vår studie var i

VDR

genet (p-verdier 0,008 til 0,046 for tre betydelige SNPs), som ikke ble observert i den kanadiske studien.

Forskning spesifikke for polymorfismer i vitamin D metabolismen og kreft i bukspyttkjertelen er begrenset [28]. Men det finnes mer forskning på hormonelt aktive formen av vitamin D, kalsitriol. Prekliniske studier tyder på anti-proliferative effekter av kalsitriol i hud, lymfeknuter og melke vev [29] og kreft i bukspyttkjertelen celler [30], tilskrevet mekanismer knyttet til angiogenese hemming, G0 /G1 cellesyklus arrest, differensiering, induksjon av apoptose og moduler forskjellige signalveier i kreftceller [1].

Sterke av vår studie omfatter svært stor utvalgsstørrelse med genetiske data, og den delen med både genetiske data og 25 (OH) D målt før diagnose. Inkludert gener i den bane som ikke bare har vist seg å forutsi sirkulerende vitamin D, men også de som er kjent for å være involvert i metabolismen i et felles reaksjonsvei gir en bredere omfang av den biologiske prosess som det kan forholde seg til kreft i bukspyttkjertelen risiko. Blodkonsentrasjoner av vitamin D kan variere etter sesong for blodprøvetaking eller andre egenskaper som fysisk aktivitet eller BMI; selv om vi ikke har informasjon om kosten og tilskudd av vitamin D-inntak, vi justert etter tilgjengelige kovariater i analysene stratifisert ved å sirkulere vitamin D-status. Likevel, genetiske data er mindre utsatt for påvirkning eller confounding av eksogene eksponeringer. Begrensninger av vår studie omfatter forskjellene mellom genotyping plattformer, som 17 SNPs i analysen ikke ble inkludert i Panscan jeg plattformen. Også, selv om omfattende kvalitetskontrollen ble innstiftet, sirkulerende 25 (OH) D ble analysert på to forskjellige steder, innføre muligheten for batch bivirkninger eller andre variasjoner mellom laboratorier og målinger.

Konklusjon

våre funn støtter ikke en sammenheng mellom vanlige genetiske varianter i vitamin D metabolismen og risiko for kreft i bukspyttkjertelen, til tross for stor utvalgsstørrelse og evne til å vurdere effekten tiltaket modifisering av sirkulerende vitamin D konsentrasjon. Fremtidig forskning bør utforske andre veier der vitamin D kan være forbundet med risiko for kreft i bukspyttkjertelen; for eksempel gjennom studier av gen-næringsstoffer interaksjoner som involverer varianter i nedstrøms signalveier som involverer vitamin D.

Hjelpemiddel Informasjon

S1 Table. Sex og aldersfordeling for saker og kontroller inkludert i analysen, atskilt med fase

doi:. 10,1371 /journal.pone.0117574.s001 plakater (DOC)

S2 Table. Inkluderte studiene og tilhørende Institutional Review Boards

doi:. 10,1371 /journal.pone.0117574.s002 plakater (DOC)

S3 bord. Komplett liste over SNPs (n = 213) og tilhørende genene (n = 11) som er inkludert i analysen

doi:. 10,1371 /journal.pone.0117574.s003 plakater (DOC)

S4 Table. Pathway analyse for risikoen for kreft i bukspyttkjertelen og gensettene i vitamin D vei, adskilt av Panscan fase

doi:. 10,1371 /journal.pone.0117574.s004 plakater (DOC)

S5 Table. Vitamin-D relaterte enkeltnukleotidpolymorfi (SNPs) med p-verdier 0,05 og risiko for kreft i bukspyttkjertelen, atskilt med Panscan fase

doi: 10,1371 /journal.pone.0117574.s005 plakater (DOC)

Takk

Han anerkjenner bidrag av de ansatte i Cancer Genomics Research Laboratory (CGR). Spesielt ønsker vi å takke Aurelie Vogt, Xiang Deng, Belynda Hicks og Amy Hutchinson samt CGR infinium og CGR Produksjon genotyping lag inkludert Salma Chowdhury, Kedest Teshome, Kerrie Lashley, Herbert Higson og Michelle Manning for deres uvurderlig hjelp gjennom hele prosjekt. Vi vil også gjerne takke Preethi Raj for henne hjelp i forberedelsene for innlevering.

Legg att eit svar