Abstract
Bakgrunn
Rask respons på kjemoterapi ved metastatisk kolorektal kreft (mCRC) pasienter (respons innen 12 uker etter kjemoterapi) kan øke sjansen for komplett reseksjon og bedret overlevelse. Få molekylære markører forutsi irinotecan-indusert rask respons og overlevelse. Single-nukleotid polymorfismer (SNPs) i oppløst stoff bære gener er rapportert å korrelere med de variable farmakokinetikken til irinotecan og folat hos kreftpasienter. Denne studien tar sikte på å evaluere prediktiv rolle 3 SNPs i mCRC pasienter behandlet med irinotecan og fluoropyrimidin-holdige regimer.
Materialer og metoder
Tre SNPs ble valgt og genotypet i 137 mCRC pasienter fra en Chinese prospektive multisenterstudie (NCT01282658). Chi-squared test, univariat og multivariat logistisk regresjonsmodell, og mottaker drift karakteristikk analyse ble brukt for å vurdere sammenhenger mellom genotyper og rask respons. Kaplan-Meier overlevelsesanalyse og Cox proporsjonal fare modeller ble brukt til å vurdere sammenhengen mellom genotyper og overlevelses utfall. Benjamini og Hochberg False funnraten korreksjon ble brukt i flere tester
Resultater
Genotype GA /AA av SNP rs2306283 av genet
SLCO1B1 Hotell og genotype GG av SNP rs1051266 av gen
SLC19A1
var assosiert med en høyere raske responsrate (odds ratio [OR] = 3,583 og 3,521, 95% KI = 1,301 til 9,871 og 1,271 til 9,804,
p
= 0,011 og p = 0,013, respektivt). Svarprosenten var 70% hos pasienter med begge genotyper, mot bare 19,7% i de resterende pasientene (OR = 9,489, 95% KI = 2,191 til 41,093, Fishers eksakte test
p
= 0,002). Deres betydninger ble alle opprettholdt selv etter flere tester (alle
p
c
0,05). Den rs2306283 GA /AA genotype var også en uavhengig prognostisk faktor på lengre progresjonsfri overlevelse (PFS) (hasardratio = 0,402, 95% KI = 0,171 til 0,945,
p
= 0,037). Ingen av SNPs spådd total overlevelse.
Konklusjoner
Polymorfisme av oppløste bærere kan være nyttig for å forutsi rask respons til irinotecan pluss fluoropyrimidin og PFS i mCRC pasienter.
Trial Registry
ClinicalTrials.gov NCT01282658
https://www.clinicaltrials.gov/ct2/show/NCT01282658
Citation: Huang L, Zhang T, Xie C, Liao X, Yu Q, Feng J et al. (2013) SLCO1B1 og SLC19A1 genvarianter og Irinotecan-Induced Rapid Response og Survival: En prospektiv Multisenteret Farmakogenetikk Study of metastatisk kolorektalcancer. PLoS ONE 8 (10): e77223. doi: 10,1371 /journal.pone.0077223
Redaktør: Robert Lafrenie, Sudbury Regional Hospital, Canada
mottatt: 9 mars 2013; Godkjent: 29 august 2013; Publisert: 15 oktober 2013
Copyright: © 2013 Huang et al. Dette er en åpen-tilgang artikkelen distribueres under betingelsene i Creative Commons Attribution License, som tillater ubegrenset bruk, distribusjon og reproduksjon i ethvert medium, forutsatt den opprinnelige forfatteren og kilden krediteres
Finansiering:. Dette arbeidet ble støttet av The National Natural Science Funds nr 81071832 og nr 81272492. de bevilgende myndighet hadde noen rolle i studiedesign, datainnsamling og analyse, beslutning om å publisere, eller utarbeidelse av manuskriptet
Konkurrerende interesser:. den forfatterne har erklært at ingen konkurrerende interesser eksisterer.
Innledning
tykktarms~~POS=TRUNC kreft~~POS=HEADCOMP (CRC) er en av de viktigste årsakene til kreft dødsfall i USA og Kina [1,2]. Komplett reseksjon av alle kjente involverte områder i valgt metastatisk kolorektalcancer (mCRC) pasienter forbedrer deres overlevelse [3]. irinotecan pluss fluoropyrimidin (± leucovorin) er en av de viktigste regimer for mCRC behandling og kan bidra til å konvertere en inoperabel pasient til en resectable status [4]. Men bare 30-50% av pasientene svare på førstelinje irinotecan pluss fluoropyrimidin kjemoterapi [5,6]. Til dags dato, er konvertering og neoadjuvant behandling vanligvis begrenset til 2 til 3 måneder. Respons innen 12 uker til kjemoterapi forbedrer sjansen for komplett reseksjon og lengre overlevelse for mCRC pasienter. Derfor er det av stor betydning for å identifisere pasienter som vil svare til det aktuelle kjemoterapi i løpet av 12 uker.
Noen germline polymorfismer av enzymer av 5-fluorouracil (5-FU) og irinotecan har blitt beskrevet å korrelere med graden av giftighet i CRC pasienter. Men ikke kliniske data ikke utvetydig støtte deres innflytelse på kreft responsen til nå. Kun begrensede data er tilgjengelig for å forutsi rask respons for å veilede behandling valg [4,7-13] ..
oppløst stoff bærere står for variabel farmakokinetikk irinotecan og folat hos kreftpasienter. For eksempel, oppløst stoff bæreren organisk anion transporter familiemedlem 1B1 (
SLCO1B1
) er en stor tilstrømning transportør uttrykt på basolateral membran av humane hepatocytter som formidler 7-etyl-10-hydroksy-camptothecin (SN38, den aktive metabolitten irinotecan) disposisjon [14]. En
SLCO1B1
enkeltnukleotidpolymorfi (SNP), rs4149056 (521T C), har vist seg å være assosiert med en høyere areal under konsentrasjonskurven fra SN38 (AUC
SN38) og klasse ≥ 3 nøytropeni hos lungekreftpasienter som behandles med irinotecan og cisplatin [15-17]. Men det er fortsatt uklart bevis for en sammenheng mellom
SLCO1B1
SNPs og irinotecan relaterte tumorrespons og overlevelse i mCRC pasienter.
Den menneskelige oppløst stoff carrier familie 19, member1 (
SLC19A1
) genet koder for redusert folat bærerprotein 1 (RFC1), som medierer intracellulære opptaket av folate- [18,19]. Tidligere studier identifisert at human koloncancer cellelinjer holdt in high-folat medium viste en lavere følsomhet for fluorouracil (5-FU) alene eller 5-FU pluss leucovorin (en aktiv form av folat) enn de samme cellelinjer holdt in low-folat medium [20]. Men det har vært få studier som fokuserer på forholdet mellom
SLC19A1
genvarianter med inter-pasient variasjon i kombinerte irinotecan og fluoropyrimidin regimer (FOLFIRI [irinotecan pluss 5-FU og leukovorin] /mCapeIRI [irinotecan + kapecitabin] ).
det er ingen tvil om at ikke-genetiske kovarianteffekter kontroller er svært viktig for å forstå bidrag av genetisk variasjon i farmakogenetiske undersøkelser. Her gjennomførte vi en prospektiv multisenterstudie i mCRC pasienter for å undersøke om SNPs i oppløste bære gener var assosiert med rask tumor respons på FOLFIRI /mCapeIRI og bedret overlevelse.
n
%
No. av patients137 100 Age, yearsMedian (range) 53 (18-75) SexMale 87 63.5 Kvinne 50 36,5 KPS 60% 16 11,7 70% 44 32,1 ≥80% 77 56,2 SmokerNo 84 61.3 Ja 53 38.7 Kjemoterapi regimenFOLFIRI 104 75,9 mCapeIRI33 24,1 Primær tumorColon 73 53,3 rektum 64 46,7 Tabell 1. Pasientenes egenskaper.
KPS, Karnofsky indeks av ytelse status; FOLFIRI, irinotecan pluss 5-FU og folinsyre; mCapeIRI, irinotecan pluss kapecitabin. CSV Last ned CSV
Materialer og metoder
Pasient valgbarhet og studiedesign
Denne studien ble godkjent av etikkomiteen av Huazhong University of Science and Technology 12. november 2010 og registrert på http: //www.clinicaltrials.gov med referansenummeret NCT01282658. Seks kreft sentre i Hubei-provinsen var involvert (tabell S1 i File S2). Studien ble koordinert og sponset av Avdeling for kreftbehandling, Tongji Hospital, Tongji Medical College, Huazhong University of Science and Technology, Wuhan, Kina. Alle deltakende institusjoner godkjent studieprotokollen. Skriftlig informert samtykke ble innhentet fra hver pasient før rekruttering. Perifere blodprøver ble innhentet fra pasienter som ble enige om å gi blod.
Vi velger type I feil α = 0,05, 1-β = 0.8, tosidig test, forutsatt at målet SNP allelfrekvenser i befolkningen var ca 20%, behandlingseffekten var ca 30%, eller ≥ 3,5, beregnet prøvene størrelsen var 86 av Quanto (versjon 1.2.4)
kriterier inkludert histologisk bekreftet inoperabel metastatisk adenokarsinom i colorectum.; alder mellom 18 og 75 år gammel; målbar sykdom, definert i henhold til de Response evalueringskriterier i solide svulster versjon 1.1 (RECIST1.1) [21]; ingen tidligere irinotecan eksponering; ingen forventet behandling med stråleterapi under førstelinje kjemoterapi; Karnofsky indeks av allmenntilstand ≥ 60 eller Eastern Cooperative Oncology Group Performance Status Scale ≤ 2; pasienter ikke gravide eller ammende; pasienter frivillig signerte informert samtykke; total bilirubin ≤ 1,5 ganger øvre normalgrense (ULN); aspartataminotransferase og alaninaminotransferase ≤ 2,5 ganger øvre referanseverdi (≤ 5 ganger øvre normalverdi dersom levermetastaser til stede); kreatininclearance 50 ml /min eller serumkreatinin ≤ 1,5 ganger øvre referanseverdi.
Hovedmålet var å vurdere sammenhengen mellom genetiske varianter og den raske responsrate (RRR) på kinesisk mCRC pasienter. Rask respons ble definert som minst en reduksjon 30% i summen av de lengste diameter mållesjoner til de første 12 ukene av kjemoterapi. Delmål inkludert forholdet mellom genvarianter og progresjonsfri overlevelse (PFS), irinotecan relaterte tid til behandlingssvikt (IR-TTF) og total overlevelse (OS). PFS ble definert som tiden har gått mellom den første dagen av irinotecan behandling og sykdomsutvikling (PD) eller død uavhengig av årsak, avhengig av hva som skjedde først. IR-TTF ble beregnet fra starten av irinotecan behandling til seponering på grunn inkludert PD, utålelig toksisitet eller død. OS ble beregnet som tiden fra irinotecan behandlingsstart til død uansett årsak eller dato for siste oppfølging [22].
SNPs
Gene
Allelic endre
Funksjon
AA endring
Ring hastighet
n product: (%)
HWE
p
MAF
Genotype frekvens,
n product: (%)
wt/wt
wt/var
var/var
rs1051266
SLC19A1
A GMH27R201(99.0)0.30 0,4857 (28,4) 93 (46,2) 51 (25,4) 97 (99,0) 0,66 0.4418(18.6)50(51.5)29(29.9)rs2306283
SLCO1B1
A GMN130D200(98.5)0.930.2412(6.0)73(36.5)115(57.5)97(99.0) 0.360.223(3.1)36(37.1)58(59.8)rs4149056
SLCO1B1
T CMV174A203(100.0)0.800.13153(75.4)46(22.7)4(1.9)98(100.0) 0,81 0,1374 (75,5) 22 (22,4) 2 (2,1) Tabell 2. SNPs informasjon og genotypiske frekvenser i 203 gastrointestinal kreft og 98 mCRC pasienter
SNPs, Single-nukleotid polymorfismer.; AA, aminosyre; mCRC, metastatisk kolorektalcancer; HWE, Hardy-Weinberg likevekt; MAF, mindre allel frekvens; vekt, vill type; Var, variant; M, missense. CSV Last ned CSV
Protokollen for denne rettssaken og støtte TREND sjekkliste er tilgjengelig som tilleggsinformasjon; se Protocol S1 og sjekkliste S1.
Effekt og giftighet vurdering
Pasienter bodde på sykehuset for 3-dagers kjemoterapi. Effekten ble evaluert med en konsekvent avbildningsteknikk (magnetic resonance imaging eller computertomografi skanning) hver 6. uke av RECIST 1.1. Toksisitet ble samlet inn av ansikt-til-ansikt spørreskjemaer og ble gradert ved hjelp av National Cancer Institute Common Toxicity Criteria for bivirkninger versjon 4.0 på hver syklus. En enkelt syklus av kjemoterapi ble ansett nok til å vurdere toksisitet; ellers ville minst tre sykluser (6 uker) av kjemoterapi være nødvendig i svaret vurderingen analyse. Tidligere respons Evalueringen ble bare tillatt når pasientene hadde alvorlige symptomer som indikerer progresjon. Blodtellinger og biokjemiske tester ble utført innen 72 timer etter begynnelsen av hver syklus og 7-10 dager etter hver syklus. Evalueringer ble utført blindet for de genetiske resultatene og ble vurdert uavhengig av to leger. En tredje lege løst uoverensstemmelser. De kliniske data ble overvåket av studien sponsor
Behandling
De pasientene som aksepterte FOLFIRI mottatt, som anbefalt av retningslinjene fra National Comprehensive Cancer Network, irinotecan (Camptosar;. Pfizer, Sydney, Australia) 180 mg /m
2 intravenøs (IV) infusjon over 30-90 minutter, dag 1; folinsyre 400 mg /m
2 intravenøs infusjon for å matche varigheten av irinotecan infusjon dag 1; 5-FU 400 mg /m
2 IV bolus, dag 1; deretter 1200 mg /m
2 /dag x 2 dager (totalt 2400 mg /m
2 mer enn 46-48 timer) kontinuerlig infusjon; dette ble gjentatt hver 14. dag. Pasienter som falt kontinuerlig infusjon ble senere endret til en mCapeIRI [23] regime (irinotecan 125 mg /m
2, dag 1 og 8; kapecitabin 825-1000 mg /m
2, to ganger daglig på dag 1-14 , gjenta hver 21. dag). Vi endret standard irinotecan pluss kapecitabin (CapeIRI [24] eller XELIRI [25]) diett på grunn av vår erfaring i toksisitet kontroll. Alle pasientene aksepterte 5-hydroxytryptamine reseptor antagonist (5 mg en gang daglig) 30-60 minutter før irinotecan. Kriteriene for irinotecan dosereduksjon er gitt i Tabell S2 i File S2. Kjemoterapi fortsatte inntil sykdommen utviklet eller utålelige toksisitet kom ut eller pasienter bedt om å trakk seg på grunn av en eller annen grunn.
Genotyping
Vi søkte National Center for Biotechnology Information (NCBI) SNP database (dbSNP, https://www.ncbi.nlm.nih.gov/snp/) og relatert litteratur identifisere funksjonelle SNPs fra
SLCO1B1 Kjøpe og
SLC19A1
gener. Kriteriene for valg SNP var som følger :. (1) Med mindre allel frekvens på mer enn 0,15 i asiatiske befolkningen, (2) Genotype takst ≥ 95%, (3) missense SNP. Tre SNPs (
SLCO1B1
rs2306283 og rs4149056, og
SLC19A1
rs1051266) ble valgt for genotyping. Genomisk DNA ble ekstrahert fra perifert blod ved hjelp av en FUJI helblod DNA-kit (Fujifilm Corporation, Tokyo, Japan). Primere ble designet av genotyping Verktøy og MassARRAY analysen Design programvare (versjon 3.0, Sequenom Inc., San Diego, California). SNPs ble genotypet med Sequenom MassARRAY iPLEX plattform. Data ble bearbeidet og analysert ved Sequenom MassArray Typer 4.0-programvaren. Detaljer om PCR reaksjoner og primer sekvenser er henholdsvis tilgjengelig i File S1 og tabell S3 i File S2. Fem prosent av prøvene ble tilfeldig valgt ut og genotypet ved direkte sekvensering, med en resulterende overensstemmelse hastighet på 100%. Anropsfrekvens terskelen ble satt på minst 95% for hver SNP. Hardy-Weinberg likevekt (HWE) ble testet gjennom χ
2 test og
p
0,05 indikert avvik fra likevekt.
Statistisk analyse
Hver variant ble evaluert for tilknytning til hvert endepunkt. Sammenhenger mellom RRR og genotyper ble testet ved bruk av Pearson chi-squared test. Den multivariabel logistisk regresjonsmodell (Enter) ble brukt til å justere for potensielle kovariater (sex og røykestatus som dikotome variabler, alder, areal og funksjonstilstand som kontinuerlige variabler, rs1051266, rs2306283 og rs4149056 genotyper som dikotome variabler). Røyking betydelig senket eksponeringen mot irinotecan, som indikerer en mulig risiko for behandlingssvikt i en case-control studie [26]; derfor vi stod for røykestatus i multivariat analyse. Odds ratio (OR) og deres 95% konfidensintervall (KI) ble beregnet som estimater av sammenhenger. Receiver Operating karakteristiske (ROC) kurver ble generert for å sammenligne modellene med og uten positive svar prediktorer. Kaplan-Meier analyse og log-rank test ble utført for å beregne fordelingen av PFS, IR-TTF, og OS og sammenligne forskjeller mellom overlevelseskurver. For å evaluere forholdet mellom genotyper og PFS, IR-TTF og OS, ble multivariat Cox regresjon (Enter) utført, justert for potensielle forvekslings kovariatene. Hazard ratio (HR) og deres 95% KI ble beregnet som estimater av sammenhenger. En verdi på
p
0,05 ble ansett som statistisk signifikant i en to-halet test. Korrigert P-verdi (
p
c
) ble oppnådd ved Benjamini og Hochberg False funnrate korreksjon i flere tester. Haploview programvare (versjon 4.2) ble brukt til å beregne koblingsulikevekt (LD) mellom polymorfismer og utføre analyse av inferred haplotyper. Statistisk analyse ble utført ved hjelp av SPSS 16.0 statistisk programvare (SPSS Inc., Chicago, IL).
Resultater
Pasient egenskaper og behandlingsresultat
Pasientenes egenskaper er presentert i tabell 1. Fra november 2010 til juni 2012, ble 139 pasienter inkludert. To pasienter ble funnet å være kvalifisert i henhold til kontrollkomité evalueringen, og ble ekskludert fra den endelige analysen.
Flytskjema ble vist i Figur 1. Response evalueringen var tilgjengelig for 120 pasienter. Sytten pasienter kunne ikke evalueres for respons på grunn av: tidlig avslutning av kjemoterapi (færre enn tre sykluser) på grunn av uutholdelig toksisitet (
n
= 5) eller til ikke-medisinske grunner (
n
= 6); fortsatt under observasjon for respons (
n
= 4); eller andre anti-kreftterapi interfererer med effektmålingen (
n
= 2).
RRR og toksisitet er vist i tabell S4 og S5 i File S2. Blant de 120 pasientene som ble ansett egnet for responsevaluering, 33 pasienter (27,5%) oppnådde en rask respons, av dem, 13 pasienter (39,4%) svarte i løpet av de første 6 ukene av kjemoterapi, og 20 pasienter (60,6%) svarte innen 12 uker etter oppstart av kjemoterapi (tabell S4 i File S2). Nitti åtte pasienter gitt blodprøver og ble genotypet, og responsen var assessable i 88,8% (
n
= 87). Ingen forskjell for RRR ble funnet mellom genotypet og ikke-genotypet pasienter (26,4% vs 30,3%, p = 0,672; Pearson chi-squared test)
Trettitre pasienter (24,1%) godtok mCapeIRI regime. . RRR (27,6% vs. 27,5%,
p
= 0,990; Pearson chi-squared test) og overlevelse (figur S1 i File S3) viste ingen forskjeller mellom mCapeIRI og FOLFIRI grupper. Slik at vi ikke gjennomføre subgruppeanalyse i henhold til ulike kjemoterapiregimer.
N
Pasienter med RRR n (%)
OR (95%CI)
p
P
c
rs2306283
aGG518(15.7)GA/AA3514(40.0)3.583(1.301-9.871)0.0110.022rs1051266
aGG 2411 (45,8) 3,521 (1.271-9.804) GA /AA 6212 (19,4) 0.0130.017rs4149056
BTT 6718 (26,9) CT /CC 205 (25,0) 0,907 (0.288-2.858) 0.8680.868rs2306283 (GA /AA) + rs1051266 (GG) 10 7 (70,0) 9,489 (2,191 til 41,093) others7615 (19,7) 0,002
※ 0.008Table 3. RRR hos pasienter i henhold til genotype (Pearson chi-squared test).
RRR, rask respons rate; OR, odds ratio; KI, konfidensintervall;
※ Fishers eksakte test, N Antall assessable pasienter;
p
c
, P-verdi korrigeres ved Benjamini og Hochberg False funnrate korreksjon. en genetisk modell er REC.b genetisk modell er DOM. CSV Last ned CSV
SNPs informasjon, genotypiske og haplotypic frekvenser og LD analyse
I tillegg til vår multisenter kohort, genotypet vi SNPs i 203 kinesiske gastrointestinal kreftpasienter (98 mCRC pasienter og 105 mage kreftpasienter) . Genotypefrekvensene er rapportert i tabell 2. Den mindre allelet frekvens (MAF) av hver SNP var sammenlignbare med tidligere rapporterte data i NCBI-databasen, med unntak av rs2306283, hvor MAF var lavere i populasjonen [27,28] enn tidligere rapportert. Alle variantene var i HWE (
p
0,05).
OCF (andre kliniske faktorer) har sex, areal, funksjonsnivå og røykestatus. Agene inkluderer alder, rs2306283 og rs1051266. SE, standard feil.
Ingen kobling ble observert blant disse tre varianter (Figur S2 i File S3). Haplotypic frekvenser av
SLCO1B1 product: * 1B, * 1A og * 15 ble vist i tabell S6 i File S2.
Variate
RRR (N = 85)
OR
95% KI
P
rs2306283GA /AA vs GG4.0701.155-14.3470.029rs1051266GG vs. GA /AA4.3951.282-15.0640.019rs4149056CT /CC vs. TT2.0820.502-8.6430.313sex0.8610.141-5.2430.871age1.0721.013-1.1350.017SA3.5380.027-458.5590.611PS1.0140.945-1.0870.701SS0.5080.119-2.1680.360Table 4. Multivariat logistisk regresjonsanalyse (Enter) av RRR
RRR, rask respons rate.; N, Antall assessable pasienter; OR, odds ratio, KI, konfidensintervall; SA, areal; PS, performance status; SS, røykestatus. CSV Last ned CSV
Sammenheng mellom genotyper og svar
Det komplette sett med assosiasjoner mellom hver SNP og RRR er vist i tabell 3. Begge rs2306283 (GA /AA) og rs1051266 (GG) var signifikant assosiert med høyere RRR av chi-squared test (tabell 3) og univariat logistisk regresjonsanalyse (tabell S7 i File S2). Som vist i tabell 3, RRR var 40% (14 av 35 pasienter) i rs2306283 (GA /AA) gruppen sammenlignet med 15,7% (8 av 51 pasienter) i rs2306283 (GG) gruppe,
p
= 0,011 . I rs1051266 (GG) gruppe, RRR var 45,8% (11 av 24 pasienter) sammenlignet med 19,4% (12 av 62 pasienter) i rs1051266 (GA /AA) gruppe,
p
= 0,013. Pasienter med rs2306283 (GA /AA) og rs1051266 (GG) viste en mer betydelig forskjell i RRR (70% vs. 19,7%, OR = 9,489,
p
= 0,002). Forskjeller var fortsatt betydelig selv etter korrigering av Benjamini og Hochberg False funnraten korreksjon (
p
c
0,05) og justert for potensielle klinisk (kjønn, alder, areal, funksjonsnivå, og røykestatus) og genetiske (rs4149056) kovariater i multivariabel logistisk regresjonsanalyse (tabell 4). I tillegg til genetiske faktorer, alder var den eneste kliniske faktor assosiert med RRR. For å vurdere bidraget av genetiske faktorer for å forutsi RRR, ROC analyse ble utført ved bruk av andre kliniske faktorer (OCF), alder alene og alder + rs2306283 + henholdsvis rs1051266 (AGene). AGene ga den høyeste AUC-verdien (0,776,
p
0,001) og den beste følsomhet (figur 2), noe som viser at genet faktorer kan forbedre prediktiv nøyaktighet RRR.
Sammenheng mellom genotyper og overlevelse
På median oppfølging på 270 dager (range 36-594 dager), 69 pasienter var døde, 3 pasienter kom ikke til sin oppfølging avtale, og 125 pasienter hadde trukket seg fra studien (53 opplevde PD, 15 led utålelig grad ≥ 3 toksisitet [1 pasient trakk seg på grunn av rask PD og utålelige toksisitet], 41 pasienter uten PD valgte å gi opp den anti-kreft terapi, 15 ikke- parkinsonpasienter akseptert kirurgi eller Kateter arteriell chemoembolization terapi, og 2 pasienter fullførte 12 sykluser med kjemoterapi uten progresjon). I vår studie var median OS var 343 dager. For å utelukke at forskjellene i PFS og IR-TTF var på grunn av ikke-kjemoterapi faktorer, PFS og IR-TTF evaluering ekskludert pasienter med ingen medisinske grunner for tilbaketrekning og ikke-parkinsonpasienter som aksepterte en anti-kreft terapi annet enn kjemoterapi. Dermed ble 41 og 54 pasienter genotypet og analyzable for henholdsvis PFS og IR-TTF,. Av hvem, 1 pasienter ikke klarte å bli genotypet for rs1051266. I Kaplan-Meier analyse, pasienter med rs2306283 (GA /AA) hadde signifikant lengre PFS (n = 41, median 124 vs. 104 dager, log rank
p
= 0,014) og IR-TTF (n = 54 , median 96 vs. 86 dager, log rank
p
= 0,046) sammenlignet med de med genotype GG. Lignende resultater av univariat cox regresjonsanalyse av PFS, IR-TTF og OS er vist i tabell S8 i File S2. I multivariat Cox regresjonsanalyse, rs2306283 (GA /AA) igjen viste seg å være en uavhengig prognostisk faktor av PFS (n = 40, HR = 0,402, 95% KI = 0,171 til 0,945,
p
= 0,037), men miste sin betydning i stille en lengre IR-TTF (n = 53,
p
= 0,076; tabell 5). Det ble ikke observert mellom rs1051266 eller rs4149056 og PFS eller IR-TTF. Ingen av SNPs var en signifikant prediktor av OS (n = 96,
p
0,05; tabell 5). Alle overlevelseskurver for rs2306283, rs1051266 og rs4149056 er vist i figur 3.
Variate
PFS (N = 40)
IR-TTF (N = 53)
OS (N = 96 )
HR(95%CI)
P
HR(95%CI)
p
HR(95%CI)
p
rs2306283GA/AA vs. GG0.402 (0.171-0.945) 0.0370.543 (0.277-1.066) 0.0760.966 (0.536-1.741) 0.909rs1051266GG vs. GA /AA1.329 (0.542-3.260) 0.5340.714 (0.358-1.423) 0,3391. 321 (0,688 til 2,538) 0.403rs4149056CT /CC vs. TT1.197(0.527-2.718)0.6671.042(0.531-2.043)0.9050.688(0.341-1.390)0.297sex0.724(0.234-2.238)0.5740.941(0.350-2.534)0.9050.893(0.363-2.201)0.806age0.997(0.964-1.030)0.8521.008(0.981-1.035)0.5880.969(0.946-0.992)0.008SA0.827(0.018-39.075)0.9231.298(0.058-29.145)0.8700.266(0.023-3.113)0.292PS1.007(0.961-1.055)0.7711.006(0.969-1.045)0.7570.971(0.936-1.009)0.130SS0.934(0.339-2.575)0.8951.079(0.475-2.452)0.8562.201(1.053-4.602)0.036Table 5. multivariat Cox regresjonsanalyse (Enter) av PFS, IR-TTF og OS
PFS, progresjonsfri overlevelse,. IR-TTF, irinotecan relaterte tid til behandlingssvikt, OS, total overlevelse, N Antall assessable pasienter; HR, hazard ratio; CI, konfidensintervall, SA, areal, PS, funksjonsnivå,. SS, røykestatus CSV Last ned CSV
Diskusjoner
Vi fant ut at en vanlig
SLC19A1
SNP, rs1051266 (GG) som var til stede i 29,9% av vår årsklasse, var assosiert med en høyere FOLFIRI /mCapeIRI rask respons rate. Så langt vi kjenner til, er dette den første prospektive studie for å evaluere effekten av
SLC19A1
varianter på FOLFIRI /mCapeIRI farmakodynamikk i mCRC pasienter. den SLC19A1 transporter er hovedsakelig lokalisert på apikale brush-grensen membran av jejunum og tykktarm og regnes som den dominerende ruten for folat opptak i pattedyrceller [19] . Leucovorin (en aktivert form av folat) kan bidra til 5-FU å inhibere tymidylatsyntase (TS) ved å danne et ternært kompleks med TS-FdUMP. Derfor har folinsyre-5-FU kombinasjoner viste en bedre terapeutisk indeks enn 5-FU alene avansert kolorektal kreft [29-32]. Lave folate nivåer kan øke evnen av leucovorin for å danne komplekset [20]. Backus et al (2000) rapporterte at fire uavhengige tykktarmskreft cellelinjer dyrket i lav folat medium viste en høyere sensitivitet til enten 5-FU alene eller sammen med leukovorin [20]. Tidligere data har vist at personer med genotype rs1051266 (GG) hadde lavere plasma folatnivå [18]. Jo høyere RRR av rs1051266 (GG) pasienter i vår studie kan delvis forklares med lavere plasma folat og økt TS-hemming, men denne forklaringen må bekreftes i videre studier.
SLCO1B1 formidler lever tilstrømningen av SN38 fra blodet. Den andre viktige funn er at rs2306283 (GA /AA) fra
SLCO1B1
er assosiert med høyere RRR, lengre PFS og IR-TTF i mCRC pasienter behandlet med FOLFIRI /mCapeIRI regimer, mens rs4149056 (CT /CC) mislyktes å forutsi RRR eller overlevelse. Imidlertid har tidligere studier vist at rs2306283 (A G) kan ha liten innvirkning på SLCO1B1 aktivitet [33,34] og ingen statistisk signifikans ble rapportert mellom rs2306283 og AUC
SN38 eller tumorrespons i 81 lungekreftpasienter [35 ], mens C-allelet av rs4149056 fører til redusert membran uttrykk for SLCO1B1, redusert transportaktivitet, redusert clearance av legemidlet [36-39] og en høyere AUC
SN38 i lungekreftpasienter [35]. En fersk genom-wide forening studie blant 699 barn med akutt lymfatisk leukemi avslørte at rs2306283 var assosiert med økt metotreksat (MTX, også substrater av SLCO1B1) klaring etter justering for rs4149056 [37]. Interessant, våre funn støttes som rs2306283 (GA /AA) ble uavhengig assosiert med høyere RRR, lengre PFS og IR-TTF etter justering for rs4149056. Disse funnene viser at in vitro eller liten, retrospektiv, single-institusjon studier som regel har for mange komplekse kovariatene å gi konkluderende resultater. Annen etnisk bakgrunn, ulike sykdommer, ulike regimer og ulike irinotecan doser kan føre til kontroversielle resultater. Fornyet assosiasjoner mellom rs2306283 (GA /AA) og behandlingsresultater etter justering for rs4149056 i prospektive studier er verdt å forfølge i flere studier.
Vi har også funnet ut at 70% av pasientene med både rs2306283 (GA /AA) og rs1051266 (GG) fikk rask respons, mye høyere enn andre pasienter som ble genotypet. Til dags dato er det ingen funksjonelle data om effekten av kombin
SLCO1B1 Hotell og
SLC19A1
genvarianter i forutsi respons på FOLFIRI /mCapeIRI. Forskjellene i RRR (70% vs. 19,7%), hvis validert, vil gi verdifull informasjon for kliniske beslutninger. Den prediktive funksjon rs2306283 (GA /AA) kombinert med rs1051266 (GG), kan hjelpe legene finne ut en undergruppe av pasienter nyter godt av konvertering /neoadjuvant kjemoterapi før operasjonen. Men på grunn av den lille størrelsen på utvalget, våre funn trenger validering i større serie.
Ingen av de 3 SNPs ble funnet å være assosiert med OS i vår studie, selv om flere SNPs spådd et bedre svar. Dette kan skyldes forskjellige påfølgende behandlinger som kan indusere remisjon hos pasienter som er resistente mot førstelinje kjemoterapi. I vår undersøkelse er svarprosenten lavere og overlevelsestiden er kortere enn i tidligere kliniske studier [6,24]. Dette kan være fordi vi har gått glipp av de pasienter som ville ha reagert senere enn 12 uker med cellegift fordi pasienter med stabil sykdom fikk en lavere median antall kjemoterapi sykluser (median antall, 4; range, 2-12). I tillegg frafallet før PD var høy (34,2%) på grunn av sosioøkonomiske grunner. Hva mer, bare 5 pasienter (4,2%) akseptert reseksjon av levermetastaser. Disse grunnene kan forklare hvorfor god respons ikke var relatert til lenger OS i vår studie.
I konklusjonen, resultatene av denne multisenter prospektiv studie antyder at rs2306283 (GA /AA) fra
SLCO1B1
i kombinasjon med rs1051266 (GG) på
SLC19A1
er signifikant assosiert med rask tumor respons på FOLFIRI /mCapeIRI i kinesiske mCRC pasienter. Dette kan hjelpe leger til å optimalisere førstelinje kjemoterapi av mCRC pasienter. Fornyet assosiasjoner mellom rs2306283 (GA /AA) og behandlingsresultatene er verdt å satse på i fremtiden.
Hjelpemiddel Informasjon
Fil S1.
Detaljer om PCR reaksjoner.
doi: 10,1371 /journal.pone.0077223.s001 plakater (docx)
Fil S2.
Tabell S1 til S8.
doi: 10,1371 /journal.pone.0077223.s002 plakater (docx)
Fil S3.
Figur S1 til S2.
doi: 10,1371 /journal.pone.0077223.s003 plakater (docx)
Sjekkliste S1.
TREND Sjekkliste.
doi: 10,1371 /journal.pone.0077223.s004 product: (PDF)
Protocol S1.
Trial Protocol.
doi: 10,1371 /journal.pone.0077223.s005 plakater (DOC)
Takk
Vi takker pasientene for bes levere biologiske prøver. Vi takker Michael Heuser og Nathan Susnik fra Hannover Medical School, Tyskland for deres hjelp med manuskriptet skriving, og CapitalBio (Beijing, Kina) for eksperimentell og bioinformatikk hjelp.
