Abstract
Bakgrunn
Tykktarmskreft (CRC) er den tredje vanligste kreftformen og den fjerde største årsaken til kreft død på verdensbasis. En enkeltnukleotidpolymorfi (SNP), rs961253 lokalisert i 20p12, ble først beskrevet å være assosiert med den økte risikoen for CRC i et genom-bred krets studien; Men nyere replikering studier gitt kontroversielle resultater.
metodikk /hovedfunnene
En sykehusbasert case-control studie i en kinesisk befolkning ble først utført, og deretter en meta-analyse som kombinerer nåværende og tidligere publiserte studier ble utført for å utforske den virkelige effekten av rs961253 i CRC mottakelighet. I den kinesiske befolkningen, inkludert 641 tilfeller og 1037 kontroller, per-A-allelet overdratt en OR på 1,60 (95% KI = 01.26 til 02.02) under additiv modell. I meta-analyse inkludert 29859 tilfeller og 29696 kontroller, per-A-allelet har en OR på 1,13 (95% KI = 01.09 til 01.18) under et tilfeldig effekt modellen på grunn av heterogenitet (
P
= 0,019 ). Likevel kan heterogenitet være helt forklares med etnisitet, med
tau
2
redusert til 0. inkludert etnisitet i meta-regresjon modell. I stratifisert analyse av etnisitet, per-A-allelet hadde ORS av 1,34 (95% CI = 1,20-1,50) og 1,11 (95% KI = 01.08 til 01.14) for asiatiske og europeiske, henholdsvis uten heterogenitet. Modest påvirkning av hver studie ble observert på totale anslaget i sensitive analyser, og tydelig tendens til signifikant sammenheng ble sett i kumulativ analyse over tid, sammen indikerer robust stabilitet dagens resultater.
Konklusjon /Betydning
resultatene fra vår studie og meta-analysen gitt fast bevis for at rs961253 bidratt vesentlig til CRC risiko i både asiatiske og europeiske befolkningen
Citation. Zheng X, Wang L, Zhu Y, Guan Q, Li H, Xiong Z, et al. (2012) SNP rs961253 i 20p12.3 er assosiert med tykktarmskreft risiko: En case-control studie og en meta-analyse av publisert litteratur. PLoS ONE 7 (4): e34625. doi: 10,1371 /journal.pone.0034625
Redaktør: Hirofumi Arakawa, National Cancer Center Research Institute, Japan
mottatt: 24 desember 2011; Akseptert: 2 mars 2012; Publisert: 11 april 2012
Copyright: © 2012 Zheng et al. Dette er en åpen-tilgang artikkelen distribueres under betingelsene i Creative Commons Attribution License, som tillater ubegrenset bruk, distribusjon og reproduksjon i ethvert medium, forutsatt den opprinnelige forfatteren og kilden krediteres
Finansiering:. Dette arbeidet ble støttet av Natural Science Foundation National Kina [NSFC-81001275 og 81171878 til XM] og Fok Ying Tung Foundation for unge lærere i høyere utdanningsinstitusjoner i Kina (131 038) til XM Finansiører hadde ingen rolle i studiedesign, datainnsamling og analyse, beslutning om å publisere, eller utarbeidelse av manuskriptet
Konkurrerende interesser:.. Forfatterne har erklært at ingen konkurrerende interesser eksisterer
Innledning
tykktarms~~POS=TRUNC kreft~~POS=HEADCOMP (CRC) er den tredje vanligste kreftformen og den fjerde største årsaken til kreftdødelighet i verden, med mer enn 1,2 millioner tilfeller på verdensbasis hvert år, og ca 630 000 dødsfall fra CRC årlig [1]. CRC er en kompleks egenskap påvirket av miljømessige og genetiske faktorer og deres interaksjoner. Analyse av fenotype samsvar i tvillinger reflekterte sterk genetisk komponent til utvikling av CRC [2], som er ansvarlig for ~35% av alle CRC. Likevel høyrisiko germline mutasjoner i noen få gener, for eksempel
APC
, mismatch reparasjon (
MMR
) gener,
SMAD4
, og
BMPR1A
, forklarte 5% av total CRC [3]. Økende bevis fra epidemiologiske studier har påberopt felles allelet-vanlig sykdom paradigme i CRC. Nye genom-wide forening (GWA) studier har validert denne hypotesen og impliserte flere felles enkeltnukleotidpolymorfi (SNPs) som bidrar til CRC mottakelighet [4] – [12]. Blant disse SNPs, rs961253 (20p12.3), som ligger i nærheten av genet benmorfogenetisk protein 2 (
BNIP2
), ble først identifisert av Houlston et al. å være signifikant assosiert med CRC risiko i meta-analyse av to GWAS bestående 6780 tilfeller og 6843 kontroller [5]. BNIP2, som et sentralt medlem av transformerende vekstfaktor-beta (TGF-β) superfamilien, er blitt vist å inhibere colonic epithelial cellevekst og fremme apoptose og således kritisk involverer i utvikling av CRC [13]. Men i de flere replikasjonsstudier resultater har vært entydige [14], [15]. I del, vanskeligheten med replikering oppstår potensielt grunn av den beskjedne effekten av denne SNP, med en odds ratio (OR) på 1,12 rapportert for den mindreårige allelet; dermed små genetiske assosiasjonsstudier har en mangel på makt og kanskje ikke klarer å gjenskape denne foreningen. I tillegg, på grunn av de fenomener «vinner forbannelse» at OR av sykdom variant er vanligvis overvurdert i den første positive studien, den nødvendige prøvestørrelse for replikasjon studie ville undervurderes hvis basis på den innledningsvis rapporteres OR, deretter replikering vil være relativt svak og muligens mislykkes [16]. Likevel, meta-analyse, et statistisk verktøy for å gre data på tvers av studier, er mektig å avklare inkonsistente funn i genetiske assosiasjonsstudier på grunn av sin eksponentiell økning i utvalgsstørrelsen [17]. Derfor, i denne studien, vi gjennomførte en meta-analyse, som kombinerer resultater fra publisert litteratur og vår case-control studie her utført i en kinesisk befolkning, for å gi en mer presis estimering av sammenhengen mellom rs961253 og CRC risiko.
Materialer og metoder
Study befolkningen
Det er totalt 641 hendelsen tilfeller av CRC og 1037 kontroller ble registrert mellom 2009 og 2011 fra Tongji Hospital of Huazhong University of Science and Technology (Hust), Wuhan, Kina. Alle fagene var urelaterte etniske Han-kinesere i Wuhan regionen. Tilfeller har vært histologisk bekreftet med primær CRC og hadde ikke fått behandling før blodprøver samling. Kontrollene var kreftfrie individer tilfeldig valgt fra en helsesjekk-up program på samme sykehus i samme periode som de saker ble meldt. Kontrollene ble frekvens-matchet til tilfeller av alder (± 5 år) og kjønn. Ved rekruttering, ble en 5 ml perifer blodprøve tatt fra hver pasient etter skriftlig informert samtykke ble oppnådd. Denne studien ble godkjent av Institutional Review styrene i Tongji Hospital of Hust.
Genotyping
Genomisk DNA ble ekstrahert fra 5-ml perifer blodprøve bruker Slapp Gene Blood DNA System DP319-02 (Tiangen, Beijing, Kina) i henhold til produsentens instruksjoner. De genotyper av rs961253 SNP ble bestemt av TaqMan SNP genotyping analyse (Applied Biosystems, Foster City, California) bruker 7900HT Fast Real-Time PCR System (Applied Biosystems, Foster City, CA). For kvalitetskontroll, ble 5% dupliseres prøvene tilfeldig valgt for å vurdere reproduserbarhet, med en konkordans hastighet på 100%.
Statistical Analysis
χ
2
test, Fisher eksakt test, og
t
test ble brukt til estimerte forskjeller i fordelingen av demografiske karakteristika og genotyper mellom saker og kontroller, der det er hensiktsmessig. Hardy-Weinberg likevekt (HWE) ble vurdert av godhet-of-fit χ
2test for genotyper i kontrollgruppen. Under multivariate logistisk regresjonsmodell, ble den genotypiske OR og dens 95% KI beregnet etter justering for alder og kjønn, med referanse til felles homozygot. For å unngå de forutsetninger om genetiske modeller, additiv og dominerende modellen for rs961253 i forbindelse med CRC ble også analysert. Alle over statistisk analyse ble utført i SPSS V12.0.
Meta-analyse av rs961253 i forbindelse med CRC risiko
For å bekrefte involvering av rs961253 i CRC mottakelighet, en meta-analyse kombinere publiserte studier og vår case-control studie ble utført. Vi har søkt i alle publikasjoner oppdatert til oktober 2011 fra PubMed, EMBASE, og ISI Web of Science databaser uten språkbegrensninger, ved hjelp av søkestrategi basert på begrepene «rs961253, BNIP2 eller 20p12.3» i kombinasjon med «Colorectal neoplasmor tykktarmskreft». Referanser oppført i hentede artiklene ble også kontrollert for manglende informasjon. Inklusjonskriteriene var: (1) case-control eller nestet case-control studie vurdere sammenhengen mellom rs961253and CRC risiko; (2) å gi data for beregning av genotypisk odds ratio (ORS) med tilhørende 95% konfidensintervall (95% CI); (3) genotyper i kontrollene være i Hardy-Weinberg likevekt (
P
0,01). Dyrestudier, omtaler, bare kommentarer og kasuistikker ble ekskludert. Studier overlappende med andre studier bør fjernes, og en med større utvalg ble valgt. . Hvis mer enn ett geografisk eller etnisk befolkning ble inkludert i en rapport, ble hver populasjon vurderes for seg
Følgende data ble hentet fra hver studie: første forfatternavn, utgivelsesår, studiedesign, geografisk plassering eller etnisitet av studiepopulasjonen, styrekilde, utvalgsstørrelse, genotyping metode, mann /kvinne hastighet, gjennomsnittsalder, frekvenser av genotyper i saker og kontroller. Hardy-Weinberg likevekt i kontrollene ble anslått igjen i meta-analyse av godhet-of-fit χ
2 test (
P
0,01). Sammenslått frekvensen til A-allel i forskjellige etniske populasjoner ble beregnet ved hjelp av den inverse variansen fremgangsmåten tidligere beskrevet av Thakkinstian et al. [18] .ORs og 95% CI’er som beregninger av effektstørrelse ble beregnet på nytt for genotypene AA versus CC og CA versus CC. En dominant genetisk modell ble antatt for rs961253, og en additiv «per-allelet» modellen ble også vurdert. Den per-allelet OR av A-allelet ble estimert ved å tildele score til 0, 1 og 2 til genotypene CC, CA, og AA, henholdsvis, og beregne ORS per heter score ved logistisk regresjonsmodell. Mellom-studie heterogenitet på tvers av alle kvalifiserte sammenligninger ble anslått av Cochran
Q
statistikk og
I
2
beregning. Heterogenitet ble betraktet som signifikant på
P
0,10 for Q-statistikken [19]. For
I
2
metriske, følgende loddepunkter ble brukt:
I
2
= 0-25%, ingen heterogenitet;
I
2
= 25-50%, moderat heterogenitet;
I
2
= 50-75%, stor heterogenitet;
I
2
= 75-100%, ekstrem heterogenitet [20]. Et fast effekt-modell, ved hjelp av Mantel-Haenszel metoden [21], ble brukt til svømme data fra studier når heterogenitet ble ubetydelig basert på
P
for Q-statistikken større enn 0,1; ellers en tilfeldig effekt-modell, ved hjelp DerSimonian og Laird metoden [22], ble brukt. For å utforske kilder til heterogenitet på tvers av studier, ble en meta-regresjon modellen benyttes [23]. De forhåndsdefinerte egenskaper for vurdering av heterogenitet kilder var: etnisitet av befolkningen (asiatisk og europeisk), kilden til kontroll (befolkning og sykehus basert kontroller), studie type (replikering og GWA studier), utvalgsstørrelse (≤2000 og 2000 fag) og genotyping metode (høy gjennomstrømming og lav-throughput analyser). Stratifisert analyse ble deretter utført, i henhold til de mulige kilder til heterogenitet rapportert av meta-regresjonsanalyse. Sensitivitetsanalyse ble utført for å vurdere påvirkning av hver studie på totale anslaget [24]. Akkumulert analyse ble utført ved utvalg av publiserings ganger [25]. Publikasjonsskjevhet ble vurdert ved trakt tomten [26], Egger test [27], og trim og fylle metoden [28], som anslår antallet og resultatene av potensielt mangler studier som følge av publikasjonsskjevhet. Alle statistiske analyser ble utført i STATA v11.0, og alt
P
verdier er tosidige med et betydelig nivå på 0,05.
Resultater
Case-kontrollstudie resultatene
Befolknings egenskaper.
det er totalt 641 hendelsen tilfeller av tykktarmskreft og 1037 frekvens-matchet kontroller ble inkludert i studien. Som vist i tabell 1, hannene var 59,9% blant tilfeller sammenlignet med 59,1% blant kontroller. Gjennomsnittlig alder var 56.31 år (± 12,59) for saker og 57.24 år (± 10,86) for kontroller. Det var ingen signifikant forskjell i fordelingen av kjønn (
P
= 0,748) og alder (
P
= 0,119) mellom sak og kontrollgruppen.
Association analyse .
Tabell 2 viser fordelingen av rs961253 genotyper i saker og kontroller. Genotyper i kontrollene var i samsvar med Hardy-Weinberg likevekt (
P
= 0,277). Signifikant forskjell ble observert i fordelingen av genotyper mellom saker og kontroller (
χ
2
= 16,33,
P
0,001). I multivariat regresjonsmodell, bærere av den CA genotype viste en betydelig økt CRC risiko sammenlignet med de som bærer CC genotypen (OR = 1,56, 95% CI = 01.21 til 02.01). På grunn av den lave frekvens av AA-genotype i denne studiepopulasjonen, en dominerende modellen var utføre, ved å kombinere den med AA CA inn i en A bærer (AA pluss CA) gruppe, for å øke statistisk kraft for estimering av CRC risiko. Det ble funnet at A operatører har en OR på 1,61 sammenlignet med bærere av CC-genotype (95% CI = 01/25 til 02/06). I tillegg betydelig økt risiko for CRC ble også funnet i additiv modell, med per-A-allelet OR på 1,60 (95% KI = 01.26 til 02.02).
Meta-analyseresultater
Study egenskaper.
Som vist i fig S1, ble 8 rapporter bedømt til å preliminært å passe inklusjonskriteriene. Etter nærmere vurdering, ble 2 rapporter med ufullstendige data fjernes etter kontakt med forfatterne av e-post [29], [30]. 3 rapporter delte samme prøve [5], [31], [32], som, Tomlinson et al. [32] ble valgt på grunn av den største prøven, selv om Houlston et al. var den første til å foreslå foreningen av rs961253 [5]. Til slutt ble 4 rapporter pluss vår case-control studie som omfatter 17 studier av 29859 tilfeller og 29696 kontroller inkludert i denne meta-analyse [14], [15], [32], [33]. Blant disse ble 14 studier gjennomført i Europa og tre i asiatisk (tabell S1). Genotyper av rs961253 kontroller dannet Hardy-Weinberg likevekt for alle inkluderte studiene (
P
0,01)..
Frekvens av risiko allel kontroll befolkningen
Det var betydelig heterogenitet i europeisk gruppe (
P
for heterogenitet 0,001,
i
2
= 71,1%). Det sammenslåtte frekvensen av det A-allel var 35,4% (95% CI = 34,6% -36,2%) i de europeiske kontroll under tilfeldig effekt-modell, som var vesentlig høyere enn den til 8,1% i asiatiske kontroller uten heterogenitet (95% CI = 7.5 % -8,6%,
P
for heterogenitet = 0,449;.. Figur S2)
Generelt meta-analyse av rs961253 i forbindelse med CRC
i genotypisk modell, betydelig økt risiko for CRC ble observert for CA versus CC (OR = 1,14, 95% CI = 1.10 til 1.18, tabell 3) under anleggs effekt-modell (
P
for heterogenitet = 0,167). En marginal heterogenitet ble observert i AA versus CC (
P
for heterogenitet = 0,102) såvel som i dominerende modellen (
P
for heterogenitet = 0,099), mens betydelig heterogenitet ble funnet i additiv modellen (
P
for heterogenitet = 0,019). Derfor ble tilfeldig effekt modell brukes for AA genotypisk, dominerende og additive modeller, og alle disse genetiske modeller tillagt betydelig økt risiko for CRC, med ORS på 1,25 (95% CI = 1,16 til 1,34), 1,17 (95% KI = 01.12 til 01.22), og 1,13 (95% KI = 01.09 til 01.18), henholdsvis.
Meta-regresjon og stratifisert analyse.
for å utforske potensielle kilder til mellom- studien heterogenitet i henhold additiv modell, ble meta-regresjonsanalyse utført. En tom regresjon ble først kjørt til anslå grunnverdi for
tau
2 plakater (
tau
2
= 0,0019), og deretter en serie univariat modell ble utført ved å tilsette enkelt kovariater inkludert etnisitet av befolkningen, kilde av kontroll, studietype, utvalgsstørrelse, og genotyping metode. I univariate analysen, modellen herunder etnisitet redusert
tau
2
verdien til 0, og justert
R
2
verdi var 100% (
P
= 0,004), noe som tyder på etnisitet kan helt forklares heterogenitet på tvers av studier i additiv modell. Stratifisert analyse av etnisitet ble videre utført. I europeiske befolkningen, alle genetiske modeller viste ingen tegn på heterogenitet (
P
for heterogenitet 0.1,
I
2
= 0), og nåværende betydelig økt risiko for CRC, med ORS på 1,12 (95% KI = 01.08 til 01.16), 1,23 (95% KI = 01.17 til 01.30), 1,14 (95% KI = 01.10 til 01.18), og 1,11 (95% KI = 01.08 til 01.14) for genotype CA versus CC, AA versus CC, og dominerende og additive modeller, henholdsvis. I asiatiske befolkningen, bare genotypisk modell av AA versus CC viste signifikant heterogenitet (
P
for heterogenitet = 0,012,
I
2
= 77,2%). Alle genetiske modeller presentert signifikant økt risiko for CRC med unntak av AA versus CC (tabell 3). I tillegg ble større effekt av en variant sett i asiatiske enn den i europeiske.
Sensitivitetsanalyse.
Siden betydelig heterogenitet på tvers av studier ble observert for additivet modellen, gjennomførte vi en sensitivitetsanalyse for vurdere effekten av hver studie på den samlede anslaget under en tilfeldig effekt modell. Som vist i tabell 4, er en serie av samlet SV med 95% CI produsert gjentatte ganger etter fjerning av hver bestemt studie kontinuerlig overskride 1,0, og den samlede OR var likt før og etter slettingen av hver studie. Tilsvarende resultater ble sett for andre genetiske modeller som ikke enkelt studie menings endre sammenslåtte ORS, indikerer robust stabilitet dagens resultater.
Akkumulert meta-analyse.
Akkumulert analyse av foreningen av rs961253 med CRC ble gjennomført via et utvalg av studier ved publisering tid. Som vist i figur 1, dragning mot signifikant sammenheng var tydelig over tid i alle genetiske modeller. Videre er 95% CI’er ble stadig smalere med hver opphopning av mer data, noe som tyder på presisjonen i estimatene ble gradvis styrket av kontinuerlig legge mer sample
(A) CA versus CC.; (B) AA versus CC; (C) den dominerende modellen; (D) additiv modell.
Publication bias.
Som reflektert av trakten tomten og Egger test, var det ingen publikasjonsskjevhet i genotypiske modeller av CA versus CC og AA versus CC og dominerende modellen (
P
for Egger test = 0,269, 0,198, og henholdsvis 0,187,), mens et marginalt signifikant publikasjonsskjevhet ble sett i additiv modell (
P
for Egger test = 0,047). Deretter en trim-and-fill metoden ble gjennomført under tilfeldig effekt modell. Likevel ble ingen trimming utført og samlet anslag var uendret, noe som indikerer vår resultatet var statistisk robust.
Diskusjoner
I denne studien fant vi en signifikant sammenheng mellom rs961253 og tykktarmskreft i den kinesiske befolkningen . Også følgende meta-analyse pooling data fra nåværende og 16 tidligere publiserte studier indikerte signifikant sammenheng av rs961253 med CRC i henhold til genotypisk, dominerende og additive modeller. Kumulativ analyse bekreftet videre den betydelige krets, og viser effekten av varianten ble progressivt større med hver ansamling av mer data over tid. Til beste vi vet, til denne meta-analysen først kombinert publisert GWA studier og replikering studier reflekterer en presisjon effekt av rs961253 på CRC risiko.
rs961253 ligger på 20p12.3, en region med mangel på gener eller spådd protein-koding transkripsjoner. Imidlertid kartene BNIP2 342 kb telomeric til denne locus [5], som er en av initiatorer av BMP signalisering ved å binde seg til sine tilsvarende reseptorer. BMP signale kan undertrykke Wnt veien for å sikre en balansert styring av tarmstamcelleselvfornyelse [34]. Som det fremgår av tidligere studier, har mutasjoner av BMP pathway blitt beskrevet i juvenil polypose [35], en arvelig syndrom som predisponerer til CRC. Nylig har tumor suppresjon rolle av BMP-signalering er etablert, og BMP-reaksjonsveien er blitt inaktivert i opp til 70% av sporadisk CRC [36]. Tatt i betraktning all denne informasjonen, selv om ingen funksjon rapporten ble om til den rs961253, har det vært spekulert på om denne locus kan endre BMP signale transduksjon av effekten på BNIP2, og således påvirke CRC forekomsten [37]. Men etter den første GWA undersøkelse om rs961253 har oppfølgingskjøringer gitt inkonsistente resultater.
I denne studien våre data i den kinesiske befolkningen indikerte at økt risiko ble signifikant assosiert med CA genotype sammenlignet med CC genotype, og lignende signifikant sammenheng opprettholdt under de dominerende og additive modeller. For AA-genotype, på grunn av den lave frekvens i denne populasjonen, har vi klart å anslå nøyaktig virkning. Følgende meta-analyse, inkludert 29859 tilfeller og 29696 kontroller, gitt en 100% makt for å estimere sammenhengen mellom rs961253 og CRC. Resultatene indikerte at alle genetiske modeller tillagt betydelig økt risiko for CRC. Imidlertid, selv om det var tydelig bevis på mellom-studie heterogenitet for de additive modellene, heterogeniteten var blitt fullstendig forklart ved etnisk av studiepopulasjonen i henhold til resultatet av meta-regresjonsanalyse. Deretter ble utført stratifisert analyse av etnisitet. I europeiske befolkningen, ble heterogenitet fjernet, og alle genetiske modeller av en variant allel var fremdeles signifikant assosiert med økt risiko, mens alle genetiske modeller i asiatiske også tillagt økt risiko uten tegn på heterogenitet unntak av AA genotypiske modell. Etter sammenligne mann /kvinne ratio, gjennomsnittsalder og MAF av risiko allel, var det ingen signifikant funn mellom asiatiske og europeiske bortsett MAF av risiko allel. Derfor kan variansen til AA genotypisk effekt mellom europeisk og asiatisk tilskrive annen etnisk bakgrunn preget av allelfrekvenser forskjell, med samlet A allelfrekvenser på 35,4% i Europa og på 8,1% i asiatiske. I tillegg ORS genetiske modeller i Asia var større enn de i EU. I betraktning av den inverse forholdet mellom allel frekvens og effektstørrelse basert på rensende utvalg [38], foreslo vi at rs961253 variant kan ha større effekt i asiatisk enn europeiske.
Etnisitet ble også reflektert som den viktigste opphavet til heterogenitet i sensitivitetsanalyse ved å vise at graden av heterogenitet ble redusert etter utelukkelse av enkeltstudie i asiatiske. I tillegg, ingen enkelt studie påvirket den generelle ORS kvalitativt for alle genetiske modeller, noe som tyder på svært stabiliteten av dagens resultater. Den kumulative analyse gitt ytterligere støtte til dagens resultater, noe som indikerer at etter hvert som akkumulering av mer data over tid, ble presisjonen av estimater løpende forbedret og tendensen mot signifikant sammenheng ble stadig tydeligere. Publikasjonsskjevhet ble også grundig vurdert i denne studien. Ingen bevis for publikasjonsskjevhet ble funnet i alle genetiske modeller unntatt for den additive modellen som reflekteres av trakten tomten og Egger test. Vi videre brukt trim-and-fill metode for å justere for publikasjonsskjevhet. Likevel Resultatet viste at meta-analyse med eller uten trim-and-fill metoden ikke trekke annen effekt estimat. Til sammen resultatene av denne meta-analysen er god og pålitelig.
Til tross for den klare styrken i studien som gir nok strøm, bør noen begrensninger tas opp. CRC er en kompleks trekk forårsaket av både genetiske og miljøfaktorer; Men mangler av miljødata begrenset vår videre evaluering av gen-miljø interaksjon. Selv om sammenhengen mellom rs961253 og CRC har blitt bekreftet i denne undersøkelsen, om dette SNP er årsaks forble usikker.
I konklusjonen, resultatene fra vår studie i den kinesiske befolkningen og meta-analyse som kombinerer forskjellig etnisitet gitt en mer nøyaktig beskrivelse av den rollen rs961253 i CRC mottakelighet, noe som tyder på at den varianten av rs961253 var assosiert med økt risiko for CRC, og den varianten kan ga større effekt på asiater enn europeere. Imidlertid bør fine kartlegging av 20p12.3 region eller funksjonsanalyse skal pålegges å identifisere årsaks variant.
Hjelpemiddel Informasjon
Figur S1.
Flytskjema for studien valg.
doi: 10,1371 /journal.pone.0034625.s001 plakater (TIF)
Figur S2.
Felles frekvensen av A-allelet i europeiske og asiatiske kontroller.
doi: 10,1371 /journal.pone.0034625.s002 plakater (TIF)
Tabell S1. Bedrifter Den kjennetegn ved de studiene som inngår i meta-analysen for foreningen av rs961253 med CRC.
doi: 10,1371 /journal.pone.0034625.s003 plakater (DOC)
Sjekkliste S1.
PRISMA sjekkliste.
doi: 10,1371 /journal.pone.0034625.s004 plakater (DOC)
