Abstract
Bakgrunn
RAS foreningen domene familie protein 1a genet (
RASSF1A
) er en av de tumorsuppressorgener (
TSG
). Inaktivering av
RASSF1A
er kritisk til patogenesen av kreft. Avvikende
TSG
metylering ble ansett som en viktig epigenetisk stanse mekanisme i utviklingen av eggstokkreft. En rekke studier har diskutert sammenhengen mellom
RASSF1A
promoter metylering og eggstokkreft. Men de var for det meste basert på et lite antall prøver og viste inconsist resultater, derfor har vi gjennomført en meta-analyse for å bedre identifisere foreningen.
Metoder
Kvalifiserte studier ble identifisert ved å søke PubMed, EMBASE, Web of Science, og CNKI databaser ved hjelp av et systematisk søk strategi. Vi samlet odds ratio (ORS) fra enkeltstudier ved hjelp av en fast effekt-modell. Vi utførte heterogenitet og publikasjonsskjevhet analyse samtidig.
Resultater
Tretten studier, med 763 eggstokkreft pasienter og 438 kontroller ble inkludert i meta-analysen. Frekvensene for
RASSF1A
promoter metylering varierte fra 30% til 58% (middelverdi er 48%) i gruppen kreft og 0 til 21% (median er 0) i kontrollgruppen. Frekvensene for
RASSF1A
promoter metylering i kreft gruppen var signifikant høyere enn i kontrollgruppen. Den samlede odds ratio var 11,17 (95% CI = 7,51 til 16,61) i kreft gruppen kontra tilsvarende kontrollgruppe under faste effekt-modell.
Konklusjon
Resultatene antydet at
RASSF1A
promoter metylering hadde en sterk tilknytning til eggstokkreft
Citation. Shi H, Li Y, Wang X, Lu C, Yang L, Gu C, et al. (2013) Sammenheng mellom
RASSF1A
Arrangøren Metylering og eggstokkreft: A Meta-Analysis. PLoS ONE 8 (10): e76787. doi: 10,1371 /journal.pone.0076787
Redaktør: J.Christopher stater, University of Louisville, USA
mottatt: 13. juni 2013, Akseptert: 3. september 2013, Publisert: 08.10.2013
Copyright: © 2013 Shi et al. Dette er en åpen-tilgang artikkelen distribueres under betingelsene i Creative Commons Attribution License, som tillater ubegrenset bruk, distribusjon og reproduksjon i ethvert medium, forutsatt den opprinnelige forfatteren og kilden krediteres
Finansiering:. Forfatterne har ingen støtte eller finansiering for å rapportere
konkurrerende interesser:. forfatterne har erklært at ingen konkurrerende interesser eksisterer
Innledning
Eggstokkreft er den femte vanligste årsaken til kreft. dødsfall hos kvinner og står for den høyeste svulst relatert dødelighet av gynekologiske kreftformer. Omtrent 1,5% av kvinner lider av kreft i eggstokkene og de fleste tilfellene blir diagnostisert ved sent stadium på grunn av mangel på effektive metoder for tidlig deteksjon [1], [2]. Over 80% av pasienter med avansert eggstokkreft tilbakefall [3]. Mens 5-års overlevelse er nær 30% [4].
Hypermethylation av tumor suppressor genet (
TSG
) promoter kan føre til genet inaktivering, som er kritisk til patogenesen av kreft, og opptrer alltid i tidlig stadium av kreft utvikling i mange typer kreft, inkludert eggstokk-kreft [5], [6]. Noen studier viser også at metylering av
TSG
ble påvist i svulstvev og var assosiert med kliniske [7], [8]. RAS foreningen domene familie protein 1A (
RASSF1A
) er en antatt tumor suppressor genet ligger på tre p21 spenner over 11 000 bp, som inneholder åtte eksoner og to forskjellige arrangører [9]. Epigenetisk inaktivering av genet ofte resultat av metylering av CpG øyer i promotorene [5]. En in vitro-undersøkelse viste at avvikende metylering ble hyppig observert i ovarie cancer-cellelinjer [10]. Disse studiene viste at metylering av
RASSF1A
promoter kan spille en viktig rolle i utviklingen av eggstokkreft.
Noen studier har rapportert forskjeller i metylering frekvenser av
RASSF1A
mellom kreft vev og ikke-cancervev. Men de var for det meste basert på et lite antall prøver og viste inconsist resultater. Derfor utførte vi en meta-analyse for å bedre identifisere sammenhengen mellom
RASSF1A
promoter metylering og eggstokkreft.
Materialer og metoder
Søk Strategi og studievalg
Online elektroniske databaser (PubMed, EMBASE, Web of Science, og China National Knowledge Infrastructure (CNKI)) ble søkt etter publiserte studier 1. juni ble 2013. følgende søkestrategi utført i PubMed: (ovarial eller eggstokk) OG (kreft eller carcinoma eller svulst) OG (
RASSF1A
metylering). Den tilsvarende søkestrategi ble benyttet i andre databaser. Søket ble begrenset til humane studier, uten språkrestriksjoner. En studie som inngår i meta-analysen måtte oppfylle følgende kriterier: 1) studier som evaluerte foreningen av
RASSF1A
metylering med eggstokkreft, 2) en case-control studie eller en inkludert case og kontroll populasjoner, 3) en undersøkelse rapporterer
RASSF1A
metylering frekvens i saken og kontrollgrupper, 4) prøvetype begrenset til vev. Først ble tittelen og sammendrag av studier fra det første søket evaluert i henhold til inklusjonskriteriene. Da vil alle potensielt relevante studier ble vurdert som fulltekstoppgaver. Hvis en studie ble publisert mer enn en gang, bare den mest komplette og up-to-date informasjon ble inkludert i meta-analysen. Figur 1 viser detaljert informasjon om studien utvelgelsesprosessen. Til slutt, i alt 13 studier (PubMed 7, Web of Science 1, og CNKI 5) med 763 tilfeller og 438 kontroller ble inkludert i vår meta-analyse.
Data Utvinning og Quality Assessment
Tre lesere (Hao Shi, Ya Li, og Changmei Gu) uavhengig anmeldt de utvalgte studiene. Følgende informasjon ble hentet fra disse studiene: første forfatternavn, utgivelsesår, studiepopulasjonen, utvalgsstørrelse, alder på kvinner når det gjelder gruppen, kontrolltype, status for individene i kontrollgruppen, antall personer i case og kontrollgrupper, målemetoder metylering, og modulering frekvenser av
RASSF1A
i saken og kontrollgruppene. All detaljert informasjon i de inkluderte studiene ble sjekket av fire lesere (Meixia Lu, Shixuan Wang, Xiaozhong Wang, og Yangxin Huang) som foreskrevet av Cochrane Handbook for systema.
Kvaliteten på disse studiene ble evaluert i henhold til Newcastle Ottawa Scale (NOS) (https://www.ohri.ca/programs/clinical_epidemiology/oxford.asp). NOS har maksimalt ni «stjerner» på elementer knyttet til valg av studiegruppene (fire stjerner), sammenlignbarhet av gruppene (to stjerner) og konstatering av utfallet av rente (tre stjerner). Studiene ble uavhengig evaluert basert på NOS av tre korrekturlesere (Cheng Lu, LILAN Yang, og Jiaqiang Xiong). Studier med kvalitetspoeng større enn eller lik 5 ble inkludert.
Statistical Analysis
For å vurdere styrken på sammenhengen mellom
RASSF1A
metylering og eggstokkreft de samlede odds ratio (ORS) og deres 95% konfidensintervall (cIS) ble beregnet.
x
2-basert Cochran Q statistikk test og
Jeg
2 statistikk ble brukt til å teste heterogenitet blant de inkluderte studiene [11]. De utvalgte studiene ble vurdert til å ha en alvorlig heterogenitet når
Jeg
2 var større enn 50%. Når
P
0,05 for Q-statistikken, heterogeniteten ble betraktet som signifikant og en tilfeldig effekt-modellen (DerSimonian-Laird estimat) ble brukt til å beregne de samlede ORS. Ellers ble en fast effekt-modell (den Mantel-Haenszel metoden) anvendt. En meta-regresjon (begrenset maksimal sannsynlighet estimator metode) ble ansatt for å utforske kilden til heterogenitet. Videre ble en undergruppe analyse utført for å vurdere kilden for heterogeniteten. Bidraget fra hver studie til de endelige resultatene av meta-analysen ble evaluert i henhold til sensitivitetsanalyse. Vi har også brukt Peters test, Begg rang korrelasjon metode [12] og en trakt tomt for Egger test [13] for å vurdere publikasjonsskjevhet. Den feilsikre nummer [14] ble også anvendt for å vurdere publikasjonsskjevhet. I vår studie, alle
p
verdiene var to sider med et betydelig nivå på 0,05. Når de enkelte studier har celler med null teller, er standard å legge 0,5 til alle null teller i Meta pakken. Alle statistiske analyser ble utført med Meta-pakken [15] (versjon 2,2 til 1) i R (versjon 3.00, https://www.r-project.org/).
Resultater
studier Kjennetegn og kvalitetsvurdering
i alt tretten studier med 763 tilfeller og 438 kontroller ble inkludert i meta-analysen. 115 studier ble først identifisert ved å søke i elektroniske databaser. 84 potensielt relevante studier ble hentet for videre evaluering etter fjerning 31 dupliseres artikler. Basert på sine titler og sammendrag, ble 61 studier ekskludert (5 anmeldelser eller møte anmeldelser, 2 cellelinjer, 6 avhandlinger, 40 irrelevante artikler, og 8 papirer som ikke har fulltekstversjoner). Fire studier uten kontrollgruppe og seks studier uten
RASSF1A
metylering data ble ekskludert fra fulltekst gjennomgang. Studiene ble utgitt mellom 2001 og 2012, og dekket fra 20 til 110 tilfeller. Til slutt, 13 studier ble inkludert i meta-analyse. Åtte studier var av asiatisk fag og fem studiene var av kaukasiske fag. Seks studier analysert metylering av
RASSF1A
promoter CpG øyer [16] – [21] og sju studier analysert
RASSF1A
arrangøren metylering [22] – [28]. Saken gruppe besto av kreft vev danner eggstokkreft pasienter. Kontrollgruppen inkludert tilstøtende vev (AT) fra eggstokkreft pasienter, eggstokkvev fra godartede ovariesyndrom pasienter (BOT) og normal eggstokkvev fra kreftfrie pasienter eller friske personer (NT). Blant de 13 inkluderte studiene, 11 studier benyttet metylering-spesifikke polymerase kjedereaksjon (MSP), en studie benyttet metylering-spesifikk multiplex ringsavhengig probe forsterkning (MS-MLPA) og en studie benyttet bisulfitt sekvensering av PCR (BSP) for å utforske
RASSF1A
metylering i eggstokkreft og kontroll. Karakteristika for de 13 studiene er presentert i tabell 1.
Resultatene av NOS viste at de fleste studier hadde et sykehus kontroll med unntak av Li [26] og hadde ikke matchet kontroll i henhold til den potensielle confounder bortsett Ibanez [20]. Poengsummen av studiene varierte 5-8 med en median score på 7. Detalj informasjon av NOS ble vist i tabell 2.
Meta-analyse
x
2-basert Cochran Q statistikk test og
jeg
2 statistikken ikke oppdage en betydelig heterogenitet blant de inkluderte studiene (
i
2
= 29,0%, Q = 16,9,
P =
0,15). Deretter brukte vi en fast effekt-modell for å vurdere sammenhengen mellom
RASSF1A
promoter metylering og eggstokkreft. I meta-analyse,
RASSF1A
promoter metylering frekvens var signifikant assosiert med kreft i eggstokkene (Summary OR var 11.17, 95% CI = 7,51 til 16,61) (fig. 2).
Meta-regresjon og subgruppeanalyse
Selv om testene ikke fant en signifikant heterogenitet på tvers av studiene, må vi først gjennomført meta-regresjon for å utforske potensielle kilder til heterogenitet. Basert på tidligere studier antok vi at heterogenitet kan komme fra befolkningen gruppen, utvalgsstørrelse og kontrollutvalget type. Vi gjennomførte en multippel regresjonsmodell med tre variabler (dvs. befolkningen undergruppe, publisering år, og saken utvalgsstørrelse). Til slutt, ble ingen kilde av sterk heterogenitet funnet (tabell 3). Vi utførte en subgruppeanalyse å ytterligere evaluere kilden til heterogenitet i henhold til befolkningsgrupper, case utvalgsstørrelse og kontroll type.
I subgruppeanalyse, OR mellom
RASSF1A
promoter metylering og eggstokkreft var 14,76 (95% CI = 5,73 til 38,01) i asiater og 6,85 (95% CI = 3,46 til 13,58) i kaukasiere under faste effekt-modell. Tilsvarende OR for saken utvalgsstørrelsen gruppen var 8,93 (95% CI = 4,43 til 18,42) i 50 tilfelle gruppe under den faste effekt-modell, og 11,19 (95% CI = 4,83 til 25,96) i ≥50 Hvis gruppen under tilfeldig effekt modell. I undergruppeanalyse av kontroll type, OR var 8,43 (95% CI = 4,03 til 17,63) i BAT gruppen inkludert godartede eggstokkene vev og tilstøtende vev under tilfeldig effekt-modell og 16.50 (95% CI = 6,82 til 39,88) i NT gruppen under faste effekt-modell (tabell 4).
Sensitivity Analysis
Ifølge sensitivitetsanalyse av odds ratio varierte fra 9,16 (95% CI = 6,07 til 13,81) til 12.99 (95% CI = 8,40 til 20,08) ved å utelate en enkelt studie under random-effekt modell (fig. 3). Ingen enkelt studie ble funnet å påvirke den samlede OR som indikert av sensitivitetsanalyse.
publikasjonsskjevhet
Studiet av Peters [29] viste at type I feil priser for Egger test [13] er høyere enn for alternativ regresjon test når sammendrags estimatene er lnORs. Derfor ble Begg rang korrelasjon, en trakt tomt og Peters test benyttet for å vurdere publikasjonsskjevhet av litteraturen. Formen på Begg trakten plottet i Figur 4 viser en mulig asymmetri men Peters test oppdaget ikke publikasjonsskjevhet (
P =
0,48) og Begg rang korrelasjon også oppdaget ikke publikasjonsskjevhet (
P =
0,14). Den feilsikre tall (
Z
= 48,23, N
fs0.05 = 851,98, N
fs0.01 = 415,53) foreslo også at studien hadde en svært liten grad av publikasjonsskjevhet.
Diskusjoner
RASSF1A
modulerer flere apoptotisk, tubulin dynamikk og cellesyklus sjekkpunkt veier. Noen studier har funnet at overekspresjon av
RASSF1A
fremmer apoptose og cellesyklus arrest i kreftcellelinjer [9], [30].
RASSF1A
kan inaktiveres av genmutasjon og pådriver metylering og sistnevnte sto for de aller fleste tilfellene [9].
RASSF1A
promoter metylering er en av de hyppigste epigenetiske inaktive hendelser påvist i menneskelig kreft og fører til knebling av
RASSF1A
uttrykk [31]. Tap av
RASSF1A
uttrykk har blitt rapportert i lunge, bryst, blære, mage, kolangiokarsinom og øsofagus sqaumous cell carcinoma primærsvulster [32] -. [36]
Den nåværende meta-analysen inkluderte tretten artikler med 763 tilfeller og 438 kontroller.
RASSF1A
metylering nivå av kreft gruppen var signifikant høyere enn i kontrollgruppen. Den samlede odds ratio under fast-effekt modellen var 11,17 (95% CI = 7,51 til 16,61) i krefttilfeller versus kontrollene. Resultatet viste at
RASSF1A
promoter metylering var assosiert med kreft i eggstokkene, som var i samsvar med tidligere studier [22], [23].
sammendraget eller var 14,76 (95% KI = 5,73 -38,01) i asiater og 6,85 (95% CI = 3,46 til 13,58) i kaukasiere. Sammenhengen mellom
RASSF1A
promoter metylering og eggstokkreft i asiater var sterkere enn i kaukasiere. Tilsvarende Fraser studie observert divergens av DNA metylering mellom afrikanske og europeiske befolkningen, noe som kan skyldes metylering-forbundet SNPs (mSNPs) og komplekse epistasis eller genet × miljø interaksjoner [37].
For sample størrelse, Sammendrag OR var 8,93 (95% CI = 4,43 til 18,42) i 50 case-gruppen og 11,19 (95% CI = 4,83 til 25,96) i ≥50 tilfelle gruppen. I en annen undergruppe endret sammendraget eller litt mellom 50 case-gruppen og ≥50 saken gruppe. ORS for annen kontroll gruppen var 8,43 (95% CI = 4,03 til 17,63) for BAT-gruppen og 16,50 (95% CI = 6,82 til 39,88) for NT-gruppen. Dette resultat viste at forskjellen i frekvens av
RASSF1A
promoter metylering mellom huset gruppen og NT-gruppen var større enn mellom det gjelder gruppen og BAT-gruppen. Resultatet viste at godartede eggstokkene vev og tilstøtende vev hadde en høyere frekvens av
RASSF1A
arrangøren metylering enn normalt eggstokkvev, som også antydet at
RASSF1A
promoter metylering kan spille en viktig rolle i patogenesen av ovarialcancer [23], [38].
det var noen begrensninger i studien. Den første begrensningen er potensial confounder. Fordi det var en mangel på informasjon om variabler i kontrollgruppen, vi bare betraktet tre variabler (befolkning, case utvalgsstørrelse, og kontroll type) i subgruppeanalyse. En annen mulig konfunderende faktorer kan eksistere i meta-analysen. Den andre begrensningen er publikasjonsskjevhet. Selv om ingen signifikant publikasjonsskjevhet ble funnet i henhold til Peters test, kan negative og upubliserte studier føre til noen bias.
I konklusjonen, hypermethylation av
RASSF1A
promoter ble funnet å være assosiert med eggstokkreft i henhold til meta-analyse, som antydet at arrangøren metylering av
RASSF1A
er et potensielt nyttig biomarkør i kreftfremkallende prosessen med eggstokkreft. Denne studien krever bekreftelse gjennom veldesignede prospektive studier.
Hjelpemiddel Informasjon
Sjekkliste S1.
PRISMA Sjekkliste
doi:.. 10,1371 /journal.pone.0076787.s001 plakater (docx)
bekreftelser
Forfatterne takke Helen Neumann for å redigere artikkelen
