PLoS ONE: Mutasjoner av C-reaktivt protein (CRP) -286 SNP, APC og p53 i Colorectal Cancer: implikasjoner for en CRP-Wnt Høring

Abstract

C-reaktivt protein (CRP) er en etablert markør for inflammasjon med mønstergjenkjenning reseptor-lignende aktiviteter. Til tross for den nære tilknytning av serumnivået av CRP med risiko og prognose av flere typer kreft, gjenstår det unnvikende om CRP bidrar direkte til tumorgenese, eller bare utgjør en tilskuer markør. Vi har nylig identifisert tilbakevendende mutasjoner i SNP posisjon -286 (rs3091244) i arrangøren av

CRP

genet i flere krefttyper, i stedet tyder på at lokalt produsert CRP er en potensiell sjåfør av tumorigenesis. Det er imidlertid ukjent om -286 nettstedet er den eneste SNP stilling

CRP

genet målrettet for mutasjon og om det er noen sammenheng mellom

CRP

SNP mutasjoner og andre ofte muterte gener i svulster . Heri, har vi undersøkt genotyper av tre felles

CRP

ikke-koding SNPs (rs7553007, rs1205, rs3093077) i tumor /normal prøve par 5 krefttyper (n = 141). Ingen tilbakevendende somatiske mutasjoner er funnet på disse SNP posisjoner, noe som indikerer at -286 SNP mutasjonene er fortrinnsvis valgt under utviklingen av kreft. Videre analyser viser at de -286 SNP mutasjoner av

CRP

tendens til å co-skje med mutert

APC

spesielt i endetarmskreft (

p

= 0,04, n = 67) . I motsetning mutasjoner av

CRP Hotell og

p53

eller

K-ras

synes å være irrelevant. Det resultatene så understreker den funksjonelle betydningen av -286 mutasjon av

CRP

i tumorigenesis og innebærer et samspill mellom CRP og Wnt signalveien

Citation. Su HX, Zhou HH, Wang MY, Cheng J, Zhang SC, Hui F et al. (2014) Mutasjoner av

C-reaktivt protein product: (

CRP

) -286 SNP,

APC Hotell og

p53

i Colorectal Cancer: Implikasjon for en CRP-Wnt Crosstalk. PLoS ONE 9 (7): e102418. doi: 10,1371 /journal.pone.0102418

Redaktør: Qing Song, Morehouse School of Medicine, USA

mottatt: 5 mars 2014; Godkjent: 18 juni 2014; Publisert: 15.07.2014

Copyright: © 2014 Su et al. Dette er en åpen-tilgang artikkelen distribueres under betingelsene i Creative Commons Attribution License, som tillater ubegrenset bruk, distribusjon og reproduksjon i ethvert medium, forutsatt den opprinnelige forfatteren og kilden krediteres

Data Tilgjengelighet:. Den forfatterne bekrefter at alle data som underbygger funnene er fullt tilgjengelig uten restriksjoner. Alle data er inkludert i papir

Finansiering:. Dette arbeidet ble støttet med tilskudd fra departementet for vitenskap og teknologi i Kina [tilskuddet antallet 2011CB910500]; Natural Science Foundation of China National [tilskuddsnummer 30930024, 31222015, 31270813, 31170696]; Kunnskapsdepartementet i Kina [tilskudds tall PCSIRT: IRT1137, 121108]; Gansu-provinsen [tilskuddet Nummer: 1011FKCA089]; og Lanzhou University [tilskuddsnummer: lzujbky-2013-bt05, lzujbky-2014-86]. Finansiører hadde ingen rolle i studiedesign, datainnsamling og analyse, beslutning om å publisere, eller utarbeidelse av manuskriptet

Konkurrerende interesser:.. Forfatterne har erklært at ingen konkurrerende interesser eksisterer

Innledning

Betennelse er essensielt for utvikling av kreft [1], [2]. Som en stor human akutt fase-reaktant, er C-reaktivt protein (CRP) er mye brukt som en ikke-spesifikk markør for inflammasjon [3], [4]. Imidlertid, samler bevis har åpenbart en nær sammenheng mellom serumnivået av CRP og den risiko og prognose av kreft [5]. Gitt de antatte funksjoner av CRP i vertens forsvar og medfødt immunitet [6], [7], er det sannsynlig at CRP kan spille en direkte rolle i tumorigenesis. Faktisk CRP er blitt rapportert å forhindre apoptose av myelomceller [8], og for å lette invasivitet av brystkreftceller [9]. Videre kan CRP bidra til etablering av en gunstig tumor mikromiljøet ved å fremme angiogenese [10], ved å inhibere den destruktive aktivering av komplement [11], [12], og ved å indusere proinflammatoriske cytokiner fra immun og endotelceller [3], [ ,,,0],13], [14].

på den annen side, enkeltnukleotidpolymorfi (SNPs) som forbinder med genetisk forhøyede konsentrasjoner av CRP ikke gi en økt kreftrisiko for den generelle befolkningen [15]. Dette tyder på at sirkulerende CRP er ikke årsaks involvert i tumorigenesis. Intriguingly, i motsetning til de tidligere nevnte pro-canceraktiviteter, tidlige studier har også dokumentert anti-kreft virkninger av CRP gjennom aktivering av makrofag /monocytt-[16] – [18]. Derfor har det vært vanskelig å definere om CRP er kun en passiv markør eller en aktiv aktør i kreft, eller å dissekere den eksakte bidraget av CRP i tumorigenesis

Serum CRP er produsert av hepatocytter i leveren.; imidlertid, samler bevis viser også en lokal produksjon av CRP ved ekstra-leverceller [3], [19]. Interessant, har vi nylig funnet ut at arrangøren av

CRP

er spesielt mutert ved SNP posisjon (rs3091244) 286 bp oppstrøms transkripsjonsstartsetet i 109 ut av 453 tumorprøver, men ikke i de samsvar normale kontroller [19 ]. Disse mutasjonene er assosiert med økt lokal

CRP

induksjon i tumorer sannsynlig via forstyrrelse av den konserverte CpG metylering motiv. Videre har de fleste av de krefttypene som ble undersøkt huse den -286 mutasjonen og fraksjonen av det muterte allel er høy (0,487, 95% CI: 0,477 til 0,517). Disse funnene støtter dermed rollen som CRP produsert

in situ

som en potensiell kreft driver som er trolig involvert i generelle mekanismer favorisering tumorigenesis [19].

I tillegg til -286 SNP, er det flere flere vanlige ikke-koding SNPs som vesentlig påvirker baseline nivå av serum CRP. Representantene inkluderer rs7553007, rs1205 og rs3093077 [15], [20], [21]. Det er derfor av interesse om disse SNP nettstedene er også målrettet for mutasjon i svulster. Vi viser her ved genotyping av 141 kreft /normale prøve parene som ingen tilbakevendende mutasjoner oppstår på 3

CRP

SNP områder, og dermed fremhever at -286 mutasjoner er svært spesifikke for tumorigenesis. Vi videre undersøkt om det er noen sammenheng mellom -286 mutasjoner av

CRP Hotell og andre ofte muterte gener i svulster. Det identifiserte sammenheng mellom -286 og

APC

mutasjoner innebærer et samspill av CRP med Wnt signal.

Materialer og metoder

Frozen tumor /normal vevsprøve parene ble oppnådd fra vevet bank av Gansu Provincial Tumor Hospital. Genomisk DNA ble isolert fra vev eller blodprøver med DNAiso Reagens eller Blood Genome DNA Extraction Kit (Takara) i henhold til produsentens instruksjoner. For identifisering av genmutasjoner, ble genomisk DNA forsterket med spesifikke primere (human

CRP

: fremover: 5′-AGGGGGGAGGGATAGCATTAGAA-3 «; omvendt: 5′-CGTCCTGCTGCCAGTGATACAAG-3»; menneskelig

p53

: fremover: 5′-CTGTCCCTTCCCAGAAAACCT-3 «; omvendt: 5′-CCTGGGCATCCTTGAGTTC-3»; menneskelig

APC

: fremover: 5′-TAATACCCTGCAAATAGCAGAAATA-3 «; omvendt: 5»-GTGGCAAAATGTAATAAAGTATCAG-3 «; humane

K-ras

: frem: 5′-ATGACTGAATATAAACTTGTGGTA-3′, omvendt: 5′-CAACACCCTGTCTTGTCTT-3 «) etterfulgt av sekvensering. Genotyping av 24 SNPs (rs7553007, rs1205, rs3093077, rs4073, rs1143627, rs720816, rs723504, rs1876054, rs746961, rs2371923, rs487616, rs953183, rs400328, rs950487, rs759394, rs726402, rs1568645, rs929689, rs2254896, rs1951096, rs1843026, rs1543193, rs718015 , rs16091) ble utført ved massespektrometri-baserte Sequenom tjeneste (Genergi Biotechnology, Shanghai, Kina). Skriftlig informert samtykke ble innhentet fra pasienter. Alle pasienter er kinesisk. Studien ble godkjent av Ethic komiteen av Tumor Hospital Gansu Provincial.

Resultater

Ingen tilbakevendende somatiske mutasjoner oppstår ved tre felles

CRP

SNP steder i svulster

for å se om andre ikke-kodende SNP områder av

CRP

er mutert i tumorer, vi konkludert med at genotyper av 3

CRP

vanlige SNPs (rs7553007, rs1205, og rs3093077) sammen med 21 flere SNPs i 141 tumor /normal prøve par 5 krefttyper,

dvs.

mage, lunge, spiserør, tykktarm og endetarm kreft. Frekvensene for alleler forbundet med lavere CRP-nivå er 48,9% for en allel av rs7553007, 47,9% for T allel av rs1205, og 79,1% for T allel av rs3093077 i normale prøver (tabell 1), og dermed gi tilstrekkelig prøvestørrelsene for deteksjon av tilbakevendende mutasjoner. Derfor har vi identifisert bare en sak av G En mutasjon på rs7553007, 0 tilfelle av mutasjon ved rs1205, og 2 tilfeller av G T mutasjoner ved rs3093077 i matchet tumorprøver. En slik lav forekomst av somatisk mutasjon ble også funnet for 21 andre undersøkte ikke-koding SNP sider fordelt på 9 forskjellige kromosomer (figur 1). Disse viser at, i motsetning til de svært tilbakevendende

CRP

-286 SNP (rs3091244) mutasjoner [19], den 3

CRP

SNP nettsider analysert her, er bare tilfeldig mutert i svulster på bakgrunnen mutasjonsfrekvens.

3

CRP

SNPs (rs7553007, rs1205, og rs3093077) og 21 flere SNPs av 141 kreft /normale prøve parene ble genotypet ved Sequenom. Disse prøvene ble samlet fra 37 magesekken, 12 lunge, spiserør 27, 24 kolon og 41 rektale kreftpasienter. (A) De mutasjonsfrekvenser på hver SNP nettsteder. Ingen av disse områdene er recurrently mutert i svulster. Frekvensen av

CRP

-286 SNP (rs3091244) mutasjon i disse prøvene er vist for sammenligning. (B) Den samlede mutasjons frekvenser av SNPs med eller uten tilhørende gener. Gene-forbundet SNP nettsteder har en tendens til å stille lavere mutasjonsfrekvenser riktignok uten å nå statistisk signifikans (to sample

t

test, to-tailed,

p

= 0,47).

Ifølge genotyping resultater, mutasjons frekvenser av SNP områder med og uten tilhørende genene er 0,97% (95% KI: 0,35 til 1,59%) og 1,30% (95% KI: 0,78 til 1,82%), henholdsvis . Selv om det ikke er statistisk signifikant, tyder dette på at gen-forbundet SNP nettsteder tendens til å være mindre utsatt for tilfeldig mutasjon enn de med ukjent forening, muligens på grunn av begrensninger som begrenser skader på genomisk loci med funksjonell betydning. Av genet assosierte SNPs, rs1143627 og rs4073 er ​​to promoter SNPs som finner på 31 og 199 bp oppstrøms for transkripsjonsstartsider av

IL-1β Hotell og

IL-8

, henholdsvis. Deres lave mutasjons frekvenser (0,7 til 1,4%) hevder at arrangøren lokalisering

per se

er ikke sannsynlig årsaken til somatisk hypermutasjon på

CRP

-286 SNP-site i tumorer; heller, vil den høye forekomsten av den -286 mutasjonen være et resultat av funksjonelle konsekvenser knyttet til den forbedrede induksjon av

CRP

, noe som kan gi vertscellekloner tilstrekkelig til fordel for å overleve og vokse i utvikling av kreft.

CRP

-286 SNP mutasjon er assosiert med mutert

APC

i endetarmskreft

CRP

-286 SNP mutasjon er mest utbredt i tykktarm kreft [19], der

p53

,

K-ras

og

APC

er blant de hyppigst muterte gener som fremmer tumorigenesis via forskjellige mekanismer [22 ] – [24]. Vi derfor søkt å undersøke om det er noen sammenheng mellom disse mutasjon hendelser. Mutert

p53

,

K-ras

og

APC

ble identifisert ved sekvensering av sine respektive hotspot mutasjon regioner,

dvs.

301-1044 av

p53

, 24-442 av

K-ras

, og 3922-4453 av

APC

i cDNA sekvens varierer, ifølge statistikken fra COSMIC database. Til tross for sin høye forekomst (ca. 50%),

CRP-

286 SNP mutasjoner viser ingen åpenbar sammenheng med mutert

p53 product: (n = 35; Tabell 2 og 2A.) Eller

K-ras

(n = 35; tabell 3 og 2B fig.). Mangelen på sammenheng mellom

p53 Hotell og

CRP

-286 SNP mutasjoner ble også bekreftet i spiserøret kreft (n = 36;. Tabell 4 og 2C figur), hvor

p53

representerer den hyppigst muterte genet.

CRP

-286 SNP mutasjoner viser ingen sammenheng med mutert

p53

eller

K-ras

i kolon (AB) eller spiserør kreft (C) (Fishers eksakte test, to-tailed). Hvert rektangel representerer en tumorprøve med grå farge angir vill type status. Baren grafene til høyre viser hvor mange prosent av pasientene bærer de angitte mutasjoner i to pasientgrupper med eller uten CRP-286 mutasjoner.

I motsetning, en to fold berikelse av mutant

APC

ble observert i colontumorer med samtidig

CRP

-286 SNP mutasjoner (n = 38, Tabell 5 og Figur 3A). Men gjorde en slik sammenheng ikke nå statistisk signifikans trolig på grunn av den begrensede størrelsen på utvalget som vi kunne få. Vi har derfor ytterligere undersøkt 67 tumor /normale prøve par av endetarmskreft (tabell 6 og figur 3B), som er svært lik tykktarmskreft i både celletype sted genomiske endringer [25] som viser høy forekomst av både

APC

[25] og

CRP

-286 SNP mutasjoner [19]. Faktisk er co-forekomst av disse to mutasjoner i dette prøvesettet ble mer tydelig (odds ratio: 5,56, 95% KI: 1,17 til 26,36) og signifikant (

p

= 0,04). Disse resultatene tyder dermed på at CRP og APC kan samarbeide i overlappende baner under utvikling av tykktarmskreft.

CRP

-286 SNP mutasjoner tendens til å co-skje med

APC

mutasjoner i tykktarmen (A) (Fishers eksakte test, to-tailed,

p

= 0,47) og endetarmskreft (B) (Fishers eksakte test, to-tailed,

p

= 0,04 ). Hvert rektangel representerer en tumorprøve med grå farge angir vill type status. Baren grafene til høyre angir hvor mange prosent av pasientene bærer APC-mutasjoner i to pasientgrupper med eller uten CRP-286 mutasjoner.

Diskusjoner

in vitro

aktivitetene av CRP [3], [4], [6], [11], [13], [14], herunder gjenkjennelse av endogene eller eksogene faresignaler, regulering av komplementaktivering, induksjon av proinflammatoriske celle responser, fører til ideen om at CRP kan fungere som en løselig mønstergjenkjennings reseptor i medfødt immunitet og vertens forsvar [6], [7]. Men mangelen på samsvar støtte ved forskning på dyremodeller [26] – [34], humane individer [35], [36] og genetisk epidemiologi [15], [20], [21], [37], blir det usikkert om CRP spiller noen vesentlig rolle i kronisk betennelse

in vivo

eller bare representerer en uspesifikk markør som antydet av sin akutte fase uttrykk mønster. I denne forbindelse, identifisering av den svært tilbakevendende

CRP

-286 SNP mutasjoner i flere typer kreft hos mennesker [19] gir en overbevisende bevis for at dette proteinet er en potensiell sjåfør av tumordannelse og en kjernekomponent av regelverket nettverk av betennelse.

Arrangøren mutasjoner i

TERT product: [38], [39] og

CRP product: [19] utgjør de første eksemplene på at ikke-kodende regulatoriske områder kan også være målrettet for å fremme tumorigenesis ved å modulere uttrykk i stedet for aktivitetene til viktige gener. Imidlertid er det noe unikt i tilfelle av

CRP

at mutasjonen finner sted ved en felles SNP område. Dette reiser bekymring om SNP nettsteder er generelt mer utsatt for genetiske endringer, som fører til den høye forekomsten av person mutasjoner. For å møte denne bekymringen, genotypet vi 24 SNPs av 141 kreft /normale prøve par. Disse SNP’er er plassert på 9 forskjellige kromosomer, og består av 3 SNP av

CRP

, 2-promoteren SNP’er av inflammatoriske cytokiner, en SNP av en ikke-kodende gen, 18 SNP’er med ukjent krets. Til tross for dette, ble alle de SNP områder syntes å være mutert i tumorer med bare lav bakgrunn frekvens. Derfor er det svært tilbakevendende mutasjon på

CRP

-286 SNP området mest sannsynlig et resultat av utvalget ved kreftutvikling, men ikke bare på grunn av generelle egenskaper knyttet til SNP nettstedet eller genomisk plassering. Det er imidlertid fortsatt mulig at den -286 mutasjonen er bare en konsekvens av tumorigenese og ytterligere funksjonelle analyser er nødvendige for å klargjøre dette punkt.

Ikke desto mindre er det interessant at selv om fire undersøkte

CRP

SNPs alle påvirker serumnivå av CRP, er det bare -286 SNP målrettet av tumorigenesis. Dette tyder på at effekten av de andre 3 SNPs er sekundære til -286 SNP, som kan delvis forklares med avhengighet av

CRP

uttrykk på arrangøren CpG metylering, en viktig epigenetisk mekanisme i genet stanse [ ,,,0],40]. Faktisk har vi nylig vist at høy CRP uttrykk er korrelert med lav promoter metylering, og vice versa [19]. Av de 5 CpG-motivene i

CRP

promoteren, evolusjonært konservert -286 CpG ser ut til å være nøkkelen, særlig for ekstrahepatiske celletyper, i bestemmelse av basalnivået av

CRP

uttrykk [19] . Ettersom de fleste av -286 mutasjoner er C A /T-overganger som forstyrrer metylering motiv, er det sannsynlig at slike genetiske endringer vil i sin tur bidra til å slå på promoteraktivitet av

CRP

sannsynlig via senke hemmende metylering signal og legge til rette for binding av transkripsjonsfaktorer til den underliggende E-box sekvens [41]. Disse kan etter hvert gi den påfølgende deltakelse av distale regulatoriske elementer som inneholder den andre

CRP

SNPs.

Den høye tilbakefall og pervasiveness av

CRP

-286 SNP mutasjoner i tumorer foreslå at lokalt produsert CRP, i stedet for sirkulerende CRP, driver utvikling av kreft. Dette paradoks kan forklares ved den stramme avhengighet av virkningene av CRP på inflammatoriske microenvironments [3], [13], [14], [36]. Sirkulerende CRP er produsert av leveren som en pentamer primært som viser anti-inflammatorisk aktivitet [7], [42], [43]. Dess hepatocytter, ekstrahepatiske celler er også i stand til å utskille CRP lokalt i respons til inflammatoriske stimuli. Videre utløser beriket i inflammatorisk loci vil indusere rask conformation endringer i pentamer CRP innlegget sitt

in situ

produksjon [44] – [49], for å frigjøre det fulle potensialet i ligandbindende [47], [48] , [50], komplementregulering [46], [48], [51] – [54] og stimulering av proinflammatoriske og angiogene cellere [48], [49], [55] – [61]. Som sådan bør den lokale overflod av CRP og dets interaksjon med stressende mikro være mer relevant for sykdomsprogresjon; mens sirkulerende CRP-nivå i hovedsak gjenspeile den underliggende inflammatorisk status.

Den feilregulering av Wnt signalveien er den hyppigste hendelse observert i tykktarmskreft, som vanligvis er manifestert ved å inaktivere mutasjoner av

APC

eller aktivere mutasjoner av

β-catenin product: [25]. En direkte konsekvens av

APC

inaktive er stabilisering av

β-catenin Hotell og avvikende aktivering av nedstrøms målgener [62]. Det er derfor av interesse at

CRP

har vist seg å være et mål av

β-catenin product: [63]. Videre våre resultater viser at

CRP

-286 SNP mutasjoner tendens til å co-skje med mutant

APC

i tykktarm og endetarm svulster. Dette skulle tilsi at de to sekretoriske molekyler,

dvs.

CRP og Wnt, kan handle i feed-back og samarbeids manerer å fremme tumorigenesis, som fortjener nærmere undersøkelser. Gitt den abnormt aktivert Wnt signal og svært indusert

CRP

uttrykk i tumorer, aktuell målgruppe begge molekylene kan være en potensiell mulighet for kolorektal kreft terapi.

Takk

Vi takker Mr . Jing Zhao for hans utmerkede teknisk assistanse.

Legg att eit svar