Abstract
Aim
Nåværende fekal screening verktøy for tykktarmskreft (CRC), som fekal okkult blod tester (FOBT), er begrenset av deres lave følsomhet. Calgranulin B (CALB) ble tidligere rapportert som en kandidat fekal markør for CRC. Denne studien undersøkte om en kombinasjon av FOBT og avføring CALB har økt sensitivitet og spesifisitet for diagnosen CRC.
Materialer og metoder
Pasienter med CRC (
n
= 175), og friske individer (kontroller;
n
= 151) ble rekruttert inn i utviklingen (81 tilfeller og 51 kontroller) og validering (94 tilfeller og 100 kontroller) sett. Avføringsprøver ble tatt før tarm forberedelse. CALB nivåer ble bestemt ved Western blotting. FOBT og fekal CALB resultater ble brukt til å utvikle en prediktiv modell basert på logistisk regresjonsanalyse. Fordelen med å legge CALB til en modell med bare FOBT ble vurdert som en økt areal under mottakeren drifts kurven (AUC), delvis AUC, og reklassifisering forbedring (RI) i saker og kontroller, og netto reklassifisering forbedring (NRI).
Resultater
Mean CALB nivået var signifikant høyere hos CRC pasienter enn hos kontrollgruppen (
P
0,001). CALB var ikke forbundet med tumor stadium eller kreft området, men positivitet på FOBT var betydelig høyere i avansert enn i tidligere kreft stadier. Ved en spesifisitet på 90%, kryss validert AUC og sensitivitet var 89,81% og 82,72%, henholdsvis, i utviklingen settet, og 92,74% og 79,79%, henholdsvis, i valideringssettet. Den inkrementelle fordelen med å legge CALB til modellen, slik som vist ved økningen i AUC, hadde en p-verdi på 0,0499. RI i saker og kontroller og NRI alt avslørt at å legge CALB betydelig forbedret prediksjon modell.
Konklusjon
En prognosemodell ved hjelp av en kombinasjon av FOBT og CALB kan ha større sensitivitet og spesifisitet og AUC for forutsi CRC enn modeller med en enkelt markør
Citation. Kim BC, Joo J, Chang HJ, Yeo HY, Yoo BC, Park B, et al. (2014) en prediktiv modell Kombinerer Fecal Calgranulin B og fekal okkult blod tester kan forbedre diagnostikk av tykktarmskreft. PLoS ONE ni (9): e106182. doi: 10,1371 /journal.pone.0106182
Redaktør: John Souglakos, Universitetet General Hospital i Heraklion og Laboratorium for Tumor Cell Biology, School of Medicine, University of Crete, Hellas
mottatt: April 14, 2014; Godkjent: 28 juli 2014; Publisert: 04.09.2014
Copyright: © 2014 Kim et al. Dette er en åpen-tilgang artikkelen distribueres under betingelsene i Creative Commons Attribution License, som tillater ubegrenset bruk, distribusjon og reproduksjon i ethvert medium, forutsatt den opprinnelige forfatteren og kilden krediteres
Data Tilgjengelighet:. Den forfatterne bekrefter at alle data som underbygger funnene er fullt tilgjengelig uten restriksjoner. Alle relevante data er i avisen og dens saksdokumenter filer
Finansiering:. Støttende fundamenter: Denne forskningen ble støttet av stipend fra National Cancer Center of Korea (NCC-1240830-1), og ved Fallende Forskning Senter Program finansiert av departementet for utdanning, vitenskap og teknologi (prosjekt nr 2013K000271). Finansiører hadde ingen rolle i studiedesign, datainnsamling og analyse, beslutning om å publisere, eller utarbeidelse av manuskriptet
Konkurrerende interesser:.. Forfatterne har erklært at ingen konkurrerende interesser eksisterer
Innledning
tykktarms~~POS=TRUNC kreft~~POS=HEADCOMP (CRC) er den tredje vanligste kreftformen i verden [1], og dens utbredelse i Korea øker dramatisk [2]. Som andre kreftformer, overlevelsen av pasienter med CRC er nært knyttet til scenen på diagnose. Tidlig påvisning av CRC er ikke bare forbundet med forbedrede resultater [3], men også reduserer kostnadene for behandlingen signifikant. Nåværende screeningtester for CRC involvere påvisning av blod i avføringsprøver og visualisering av brutto unormalt ved koloskopi. Selv om kolonoskopi er fremdeles gullstandardmetoden for CRC-screening, diagnose og behandling, er det invasiv og assosiert med dårlig pasientens aksept og høye kostnader. I kontrast, avføringsprøver er ikke-invasiv, ikke krever tarm forberedelse, kan representere hele tykktarmen, og er egnet for masse screening, og prøvene er enkle å transportere [1].
Krakk markører er for tiden klassifisert som de som lekker gjennom, utskilles av eller faller av fra neoplastiske celler [4], [5]. Hemoglobin er et protein som lekket målt på konvensjonell fekalt skjult blod (FOBT), som er mye brukt i stor skala CRC screeningprogrammer [1], [6] – [10]. Calprotectin er en annen lekket protein som kan være en markør for CRC [7], [9], [11]. Disse markørene har imidlertid relativt dårlig sensitivitet og spesifisitet. Faktisk, er det fortsatt ingen ikke-invasive screeningverktøy som viser høy sensitivitet og høy spesifisitet for CRC.
Forhøyede nivåer av calgranulin B (CALB) har blitt påvist i avføringsprøver fra CRC pasienter [7]. Calprotectin er en heterodimer som består av calgranulin A og CALB forbundet ved hjelp av et peptid bro. CALB viste høyere følsomhet, men lavere spesifisitet for CRC enn FOBT [7]. Vi antok at en kombinasjon av kandidat fecal markører, snarere enn en enkelt markør, ville forbedre diagnose av CRC. Vi har derfor prospektivt undersøkt om kombinasjonen av FOBT og CALB forbedret sensitivitet og spesifisitet av enten alene i diagnostisering CRC.
Materialer og metoder
studiedesign
Forsøkspersonene ble delt inn i to uavhengige sett, en utvikling og en valideringssett. Utviklingen kohorten besto av pasienter fra vår forrige undersøkelse [7], hvor vi først utført western blot analyse av CALB, etterfulgt av ELISA analyse. Western blot analyse ble utført på prøver fra 81 pasienter med CRC. Utviklingen sett denne studien inkluderte disse 81 CRC pasienter og 51 kontroller. Siden vi fant interessante resultater ved å legge CALB data fra western blot analyse for å FOBT, forsøkte vi å validere modellen i en uavhengig pasient kohort. Utvalgsstørrelsen for valideringssettet var basert på tidligere resultater [12], som viste at 85 case-fagene vil være behov for en forventet sensitivitet på 85% og for å gi en 95% sannsynlighet for at den estimerte 95% lavere sikkerhetsgrense på sensitivitet ville være over 75%. Beregning at frafallet på grunn, for eksempel, for å prøve å mislykkes, ville være 10%, beregnet vi at 94 case-fag, uavhengig av utviklingen årsklasse, ville være nødvendig. Ingen av disse pasientene droppet ut, imidlertid, og alle 94 pasienter ble inkludert i valideringssettet. En tilsvarende beregning ble utført for kontrollpersoner, men noe mer ble behandlet på grunn av økt tilgjengelighet. Følgelig ble 100 kontrollindivider uavhengig av utviklingen kullet som inngår i valideringssettet. Basert på 94 forsøkspersoner, beregnet vi at ved en spesifisitet på 90%, ville den beregnede 95% lavere konfidensintervall for spesifisitet være over 75% og 80% i 99% og 85% av individene, respektivt. Tilsetning av ytterligere seks fagene vil øke disse sannsynlighetene til 99,5% og 87,3%, henholdsvis.
Fag og avføringsprøver
Forsøkspersonene ble delt inn i en utvikling sett og en valideringssettet. Utviklingen sett inkluderte 81 pasienter diagnostisert med CRC og 51 kontroller, av gjennomsnittlig (SD) alder 63,16 (10,42) år og 50.24 (10.12) år, henholdsvis. Valideringssettet inkluderte 94 pasienter med CRC og 100 kontroller, av gjennomsnittlig (SD) alder 62,96 (11,97) år og 49.43 (10.78) år, henholdsvis.
CRC ble diagnostisert ved koloskopi og histopatologi. Alle histopatologiske undersøkelser ble utført av en enkelt gastrointestinal patolog (HJ Chang) og resultatene ble klassifisert i henhold til Verdens helseorganisasjon retningslinjer, med karsinom klassifisert etter amerikanske Joint Committee on Cancer scenen [13], [14]. Lesjoner ble også klassifisert i henhold til deres plassering i høyre eller venstre side av tykktarmen. Den høyre colon ble definert som strekker seg fra coecum til milt flexus, mens venstre colon ble definert som strekker seg fra den synkende kolon til rektum [15]. Alle fag i kontrollgruppen hadde negative funn på koloskopi.
Alle deltakere inkludert gikk koloskopi, med forberedelser og sedasjon avhengig lagt egenskaper. Avføringsprøver ble tatt før tarm forberedelse.
Vi ga skriftlig informert samtykke og forklarte informasjon om studien til deltakerne ved forskningskoordinatorer før de deltok denne studien. Etter at de helt forstått og akseptert denne studien inngikk de et informert samtykkeskjema. Forsknings protokoller for denne studien ble gjennomgått og godkjent av Institutional Review Board of National Cancer Center, Korea (NCCNTS-08-354).
Krakk prøveopparbeidelse
Avføringsprøver (0,1 g i 0,3 ml PBS) inneholdende proteaseinhibitorer ble vortex-blandet og sentrifugert ved 12000 x g i 10 min. Supernatantene inneholdende ekstraherte proteiner ble samlet opp uten å forstyrre de pellets og anvendt for Western blotting.
Western blotting
ekvivalente mengder av avføring protein (10 ug) ble underkastet SDS-PAGE og overført til PVDF membraner (Millipore, Bille, MA). Membranene ble inkubert i 2 timer ved 4 ° C i 1% Tween 20-TBS inneholdende 1,5% ikke-fettholdig tørrmelk (Bio-Rad, Berkeley, CA) og 1 mM MgCl
2 for å blokkere ikke-spesifikk binding, og deretter ble inkubert i 2 timer ved romtemperatur med primære antistoffer mot CALB (både fra Santa Cruz Biotechnology, Santa Cruz, CA). Etter tre gangers vask i 15 minutter hver med blokkeringsløsning, ble membranene inkubert med fortynnet HRP-konjugert sekundært antistoff (Southern Biotech, Birmingham, UK) i 1 time ved romtemperatur. Membranene ble igjen vasket tre ganger i 15 minutter hver med blokkeringsløsning, inkuberes med WEST-ZOL® plus kjemiluminescens-reagens (intron Biotechnology, Gyeonggi, Korea) i 1 minutt, og eksponert for film (Kodak blå XB-1; Kodak, Rochester , New York). Den optiske tetthet (vilkårlig enhet) av CALB signaler ble målt ved
TINA 2.10e
programvare (Raytest Isotopenmessgeraete GmbH, Straubenhardt, Tyskland), og det relative nivået av CALB i avføring ble kvantifisert ved å sammenligne nivået av uttrykk i avføringsprøver, slik at i den humane brystkreftcellelinjen SK-BR-3 (10 ug).
FOBT
FOBT ble utført ved anvendelse av en OC-sensor kit (EIKEN Chemical Co. Ltd. , Tokyo, Japan), ifølge produsentens instruksjoner, ved forskere forblindet til kilden for hver prøve. FOBT brukt i denne studien ikke krever kosttilskudd restriksjoner. Den analytiske cut-off for FOBT positivitet var 100 ng Hb /ml.
Statistisk analyse
Mellom gruppenivå CALB ble testet ved hjelp av ikke-parametriske metoder (Wilcoxon rank sum test og Kruskal- Wallis test). Andelen av prøver positive for FOBT i to grupper ble sammenlignet ved hjelp av Pearsons kji-kvadrat test. Barnekonvensjonen prediktive modellen ble utviklet basert på logistisk regresjon, som beregner sannsynligheten for CRC basert på utforskende variabler. For å imøtekomme den ikke-normalitet av CALB målinger, ble deres rang brukt i logistisk regresjonsanalyse som en kovariat [16].
To prediksjonsmodeller ble vurdert. Den første modellen brukes kun FOBT, og andre inkluderte både FOBT og CALB. På grunn av ubalanser i alder mellom CRC pasienter og kontroller i både utviklings- og valideringssett, ble alder justert for i begge modellene. Evnen av disse modellene for å utføre i en uavhengig kohort ble bedømt ved mottakeren driftskurve (ROC) analyse; områdene under ROC-kurven (AUC), og delvis områdene under kurven (pAUC), tilsvarende en spesifisitet 0.9 ble først validert internt bruke leave-one-out kryssvalidering (LOOCV) teknikk. Etter intern validering, ble de prediksjonsmodeller bygget med utviklingen sett brukt til valideringssettet, og forestillinger av modellene ble vurdert eksternt. Når begge de indre og ytre validations viste akseptabel ytelse, ble den endelige prediktiv modell for bruk i fremtidige fag utviklet ved hjelp av den totale datasettet, bestående av både utvikling og valideringssett, fordi nøyaktigheten i å estimere effektene av risikofaktorene øker med økende utvalgsstørrelse [17]. Skjematisk av disse modellen utvikling prosedyrer er vist i figur S1.
Den inkrementelle fordel for en ny markør, CALB, ble vurdert ved å bestemme økninger i AUC og pAUC, reklassifisering forbedringer (RI) for saker og kontroller, og netto -reclassification forbedringer (NRI) [18]. AUC-måler hvor godt modellen skiller mellom CRC-pasienter og kontroller, og det kan tolkes som sannsynligheten for at en modell vil tildele høyere sannsynlighet til en CRC pasient enn til en styre emne. Den pAUC bare anser ROCer tilsvarende forhåndsinnstilte verdier av sensitivitet eller spesifisitet; i denne studien, spesifisiteter 0,9 ble vurdert, noe som gjør 10% av maksimal oppnåelig verdi. Statistisk signifikant økning i AUC og pAUC, er imidlertid vanskelig å bestemme for prediktive modeller med rimelig god ytelse. NRI er et alternativt mål foreslått for å overvinne dette problemet [18]. For å måle NRI er RI først beregnet separat for pasienten og kontrollgrupper. RI i CRC pasienter ble definert som andel individer som har beregnet sannsynligheten for en hendelse er høyere med den nyere enn den eldre modellen minus andel individer som har beregnet sannsynligheten er lavere. RI hos kontrollpersonene ble definert som andel individer som har estimert sannsynlighet er lavere minus andel individer som har beregnet sannsynligheten er høyere. Summen av disse to tiltakene er det NRI, med en asymptotisk fordeling som brukes til å evaluere betydningen [18]. Alle statistiske analyser ble utført ved hjelp av R statistisk programvare versjon 2.15.2. (https://www.r-project.org).
Resultater
Fecal CALB og FOBT
Median CALB konsentrasjonen var betydelig høyere i avføringsprøver fra CRC pasienter enn i de fra friske kontroller (
P
0,001) (figur 1A, 1B og tabell 1). Således kan fecal CALB alene skille mellom CRC-pasienter og friske personer med høy sannsynlighet.
Den humane brystkreftcellelinjen SK-BR-3 ble anvendt som en positiv kontroll for calgranulin B. (B) CALB konsentrasjoner i case (kolorektal kreftpasienter) og kontrollpasienter vises separat for utvikling og validering sett.
Blant pasienter med CRC, nivåene av CALB var ikke forbundet med tumorstadium eller stedet kreft i både utvikling og valideringssett (tabell 1). Men FOBT positivitet raten signifikant høyere hos pasienter med mer enn mindre avanserte kreft etapper i både utviklings- og valideringssett (
P
0,05). (Tabell 1)
Utførelse av prediktive modeller, inkludert fecal markører i diagnostisering av CRC
den øvre delen av tabell 2 viser sensitiviteten på en spesifisitet nærmest 90%, AUC, og pAUC på en spesifisitet på 90% -100% i utviklingen satt og bias-korrigerte verdiene av disse tiltakene via intern validering ved hjelp LOOCV. På en spesifisitet på 90,2%, følsomheten til modellen ved hjelp FOBT alene var 75,31%, AUC var 89,52% (95% KI 84,19% -94,85%) og pAUC var 6,65%. På samme spesifisitet, sensitivitet av modellen som inneholdt både FOBT og CALB var 83,95%, AUC var 92,05% (95% CI 87,59% -95,50%) og pAUC var 7,02%, med alle forbedret sammenlignet med modellen kun ved hjelp av FOBT. Ved å følge biaskorrigert via LOOCV, sensitiviteten (82,72% mot 75,31%), AUC (89,81% [95% CI 84,02% -95,60%] versus 87,78%), og pAUC (5,70% vs. 5,62%) var høyere for modellen som inkluderte både FOBT og CALB enn for den modellen som inkluderte bare FOBT. Forestillinger av disse modellene på uavhengig validering sett er oppsummert i bunnen panel av tabell 2, med alle resultatene tett tilpasset de estimerte verdier etter LOOCV.
Den inkrementelle fordelen av CALB ble formelt testet av evaluering av økning i AUC [19]. P-verdien av økningen i AUC fra modellen med FOBT alene til modellen med både CALB og FOBT var 0,0499 (figur 2), noe som tyder på at å legge CALB til en modell som inkluderte FOBT betydelig forbedret AUC. Tilsvarende p-verdier for RI i CRC pasienter og kontroller fra modellen ved hjelp FOBT alene til modellen med både CALB og FOBT var 0,0013 og 0,0173, henholdsvis, og p-verdi på NRI var 0,0001. Alle disse funnene tyder på at tilsetning av CALB til modellen resulterte i en statistisk signifikant forbedring i omklassifisering.
Den endelige modellen ble så passer for hele datasettet, som omfattet både utvikling og validering datasett, for å øke nøyaktigheten. ROC, AUC, pAUC, og sensitivitet ved spesifisiteten som ligger nærmest 90% er presentert i figur 3 for de modeller som inkluderer FOBT alene og FOBT pluss CALB. Modellen av FOBT hadde alene en AUC på 92,82% (95% CI 90,05% -95,58%), en pAUC på 7,48%, og en sensitivitet på 80,57% ved spesifisiteten nærmest 90%. Den endelige modellen bestod av følgende ligning for å forutsi sannsynligheten for tykktarmskreft: Her
R (CALB)
er en rangering forvandlet verdi, noe som gjør det til en relativt mål. Rang verdier av CALB som kan brukes som innspill til denne ligningen er presentert i tabell S1. For eksempel, hvis en person har en CALB verdi av 2224 var verdien av
R plakater (CALB) i ligningen er 80. For verdier som ligger mellom to CALB tiltak, en nærmest eller lineær interpolert rang kan brukes.
Diskusjoner
FOBT er et konvensjonelt brukes henvisning fekal screening test. Vi fant at det på høy spesifisitet (90,2%), FOBT alene hadde bare moderat sensitivitet (75,31%) for CRC. Ved vurdering av tilsetnings diagnostisk nøyaktighet av CALB, en ny fecal diagnostisk markør identifisert i vår tidligere studie [7], har vi funnet at ved den samme spesifisitet (90,2%), følsomheten av FOBT + CALB for CRC var høyere (82,72%) . Således, ved høy spesifisitet, så vil kombinasjonen av de to markørene fecal øket følsomheten for CRC deteksjon.
diagnostisk nøyaktighet av FOBT for CRC i den foreliggende studie var lik den som er rapportert tidligere i [9], [20] . I en studie var sensitiviteten for FOBT i asymptomatiske ikke-referert populasjoner var 26% [21], mens en annen studie, som involverer et stort antall pasienter evaluert ved FOBT, rapporterte en sensitivitet på 81% [22]. 80-90% av pasientene med fecal blodtap 20 ml /dag var positive på FOBT, og følsomheten av FOBT korrelert med svingninger i blodtap og forbigående tumor blødning [9]. Disse mønstre av fekal blødning kan forklare den høyere positivitet hastighet i T2, T3 og T4 enn i T1 kreft og antyder at mer avanserte tumorer blør mer konsekvent og i større grad, noe som forbedrer den diagnostiske sensitivitet av FOBT hos pasienter med fremskredne tumorer [9 ]. I motsetning til en annen studie fant at gjennomsnittlig daglig blodtap ble ikke påvirket av tumorstadium, men var assosiert med tumorlokalisering, som daglig blodtap var lavere hos pasienter med venstre enn høyre sided CRC [23]. Likevel våre resultater, sammen med de som tidligere er rapportert [9], [23], tyder på at følsomheten av FOBT for CRC øker med fremskridende kreft stadium, med FOBT positivitet hastigheten være lavere enn i begynnelsen av senere stadier av kreft. Men CALB viste lignende positivitet priser, selv når man sammenligner tidlig og sent stadium svulster. Derfor kan evaluering av CALB kompensere for den lave FOBT positivitet hastighet i tidlige stadier av CRC.
Vi har tidligere rapportert at CALB var en kandidat fecal markør for påvisning av CRC [7]. CALB er en komponent av calprotectin (S100A8 /S100A9), som har vært brukt som en markør for fekal IBD og kolorektale svulster, [9], [24], [25]. CALB skilles ut av intestinale monocytter og epitelceller, og er assosiert med inflammatoriske prosesser, deriblant IBD alvorlighetsgrad [8], [11]. Interessant var sensitiviteten for fekal CALB for CRC var høyere enn den til FOBT alene (72,0% vs. 62,3%), selv om spesifisiteten var noe lavere i denne studie, og vårt tidligere studium (77,1% vs. 98,7%) [7]. Flere kontrollpersoner viste falske positive resultater for CALB. Disse pasientene kan ha hatt en funksjonell tarmsykdom, for eksempel irritabel tarmsyndrom uten grov betennelse. Calprotectin, en heterodimer av calgranulin A og calgranulin B, kan være forhøyet hos pasienter med irritabel tarm-syndrom [26] – [28]. Siden individuelle fecal markører ikke kunne helt diskriminere CRC-pasienter fra friske kontroller, testet vi en kombinasjon av to fecal markører.
En kombinasjon test som omfattet tre fekale markører, tissue inhibitor of metalloproteinase-1 (TIMP-1), CALB, og hemoglobin-haptoglobin, var flinkere til å oppdage CRC enn FOBT alene [29]. Videre, en fekal analyse for cyklooksygenase-2 og matriks-metalloproteinase-7 mRNA kan være en lovende screeningstest for CRC [30]. Et konsept lik vår ble påført i eggstokk-kreft, med resultater som viser at en kombinasjon av fire serologiske markører (leptin, prolaktin, osteopontin, og insulin-lignende vekstfaktor-II) hadde høyere sensitivitet og spesifisitet for ovarian cancer enn noen av disse markørene alene [31]. Den inkrementelle fordel for en ny markør i risiko prediksjon kan evalueres ved å analysere økningen i AUC. I fravær av en høy grad av assosiasjon med den nye markøren er imidlertid neppe øke betydelig AUC [32] – [34]. Til tross for denne vanskelighet, og legger CALB til modellen betydelig forbedret dens prediktiv evne, som vist ved den betydelige økningen i AUC. Som et alternativ til økt AUC, anvendte vi nri [18] for å kvantifisere den forbedring i klassifiseringen som følge av bruk av en modell med en ny markør. RI ble først evaluert separat i CRC pasienter og kontroller, og deres kombinasjon (NRI) ble vurdert. P-verdier for RI i pasienter og kontroller fra modell 1 til modell 2 var 0,001 og 0,017, henholdsvis og p-verdien for NRI var 0,0001, noe som indikerer at inkludering av fekal CALB testen resulterte i en statistisk signifikant forbedring i reklassifisering for både pasienter og kontroller. Disse resultatene indikerte at den prediktive evnen av modellen med FOBT alene kan bli vesentlig forbedret ved tilsetning av CALB.
Denne studien hadde flere begrensninger. Først, det antall individer i hver gruppe var forholdsvis liten, mens bare 151 friske kontroller ble inkludert, noe som indikerer behovet for å validere funnene i større antall pasienter. For det andre, innrullert vi pasienter med CRC uten å ta hensyn til symptomer som hematochezia, forstoppelse og melena. Siden screening tester er vanligvis utført i asymptomatiske faser, våre resultater kreve ytterligere validering i asymptomatiske individer. Tredje, the ages av våre CRC og kontrollgrupper signifikant forskjellig. Men vår prognosemodell justert for alder. Til slutt, selv om kombinasjonen av CALB og FOBT kan være mer sensitiv og spesifikk for CRC enn FOBT alene, sensitivitet og spesifisitet av kombinasjonen kan ikke være høy nok sammenlignet med koloskopi. Vår prediksjon modell, men kan være nyttig i situasjoner der koloskopi er tilgjengelig, inkludert i områder uten en klinikk, sykehus eller utdannet personell. Dessuten kan den foreslåtte prediksjon modell basert på avførings markører være nyttig og praktisk for å redusere kostnader og tarm forberedelse.
Derfor ekstra fekal markører kan være nødvendig å øke spesifisitet og sensitivitet av fekal screening for CRC.
i konklusjonen, kan en kombinert analyse av to fecal markører, CALB og FOBT, har større sensitivitet og spesifisitet for CRC enn FOBT alene. Ytterligere valideringer er nødvendig for å bekrefte den kliniske nytten av denne kombinasjonen screening test for CRC.
Hjelpemiddel Informasjon
Figur S1.
Skjematisk av statistisk prediksjon modellen gjennom utviklings- og validerings datasett. Modellen ble først tilpasning til dataene fra utvikling datasettet, etterfulgt av intern validering bruke leave-one-out kryssvalidering (LOOCV) -metoden. LOOCV ytelse ble undersøkt, og modellen ble eksternt validert på valideringsdatasettet. Etter akseptable interne og eksterne valideringer, ble den endelige prediktiv modell for bruk i fremtidige fag utviklet ved hjelp av den totale datasettet, som inkluderte både utviklings- og validerings datasett, ettersom nøyaktigheten av beregninger av effekten av risikofaktorer øker som datasett blir større. I hver av de ovennevnte trinn, ble to modellene vurderes, den første ved hjelp av FOBT alene og den andre inkludert både FOBT og CALB. Fordi det var en ubalanse i alder mellom pasienter og kontroller, alder ble justert for i begge modellene. Modellen resultatene ble evaluert ved mottakeren driftskurve (ROC) analyse, fulgt av beregning av området under ROC-kurven (AUC) og den partielle arealet under kurven ROC (pAUC) svarende til en spesifisitet 0,9. I LOOCV, ble en prøve satt til side (testing), og den logiske modellen var passe til de resterende prøvene (trening). Basert på denne anslagsmodell, ble sannsynligheten for CRC i en prøve som ikke brukes i modellutvikling (testprøve) beregnet. Dessuten ble det cutoff for predikerte sannsynlighet som svarer til en spesifisitet på 90% utvalgt, etterfulgt av prediksjon av hvorvidt testprøven var positiv eller negativ for CRC. Denne prosedyren ble gjentatt et antall ganger som tilsvarer antallet av prøver i datasettet, slik at alle prøver tjente som en testprøve nøyaktig en gang. Kryss validert følsomhet ble deretter bestemt for spesifisitet nærmest 90%, og en cross-validert ROC kurve ble generert
doi:. 10,1371 /journal.pone.0106182.s001 plakater (TIF)
Table S1.
optisk tetthet av calgranulin B og tilsvarende rang
doi:. 10,1371 /journal.pone.0106182.s002 plakater (docx)
