Abstract
Bakgrunn
TP53
genet er en av de viktigste tumorsuppressorgener. Vi foretok denne meta-analyse for å utforske sammenhengen mellom
TP53
Arg72Pro polymorfisme og risikoen for hudkreft hovedsakelig i kaukasiere.
Metoder
Vi søkte PubMed for case-control studier publisert frem til mars 2013. odds ratio (ORS) med 95% konfidensintervall (cIS) ble brukt for å vurdere styrken av foreningen.
Resultater
det er totalt 5276 tilfeller hudkreft og 5315 kontroller fra 20 studier ble inkludert. Totalt sett, ingen signifikant sammenheng mellom
TP53
Arg72Pro polymorfisme og hudkreft ble observert i alle genetiske kontrast modeller (Pro /Pro versus Arg /Arg, Pro /Arg versus Arg /Arg, Pro /Pro + Pro /Arg versus Arg /Arg, Pro /Pro versus Arg /Arg + Pro /Arg, Pro allel versus Arg allel). Lignende resultater ble oppnådd i stratifisert analyse av etnisitet og histologiske typer hudkreft, som melanom, plateepitelkarsinom og basalcellekarsinom. Strøm beregninger indikerte at noen studier var underpowered. Ingen publikasjonsskjevhet ble funnet ved hjelp av trakt tomten og Egger test.
Konklusjoner
Denne metaanalyse viste at
TP53
Arg72Pro polymorfisme trolig hatt liten tilknytning til hudkreft mottakelighet hovedsakelig i kaukasiere. Imidlertid er større sample size-studier er nødvendig for å bekrefte konklusjonen så lave statistiske krefter
Citation. Ye J, Li XF, Wang YD, Yuan Y (2013) Arg72Pro Polymorphism av
TP53
Gene og risikoen for hudkreft: en meta-analyse. PLoS ONE 8 (11): e79983. doi: 10,1371 /journal.pone.0079983
Redaktør: Amanda Ewart Toland, Ohio State University Medical Center, USA
mottatt: 4 mai 2013; Godkjent: 27 september 2013; Publisert: 08.11.2013
Copyright: © 2013 Ye et al. Dette er en åpen-tilgang artikkelen distribueres under betingelsene i Creative Commons Attribution License, som tillater ubegrenset bruk, distribusjon og reproduksjon i ethvert medium, forutsatt den opprinnelige forfatteren og kilden krediteres
Finansiering:. Forfatterne har ingen støtte eller finansiering for å rapportere
konkurrerende interesser:. forfatterne har erklært at ingen konkurrerende interesser eksisterer
Innledning
Ifølge epidemiologi, hudkreft inkludert melanom og non. -melanoma er den vanligste typen kreft i hvite populasjoner [1]. Statistikk viser at forekomsten av hudkreft har vært økende i Europa og USA, særlig melanom, de siste to tiårene [2,3]. Hudkreft har flere histologiske undergrupper, inkludert melanom, plateepitelkarsinom (SCC) og basalcellekarsinom (BCC) [4]. Mange studier tyder på at ultrafiolett (UV) eksponering er en viktig risikofaktor for utvikling av hudkreft [5-7]. Men på molekylært nivå, den kreftfremkallende mekanisme UV har ikke blitt forklart enda.
TP53
genet er en tumor suppressor gen som kan regulere cellesyklus arrest, celle apoptose og DNA-reparasjon [8]. Derfor kalles det vokter av genomet. Mutasjoner av
TP53
genet er den vanligste genetiske abnormitet finnes i mange typer kreft hos mennesker, slik som lungekreft, tykktarmskreft, magekreft, hudkreft, et al [9]. Arg72Pro polymorfisme av
TP53
gen er en G-C-transversjon i kodon 72, noe som resulterer i en aminosyre-endring fra arginin (Arg) for å prolin (Pro) [10]. Studier har vist at
TP53
genet spiller en viktig rolle i den cellulære genomet beskyttelse mot UV-stråling [11,12]. Men den detaljerte molekylære mekanismen er uklar.
Mange studier de siste årene har undersøkt sammenhengen mellom
TP53
Arg72Pro polymorfisme og risikoen for hudkreft, men resultatene er fortsatt usikker. Dermed spilte vi denne meta-analyse av alle kvalifiserte case-control studier som har blitt publisert for å hjelpe oss til en bedre forståelse av påvirkning av
TP53
Arg72Pro polymorfisme.
Metoder
Publisering Søk
Vi søkte PubMed for publikasjoner frem til mars 2013 å bruke begrepene «TP53», «polymorfisme» og «hudkreft.» søket ble utført uten noen restriksjoner på språk. Dessuten, vi søkte referanselistene omtaler og hentet artikler manuelt. Når den samme pasientpopulasjon dukket opp i flere artikler, valgte vi den største prøven størrelse eller det nyeste
inklusjonskriteriene
De valgte studiene må ha oppfylt følgende hovedkriterier:. (1) godt designet case-control studier for å evaluere
TP53
Arg72Pro polymorfisme og risikoen for hudkreft; (2) hudkreft ble diagnostisert med patologi; (3) som inneholder nyttige genotypefrekvensene; og (4) fordelingen av genotyper blant kontrollene var i Hardy-Weinberg likevekt
Eksklusjonskriterier
eksklusjonskriteriene som følger med:. (1) genotypen frekvenser eller nummer ikke presentert; (2) dyrestudier, omtaler, kasuistikker, sammendrag og familiebaserte studier; (3) duplisering av en tidligere utgivelse.
Data Extraction
To etterforskere hentet informasjon fra utvalgte studier uavhengig, i henhold til inklusjons- og eksklusjonskriteriene ovenfor. Uenighet ble løst ved diskusjon eller en tredje etterforsker. Følgende informasjon ble samlet: første forfattere, årstall, etnisitet, karakteristikker av saker og kontroller (gjennomsnittsalder, fordeling av kjønn), histologisk type saker, genotyping metode, antall genotyper og det totale antall tilfeller og kontroller.
I papir av Rizzato et al den ikke kodende tråden har blitt genotypet, så vi invertert genotypene i hans avis.
Statistical Analysis
Styrken i sammenhengen mellom
TP53
Arg72Pro polymorfisme og risikoen for hudkreft ble evaluert av sammenslåtte odds ratio (ORS) med 95% konfidensintervall (cIS). De sammenslåtte ORS for dominerende modellen (Arg /Arg + Pro /Arg versus Pro /Pro), recessiv modell (Arg /Arg versus Arg /Pro + Pro /Pro), codominant modell (Arg /Arg versus Pro /Pro og Arg /Pro versus Pro /Pro) og allelet kontrast (Pro-allel versus Arg-allel) ble beregnet, respektivt. Stratifisert analysene ble utført av etnisitet og histologisk type hudkreft. Heterogeniteten antagelsen ble vurdert av Chi-kvadrat-baserte Q-test. Dersom P 0,05 av Q-test som antydet heterogenitet ble tilfeldig effekt modellen brukes til å beregne de samlede ORS. Ellers ble det faste effekt-modell vedtatt. Z-test ble anvendt for å bestemme den samlede ELLER med betydningen angitt ved P 0,05. Potensielle publikasjonsskjevhet ble anslått av Begg trakten tomten [13] og Egger test [14]. P 0,05 betydde ingen signifikant publikasjonsskjevhet. Alle over statistiske analysene ble utført med STATA programvare, versjon 12.0 (StataCorp, College Station, TX, USA). Strømanalyse ble utført ved hjelp av makt og Sample Size Beregning (PS) program (https://biostat.mc.vanderbilt.edu/wiki/Main/PowerSampleSize) [15].
Resultater
Studie Kjennetegn
En totalt 165 papirer ble innhentet av publikasjonen søk publisert før i mars 2013, og blant disse tjue oppfylte inklusjonskriteriene [16-35] (figur S1). Den ultimate tjue studiene var alt på engelsk, med 5276 tilfeller hudkreft og 5315 kontroller. De viktigste egenskapene ble oppsummert i tabell 1.
Førsteforfatter
År
Etnisitet
Country
Cases
Controls
Pro/Pro
Pro/Arg
Arg/Arg
Pro/Pro
Pro/Arg
Arg/Arg
Dokianakis2000CaucasianGreece351964112Marshall2000CaucasianEngland3183463939Bastiaens2001CaucasianThe Netherlands21131169107275O’Connor2001CaucasianIreland1114342091Cairey-Remonnay2002CaucasianFrance4165056685McGregor2002CaucasianEngland0581245717Gustafsson2004CaucasianSweden5193033162de Oliveira2004OtherBrazil00162916Gwosdz2006CaucasianGermany724181366114Han2006CaucasianUSA5529440945297474Pezeshki2006AsianIran10473486217162Stefanaki2007CaucasianGreece11445266673Bendesky2007OtherMexico25941221894126Queille2007CaucasianFrance2151363939Li2008CaucasianUSA4030046556350432Capasso2010CaucasianItaly308712323122139Almquist2011CaucasianUSA9455185147274446Rizzato2011CaucasianHungary, Romania, Slovakia4018629246178297Leob2012CaucasianUSA4163551917Pandish2012AsiaIndia196225327890MelanomasBastiaens2001CaucasianThe Netherlands74865107275Gwosdz2006CaucasianGermany724181366114Han2006CaucasianUSA158210445297474Stefanaki2007CaucasianGreece11445266673Li2008CaucasianUSA4030046556350432Capasso2010CaucasianItaly308712323122139SCCDokianakis2000CaucasianGreece01264112Marshall2000CaucasianEngland2141863939Bastiaens2001CaucasianThe Netherlands64041107275Cairey-Remonnay2002CaucasianFrance416505717McGregor2002CaucasianEngland0357456685Gustafsson2004CaucasianSweden5193033162Han2006CaucasianUSA1710415145297474Bendesky2007OtherMexico321181269418Almquist2011CaucasianUSA3722036647274446Leob2012CaucasianUSA4163551917Pandish2012AsiaIndia196225327890BCCDokianakis2000CaucasianGreece331564112Bastiaens2001CaucasianThe Netherlands84363107275McGregor2002CaucasianEngland0236656685Han2006CaucasianUSA2310815445297474Pezeshki2006AsianIran10473486217162Bendesky2007OtherMexico22741081894126Almquist2011CaucasianUSA5729548547274446Rizzato2011CaucasianHungary, Romania, Slovakia4018629246178297Table 1. Kjennetegn på undersøkelser som inngår i meta-analysen.
CSV ned CSV
De fleste av studiene (16 av 20) ble utført i kaukasiere. Av de tjue case-kontrollstudier, fire bare fokusert på melanoma [24,29-31], fem på SCC [17,20,22,34,35] og to på BCC [26,33]. Fire studier undersøkte både SCC og BCC [16,21,27,32]. To utforsket melanom, SCC og BCC [18,25]. To studier undersøkte ikke-melanom hudkreft, uten subtype spesifisert [19,28]. Og en utforsket hudkreft, histologisk subtype ikke nevnt [23]. Publikasjonen år var fra 2000 til 2012. utvalgsstørrelser varierte fra 43 til 1643. Alle saker ble patologisk bekreftet. Kontrollene var sunne bestander og matchet for alder, kjønn og etnisitet. Alle polymorfismer i kontrollene var i Hardy-Weinberg likevekt.
Meta-analyse resultater
Som vist i tabell 2, ble det ikke observert signifikant sammenheng mellom TP53 Arg72Pro polymorfisme og risikoen for hudkreft i hvilket genetisk modell og allel kontrast (Pro /Pro versus Arg /Arg, odds ratio (OR) = 1,07, 95% konfidensintervall (CI): 0,81 til 1,41; Pro /Arg versus Arg /Arg, OR = 0,93, 95% KI : 0,77 til 1,13; Pro /Pro + Pro /Arg versus Arg /Arg, OR = 0,93, 95% KI: 0,78 til 1,12; Pro /Pro versus Arg /Arg + Pro /Arg, OR = 1,08, 95% KI: 0,86 -1,35; Pro allel versus Arg allel, OR = 0,96, 95% KI: 0,84 til 1,10) (figur 1-5). Strøm beregninger på de samlede frekvenser indikerte at de statistiske kreftene var lavere enn 80% for alle de ovennevnte meta-analyser.
Sammen modeller
n
Case /Kontroll
OR (95% CI)
P
ELLER
jeg
2 (%)
P
H
Modell
Strøm beregning
Total205276 /5315Pro allel vs. Arg allele0.96 (0,84 -1,10) 0.58862.46 0.001random26.0% Pro /Pro vs. Arg /Arg1.07 (0,81 til 1,41) 0.65440.90.002random20.2% Pro /Arg vs. Arg /Arg0.93 (0,77 til 1,13) 0,46865 0,85 0.001random41.2% Pro /Pro + Pro /Arg vs. Arg /Arg0.93 (0,78 til 1,12) 0.45969.52 0.001random44.5% Pro /Pro vs. Arg /Arg + Pro /Arg1.08 (0,86 til 1,35) 0.5231.040.04random26.9% Caucasians164822 /4385Pro allel vs. Arg allele0.94 (0,81 til 1,09) 0.38547.54 0.001random44.4% Pro /Pro vs. Arg /Arg1.05 (0,77 til 1,43 ) 0.76832.410.006random11.5% Pro /Arg vs. Arg /Arg0.88 (0,72 til 1,06) 0.17746.99 0.001random81.0% Pro /Pro + Pro /Arg vs. Arg /Arg0.88 (0,73 til 1,07 ) 0.20350.61 0.001random84.4% Pro /Pro vs. Arg /Arg + Pro /Arg1.12 (0,86 til 1,46) 0.41725.990.038random44.5% ikke-Caucasians4454 /930Pro allel vs. Arg allele1.06 (0,68 -1,65) 0.79177.20.004random10.8% Pro /Pro vs. Arg /Arg1.10 (0,52 til 2,31) 0.80163.10.043random8.8% Pro /Arg vs. Arg /Arg1.22 (0,61 til 2,42) 0.57779.60.002 random36.5% Pro /Pro + Pro /Arg vs. Arg /Arg1.16 (0,59 til 2,26) 0.67180.50.001random24.4% Pro /Pro vs. Arg /Arg + Pro /Arg0.95 (0,66 til 1,36) 0,76437 .90.185fixed6.0% Melanoma61522 /2433Pro allel vs. Arg allele1.10 (0,87 til 1,39) 0.43775.40.001random45.2% Pro /Pro vs. Arg /Arg1.36 (0,82 til 2,26) 0.23265.90.012random67.1% Pro /Arg vs. Arg /Arg0.99 (0,76 til 1,28) 0.910630.019random5.2% Pro /Pro + Pro /Arg vs. Arg /Arg1.05 (0,079 til 1,39) 0.74571.10.004random11.6% Pro /Pro vs. Arg /Arg + Pro /Arg1.33 (0,87 til 2,03) 0.19154.40.052fixed62.3% SCC111455 /2643Pro allel vs. Arg allele0.76 (0,55 til 1,06) 0.11085.7 0.001random100.0% Pro /Pro vs. Arg /Arg0.62 (0,31 til 1,25) 0.18278.2 0.001random98.2% Pro /Arg vs. Arg /Arg0.85 (0,61 til 1,19) 0.34073.8 0.001random80.6% Pro /Pro + Pro /Arg vs. Arg /Arg0.75 (0,51 til 1,12) 0.15883.1 0.001random99.2% Pro /Pro vs. Arg /Arg + Pro /Arg0.72 (0,42 til 1,22) 0.21964.10.002random83.2% BCC82159 /3179Pro allel vs. Arg allele0.90 (0,75 til 1,08) 0.24566.30.004random65.5% Pro /Pro vs. Arg /Arg1.01 (0,81 til 1,26) 0.93130.70.183fixed5.1% Pro /Arg vs. Arg /Arg0.83(0.64-1.08)0.16372.50.001random88.1%Pro/Pro+Pro/Arg vs. Arg /Arg0.83 (0,64 til 1,07) 0.14074.1 0.001random79.1% Pro /Pro vs. Arg /Arg+Pro/Arg1.03(0.83-1.28)0.78722.90.247fixed5.7%Table 2. Hovedresultater resultater~~POS=HEADCOMP av meta-analyse for
TP53
Arg72Pro polymorfisme og hudkreft risiko
Forkortelser:. OR , odds ratio; KI, konfidensintervall; n, antall case-kontrollstudier; P
ELLER, P-verdi av Z-test; P
H, P-verdi for heterogenitet analyser; BCC, basalcellekarsinom; SCC, plateepitelkarsinom. CSV Last ned CSV
I stratifisert analyse av histologiske typer hudkreft, var det ingen bevis for en signifikant sammenheng mellom kodon 72 polymorfisme av
TP53
gen, og risikoen for melanom, SCC og BCC. Lignende resultater ble funnet i stratifisert analyse av etnisitet. Forskjellig fra andre undergrupper, styrkeberegning på SCC genet modellene var alle mer enn 80%, som avslørte tilstrekkelig utvalgsstørrelser (tabell 2).
publikasjonsskjevhet
publikasjonsskjevhet ble vurdert av Begg trakt tomt og Egger test. Formen på trakt tomter ble virket symmetrisk og resultatene av Egger test var ikke signifikant i alle de genetiske modeller (Pro /Pro versus Arg /Arg, Pro /Arg versus Arg /Arg, Pro /Pro + Pro /Arg versus Arg /Arg, Pro /Pro versus Arg /Arg + Pro /Arg, Pro allel versus Arg allel), som indikerte ingen publikasjonsskjevhet. Figur 6 viser Begg trakten tomt på generelle Pro /Pro versus Arg /Arg. I lagdelte analyser av etnisitet og histologiske typer, verken Begg trakten tomten heller Egger test presenteres noen åpenbare bevis på publikasjonsskjevhet (data ikke vist). Resultatene viste ingen publikasjonsskjevhet i vår meta-analyse.
Diskusjoner
TP53
tumorsuppressorgenet spiller en viktig rolle i cellesyklus arrest og aktivering av programmert celledød [8,36]. Mutasjoner av
TP53
genet er påvist i 50% av alle kreft hos mennesker og i nesten alle hudkreft [37]. Studier har vist at inaktivering av
TP53
gen omfatter i induksjon av hudkreft ved UV-bestråling [11,12,38]. Den vanligste polymorfisme av
TP53
gen finner i kodon 72, som er en G-C-transversjon, forårsaker en aminosyre-endring fra arginin (Arg) for å prolin (Pro) [10]. Funksjonene til de to polymorfe varianter av
TP53
genet er forskjellige. Ifølge studien utført av Dumont et al, induserer Arg72 variant celle apoptose merkbart bedre enn Pro72 varianten gjør [39]. Nylig har mange studier utforsket sammenhengen mellom
TP53
Arg72Pro polymorfisme og mottakelighet for hudkreft, men deres konklusjoner er motstridende. Derfor, vi utførte dette meta-analyse for å undersøke ytterligere påvirkning av
TP53
Arg72Pro polymorfisme på utvikling av hudkreft.
Resultatene antydet at ingen signifikant sammenheng mellom
TP53
Arg72Pro polymorfisme og risikoen for hudkreft i noen genetisk modell (Pro /Pro versus Arg /Arg, Pro /Arg versus Arg /Arg, Pro /Pro + Pro /Arg versus Arg /Arg, Pro /Pro versus Arg /Arg + Pro /Arg). I stratifisert analyse av etnisitet og histologiske typer hudkreft, var det ingen bevis for en signifikant sammenheng, ingen av delene. Våre resultater var lik den meta-analyse utført av Jiang i 2011 [40].
Men resultatene av vår meta-analyse bør tolkes med forsiktighet. Bortsett SCC undergruppe, de fleste av kraft beregninger på de samlede frekvenser lavere enn 80%, noe som viste utilstrekkelig utvalgsstørrelser.
Denne metaanalysen hadde også noen begrensninger. Først, gitt at bare tjue studier ble inkludert, publikasjonsskjevhet kan potensielt exit, selv om vi prøvde å finne så mange studier som vi kunne, vurderes nøye litteraturen og brukes statistiske metoder for å minimere publikasjonsskjevhet, og ingen statistisk signifikant publikasjonsskjevhet var observert i denne meta-analyse. For det andre, i stratifiserte analyser av etnisitet, ble de fleste studier gjennomført i kaukasiere, og informasjon om andre etniske grupper, som for eksempel afrikansk, var utilstrekkelig. Dermed er flere studier med større utvalg og høy kvalitet, spesielt for ikke-kaukasiske populasjoner for å demonstrere våre konklusjoner i fremtiden. Til slutt, tilhører case-control studie for å retrospektiv forskning som har metodiske svakheter.
Til tross for begrensninger, denne meta-analysen viste at
TP53
Arg72Pro polymorfisme trolig hatt liten tilknytning til risikoen for huden kreft hovedsakelig i kaukasiere. Likevel er det fortsatt nødvendig å gjennomføre større og bedre-laget studier for å utforske
TP53
Arg72Pro polymorfi så lave statistiske krefter.
Hjelpemiddel Informasjon
Figur S1.
Flytskjema av litteraturen.
doi: 10,1371 /journal.pone.0079983.s001 plakater (DOC)
Sjekkliste S1.
PRISMA sjekkliste.
doi: 10,1371 /journal.pone.0079983.s002 plakater (DOC)
