Innkalling Publisering
Denne artikkelen ble republisert 18. august 2014 fordi to av de 16 datasett fra TCGA (The Cancer Genome Atlas) som inngår i denne studien, dvs. livmorhalskreft (moratorium – 27 september 2014) og bukspyttkjertelen duktalt adenokarsinom (moratorium – 30 juli 2015), ble brukt i strid med publikasjonen retningslinjer på https://cancergenome.nih.gov/publications /publicationguidelines
forfatterne og TCGA enige om at en publisering av artikkelen med disse datasettene fjernes vil løse dette, og de ansatte Academic Editor og PLoS er tilfreds med at resultatene og konklusjonene i artikkelen står uten disse to datasett. Vi publiserer artikkelen for å rapportere resultatene fra de 14 tillatte datasettene
Oppsummeringen av resultatene i sammendraget var tidligere.
Vi har gjennomført GISTIC2 analyse av TCGA datasett som strekker seg over 16 kreft subtyper og identifiseres 486 gener som ble forsterket i to eller flere datasett. Listen ble redusert til 75 kreftassosierte gener med potensielle «druggable» egenskaper. Flertallet av genene ble lokalisert til 14 amplikonene spredt over hele genomet. For å identifisere potensielle kreft driver gener, analyserte vi genkopitallet og mRNA uttrykk data fra individuelle pasientprøver og identifisert 42 mulige kreft driver gener knyttet til ulike onkogene prosesser
Oppsummeringen av resultatene i det abstrakte er nå.:
Vi har gjennomført GISTIC2 analyse av TCGA datasett som strekker seg over 14 kreft subtyper og identifisert 461 gener som ble forsterket i to eller flere datasett. Listen ble redusert til 73 kreftassosierte gener med potensielle «druggable» egenskaper. Flertallet av genene ble lokalisert til 13 amplikonene spredt over hele genomet. For å identifisere potensielle kreft driver gener, analyserte vi genkopitallet og mRNA uttrykk data fra individuelle pasientprøver og identifisert 40 mulige kreft driver gener knyttet til ulike onkogene prosesser.
Referanse
1. Chen Y, McGee J, Chen X, Doman TN, Gong X, et al. (2014) Identifisering av Druggable Cancer Driver Gener Amplified over TCGA datasett. PLoS ONE 9 (5): e98293 doi: 10,1371 /journal.pone.0098293.
Se artikkel
PubMed /NCBI
Google Scholar
Citation:
PLoS ONE
Staff ( 2014) Korreksjon: Identifikasjon av Druggable Cancer Driver Gener Amplified over TCGA datasett. PLoS ONE ni (9): e107646. doi: 10,1371 /journal.pone.0107646
Publisert: 02.09.2014
Copyright: © 2014 PLoS ONE Staff. Dette er en åpen-tilgang artikkelen distribueres under betingelsene i Creative Commons Attribution License, som tillater ubegrenset bruk, distribusjon og reproduksjon i ethvert medium, forutsatt den opprinnelige forfatteren og kilden krediteres.
